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ANALYSE DES PROBIOTIQUES PAR SEQUENCAGE DE TRISIEME GENERATION: NANOPORE OXFORD / BENZAKOUR SALMA
Titre : ANALYSE DES PROBIOTIQUES PAR SEQUENCAGE DE TRISIEME GENERATION: NANOPORE OXFORD Type de document : thèse Auteurs : BENZAKOUR SALMA, Auteur Année de publication : 2024 Langues : Français (fre) Mots-clés : Haute précision Identification moléculaire Oxford Nanopore Probiotiques Séquençage de nouvelle génération (NGS) Technologie MinION High precision Molecular identification Oxford Nanopore Probiotics Next Generation Sequencing (NGS) MinION technology الدقة العالية التحديد الجزيئي أكسفورد نانوبور البروبيوتيك تسلسل الجيل التالي ) NGS ( تقنية
MinIONRésumé : Les probiotiques sont des micro-organismes vivants administrés à l'organisme en quantités suffisantes afin d'offrir des avantages pour la santé. Leur étude permet de mieux comprendre leurs fonctions, leurs mécanismes et leurs applications. Au cours de ce travail, les kits BIOLINE et MagPurix ont été utilisés pour extraire l’ADNg à partir des échantillons de probiotiques commercialisés. Le NanoDrop™ a été utilisé ensuite pour quantifier l’ADN extrait. Les résultats obtenus ont été vérifier avec un dosage par Qubit. Les espèces présentes dans les échantillons ont toutes été identifiées par séquençage à l'aide de la technologie MinION (Oxford Nanopore Technology).
La technologie MinION a démontré un haut degré de précision et de rapidité dans l'identification moléculaire. Le séquençage de troisième génération a été utilisé pour confirmer l'existence des espèces suggérées dans les échantillons en raison de sa capacité à identifier chaque espèce dans un échantillon. Parmi ces espèces, Weizmannia coagulans s'est avérée répandue dans les échantillons. Les résultats démontrent également que des facteurs tels que la contamination, l'ADN de mauvaise qualité et la mauvaise préparation des échantillons peuvent avoir un impact sur la sensibilité et la précision du MinION en matière d'identification des espèces, puisque le séquençage n'a pas permis de valider définitivement l'existence des espèces proposées dans un échantillon.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0162024 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : EL FAHIME Elmostafa Juge : LOUATI Sara ANALYSE DES PROBIOTIQUES PAR SEQUENCAGE DE TRISIEME GENERATION: NANOPORE OXFORD [thèse] / BENZAKOUR SALMA, Auteur . - 2024.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Haute précision Identification moléculaire Oxford Nanopore Probiotiques Séquençage de nouvelle génération (NGS) Technologie MinION High precision Molecular identification Oxford Nanopore Probiotics Next Generation Sequencing (NGS) MinION technology الدقة العالية التحديد الجزيئي أكسفورد نانوبور البروبيوتيك تسلسل الجيل التالي ) NGS ( تقنية
MinIONRésumé : Les probiotiques sont des micro-organismes vivants administrés à l'organisme en quantités suffisantes afin d'offrir des avantages pour la santé. Leur étude permet de mieux comprendre leurs fonctions, leurs mécanismes et leurs applications. Au cours de ce travail, les kits BIOLINE et MagPurix ont été utilisés pour extraire l’ADNg à partir des échantillons de probiotiques commercialisés. Le NanoDrop™ a été utilisé ensuite pour quantifier l’ADN extrait. Les résultats obtenus ont été vérifier avec un dosage par Qubit. Les espèces présentes dans les échantillons ont toutes été identifiées par séquençage à l'aide de la technologie MinION (Oxford Nanopore Technology).
La technologie MinION a démontré un haut degré de précision et de rapidité dans l'identification moléculaire. Le séquençage de troisième génération a été utilisé pour confirmer l'existence des espèces suggérées dans les échantillons en raison de sa capacité à identifier chaque espèce dans un échantillon. Parmi ces espèces, Weizmannia coagulans s'est avérée répandue dans les échantillons. Les résultats démontrent également que des facteurs tels que la contamination, l'ADN de mauvaise qualité et la mauvaise préparation des échantillons peuvent avoir un impact sur la sensibilité et la précision du MinION en matière d'identification des espèces, puisque le séquençage n'a pas permis de valider définitivement l'existence des espèces proposées dans un échantillon.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0162024 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : EL FAHIME Elmostafa Juge : LOUATI Sara Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0162024 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2024 Disponible INTÉRÊT THÉRAPEUTIQUE DES PROBIOTIQUES DANS LES PATHOLOGIES GASTRO-INTESTINALES ET MÉTABOLIQUES / BIBIH SOUHAIL
Titre : INTÉRÊT THÉRAPEUTIQUE DES PROBIOTIQUES DANS LES PATHOLOGIES GASTRO-INTESTINALES ET MÉTABOLIQUES Type de document : thèse Auteurs : BIBIH SOUHAIL, Auteur Année de publication : 2023 Langues : Français (fre) Mots-clés : Probiotique Dysbiose Microbiote Maladie gastro-intestinale/métabolique Probiotics Dysbiosis Microbiota Gastrointestinal/metabolic disease المعززات الحيوية اختلال التوازن البكتيري النبيت الجرثومي المعوي أمراض الجهاز الهضمي/التمثيل الغذائي Résumé : Les probiotiques présentent un intérêt thérapeutique majeur dans le traitement des pathologies gastro-intestinales et métaboliques. Ces micro-organismes vivants, le plus souvent des bactéries, peuvent avoir un impact significatif sur la santé en ramenant le microbiote intestinal en dysbiose à son état d´équilibre.
L'une de leurs applications les plus courantes concerne la prévention et le traitement des épisodes diarrhéiques. Dans le cas du syndrome du côlon irritable, les probiotiques peuvent atténuer les symptômes tels que les douleurs abdominales et les troubles du transit intestinal. Dans les maladies inflammatoires chroniques telles que la maladie de Crohn et la colite ulcéreuse, ils peuvent moduler la réponse immunitaire et réduire l'inflammation, contribuant ainsi à maintenir la rémission. En outre, ils peuvent être utilisés comme coadjuvants dans le traitement des troubles métaboliques, y compris l'obésité et le syndrome métabolique, et enfin, dans la prévention du cancer colorectal.
Toutefois, il convient de noter que l´efficacité des probiotiques varie en fonction de la souche, de la dose, de la quantité et de la durée d'administration. Il est donc essentiel de consulter un professionnel de santé pour déterminer le traitement probiotique approprié.
En conclusion, les probiotiques offrent un potentiel thérapeutique prometteur dans le traitement des pathologies gastro-intestinales et métaboliques via différents mécanismes dont le rétablissement de l´eubiose, le renforcement de la barrière intestinale, la modulation de l'inflammation et la production des métabolites bénéfiques.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P1112023 Président : Mimoun ZOUHDI Directeur : Yassine SEKHSOKH Juge : Ahmed GAOUZI Juge : Saida TELLAL INTÉRÊT THÉRAPEUTIQUE DES PROBIOTIQUES DANS LES PATHOLOGIES GASTRO-INTESTINALES ET MÉTABOLIQUES [thèse] / BIBIH SOUHAIL, Auteur . - 2023.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Probiotique Dysbiose Microbiote Maladie gastro-intestinale/métabolique Probiotics Dysbiosis Microbiota Gastrointestinal/metabolic disease المعززات الحيوية اختلال التوازن البكتيري النبيت الجرثومي المعوي أمراض الجهاز الهضمي/التمثيل الغذائي Résumé : Les probiotiques présentent un intérêt thérapeutique majeur dans le traitement des pathologies gastro-intestinales et métaboliques. Ces micro-organismes vivants, le plus souvent des bactéries, peuvent avoir un impact significatif sur la santé en ramenant le microbiote intestinal en dysbiose à son état d´équilibre.
L'une de leurs applications les plus courantes concerne la prévention et le traitement des épisodes diarrhéiques. Dans le cas du syndrome du côlon irritable, les probiotiques peuvent atténuer les symptômes tels que les douleurs abdominales et les troubles du transit intestinal. Dans les maladies inflammatoires chroniques telles que la maladie de Crohn et la colite ulcéreuse, ils peuvent moduler la réponse immunitaire et réduire l'inflammation, contribuant ainsi à maintenir la rémission. En outre, ils peuvent être utilisés comme coadjuvants dans le traitement des troubles métaboliques, y compris l'obésité et le syndrome métabolique, et enfin, dans la prévention du cancer colorectal.
Toutefois, il convient de noter que l´efficacité des probiotiques varie en fonction de la souche, de la dose, de la quantité et de la durée d'administration. Il est donc essentiel de consulter un professionnel de santé pour déterminer le traitement probiotique approprié.
En conclusion, les probiotiques offrent un potentiel thérapeutique prometteur dans le traitement des pathologies gastro-intestinales et métaboliques via différents mécanismes dont le rétablissement de l´eubiose, le renforcement de la barrière intestinale, la modulation de l'inflammation et la production des métabolites bénéfiques.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P1112023 Président : Mimoun ZOUHDI Directeur : Yassine SEKHSOKH Juge : Ahmed GAOUZI Juge : Saida TELLAL Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité P1112023 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2023 Disponible