| Titre : | HOST TRANSCRIPTOMIC PROFILING OF COVID-19 PATIENTS | | Type de document : | thèse | | Auteurs : | BEGHDI Yasmine, Auteur | | Année de publication : | 2021 | | Langues : | Anglais (eng) | | Mots-clés : | SARS-CoV-2 statut d'infectiosité expression génique différentielle analyse d'enrichissement génique analyse de surreprésentation | | Résumé : | Le séquençage de l'ARN est la technique la plus puissante et la plus adaptable pour mesurer les niveaux d'expression génique et permettre la comparaison entre les conditions biologiques. En mars 2020, une pandémie a été déclarée, identifiant le SRAS-CoV-2 (syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2) comme étant l'agent causal. Néanmoins, les facteurs de progression et de gravité ne sont toujours pas divulgués. Pour comprendre comment notre système immunitaire réagit à cette infection virale, On a mené une analyse sur les transcriptomes de la communauté Ischgl (Autriche) à l'aide de données accessibles au public du NCBI. Une analyse des séquences d'ARN extrait à partir des cellules mononucléées du sang périphérique a été réalisée pour comprendre quels gènes sont exprimés de manière différentielle chez les patients présentant le statut d'infectiosité suivant : séropositif asymptomatique vs léger, séronégatif fortement exposé vs léger et séropositif asymptomatique vs séronégatif fortement exposé. En outre, ces gènes ont été utilisés pour l'Analyse d'Enrichissement de l'Ensemble de Gènes (GSEA) et l'Analyse de Surreprésentation (ORA) afin d'identifier les processus biologiques affectés. | | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | MM0112021 | | Président : | OUADGHIRI Mouna | | Directeur : | GHAZAL Hassan | | Juge : | ALLALI Imane | | Juge : | GABOUN Fatima | | Juge : | HMAMOUCH Noureddine |
HOST TRANSCRIPTOMIC PROFILING OF COVID-19 PATIENTS [thèse] / BEGHDI Yasmine, Auteur . - 2021. Langues : Anglais ( eng) | Mots-clés : | SARS-CoV-2 statut d'infectiosité expression génique différentielle analyse d'enrichissement génique analyse de surreprésentation | | Résumé : | Le séquençage de l'ARN est la technique la plus puissante et la plus adaptable pour mesurer les niveaux d'expression génique et permettre la comparaison entre les conditions biologiques. En mars 2020, une pandémie a été déclarée, identifiant le SRAS-CoV-2 (syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2) comme étant l'agent causal. Néanmoins, les facteurs de progression et de gravité ne sont toujours pas divulgués. Pour comprendre comment notre système immunitaire réagit à cette infection virale, On a mené une analyse sur les transcriptomes de la communauté Ischgl (Autriche) à l'aide de données accessibles au public du NCBI. Une analyse des séquences d'ARN extrait à partir des cellules mononucléées du sang périphérique a été réalisée pour comprendre quels gènes sont exprimés de manière différentielle chez les patients présentant le statut d'infectiosité suivant : séropositif asymptomatique vs léger, séronégatif fortement exposé vs léger et séropositif asymptomatique vs séronégatif fortement exposé. En outre, ces gènes ont été utilisés pour l'Analyse d'Enrichissement de l'Ensemble de Gènes (GSEA) et l'Analyse de Surreprésentation (ORA) afin d'identifier les processus biologiques affectés. | | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | MM0112021 | | Président : | OUADGHIRI Mouna | | Directeur : | GHAZAL Hassan | | Juge : | ALLALI Imane | | Juge : | GABOUN Fatima | | Juge : | HMAMOUCH Noureddine |
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