| Titre : | DÉTECTION DES MUTATIONS GÉNÉTIQUES DU GÈNE EGFR PAR SÉQUANCAGE D'EXOME COMPLET DANS LE CANCER BRONCHIQUE NON À PETITES CELLULES | | Type de document : | thèse | | Auteurs : | HOUARI HOUDA, Auteur | | Année de publication : | 2024 | | Langues : | Français (fre) | | Mots-clés : | Cancer de poumon CBNPC EGFR variants WES médecine de précision Lung cancer NSCLC EGFR variants WES precision medicine سرطان الرئة، سرطان الرئة غير صغير الخلايا الرئوية عامل النمو الجيني المتغيرات تسلسل الأكسوم الكامل،
الطب الدقيق | | Résumé : | Le cancer broncho-pulmonaire, particulièrement le cancer bronchique non à petite cellule (CBNPC), est la principale cause de décès liés au cancer dans le monde entier en raison de son diagnostic tardif et de sa progression précoce. La découverte des altérations moléculaires, dites actionnables par des thérapies ciblées et autres prédictifs du pronostic, a révolutionné la prise en charge de ce cancer. Jusqu’au date, les profils moléculaires mutationnelles des patients marocains ayant un CBNPC reste inconnus, et la majorité des études marocaines génétiques ont été menées sur des gènes spécifiques, en se focalisant sur la prédisposition au cancer.
L’objectif de ce travail est de déterminer la fréquence des profils moléculaires des CBNPC diagnostiqués en utilisant le séquençage d’exome complet par NGS. Dans ce sens, 10 patients ont été recrutés dans notre étude. Les extractions ont été faites à partir des tissus fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE) et le séquençage a été réalisé par le kit AllPrep DNA/RNA FFPE. Les données obtenues ont été analysées par des outils bio-informatiques pour identifier les variations génétiques localisés au niveau de l’EGFR.
L’âge moyenne de cette étude était 69,7ans, avec un sex-ratio homme femme de 4 :1. Les résultats du séquençage ont révélé un taux des mutations EGFR de 70% (7/10 patients). La répartition des mutations au niveau des différents exon EGFR a démontré que trois patients avaient des mutations au niveau des exons 1, 8, 17 et 23, deux patients au niveau des exons 3, 11 et 12, alors que les mutations touchant les exons 2, 6, 7, 14, 18, 19, 20, 21, 24, 26 et 28 ont été détectées chacune chez un patient. En outre ; 6,3% des mutations ont été répertoriées comme pathogénique. Fait intéressant, la totalité de ces mutations détectées sont des mutations classées rares dans la littérature.
Notre étude a révélé les défis associés aux mutations rares de l’EGFR, qui peuvent nécessiter des stratégies de traitement alternatives pour améliorer la prise en charge des patients. Ainsi, la dynamique moléculaire est envisagée afin de détecter l’effet de la mutation sur la protéine EGFR et sa fonction. Das les pays où la recherche d’altérations moléculaire est encore are comme le Maroc, notre étude demeure d’un grand intérêt scientifique et clinique d’autant plus que nous utilisons le séquençage de l’exome entier, ce qui permettra d’établir le profil mutationnel spécifique de la population marocaine et ouvrir les opportunités vers une prise en charge personnalisée des patients marocains atteints du CBNPC.
| | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | MM0272024 | | Président : | OUADGHIRI Mouna | | Directeur : | KHYATTI Meriem | | Juge : | GIHBID Amina | | Juge : | LOUATI Sara |
DÉTECTION DES MUTATIONS GÉNÉTIQUES DU GÈNE EGFR PAR SÉQUANCAGE D'EXOME COMPLET DANS LE CANCER BRONCHIQUE NON À PETITES CELLULES [thèse] / HOUARI HOUDA, Auteur . - 2024. Langues : Français ( fre) | Mots-clés : | Cancer de poumon CBNPC EGFR variants WES médecine de précision Lung cancer NSCLC EGFR variants WES precision medicine سرطان الرئة، سرطان الرئة غير صغير الخلايا الرئوية عامل النمو الجيني المتغيرات تسلسل الأكسوم الكامل،
الطب الدقيق | | Résumé : | Le cancer broncho-pulmonaire, particulièrement le cancer bronchique non à petite cellule (CBNPC), est la principale cause de décès liés au cancer dans le monde entier en raison de son diagnostic tardif et de sa progression précoce. La découverte des altérations moléculaires, dites actionnables par des thérapies ciblées et autres prédictifs du pronostic, a révolutionné la prise en charge de ce cancer. Jusqu’au date, les profils moléculaires mutationnelles des patients marocains ayant un CBNPC reste inconnus, et la majorité des études marocaines génétiques ont été menées sur des gènes spécifiques, en se focalisant sur la prédisposition au cancer.
L’objectif de ce travail est de déterminer la fréquence des profils moléculaires des CBNPC diagnostiqués en utilisant le séquençage d’exome complet par NGS. Dans ce sens, 10 patients ont été recrutés dans notre étude. Les extractions ont été faites à partir des tissus fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE) et le séquençage a été réalisé par le kit AllPrep DNA/RNA FFPE. Les données obtenues ont été analysées par des outils bio-informatiques pour identifier les variations génétiques localisés au niveau de l’EGFR.
L’âge moyenne de cette étude était 69,7ans, avec un sex-ratio homme femme de 4 :1. Les résultats du séquençage ont révélé un taux des mutations EGFR de 70% (7/10 patients). La répartition des mutations au niveau des différents exon EGFR a démontré que trois patients avaient des mutations au niveau des exons 1, 8, 17 et 23, deux patients au niveau des exons 3, 11 et 12, alors que les mutations touchant les exons 2, 6, 7, 14, 18, 19, 20, 21, 24, 26 et 28 ont été détectées chacune chez un patient. En outre ; 6,3% des mutations ont été répertoriées comme pathogénique. Fait intéressant, la totalité de ces mutations détectées sont des mutations classées rares dans la littérature.
Notre étude a révélé les défis associés aux mutations rares de l’EGFR, qui peuvent nécessiter des stratégies de traitement alternatives pour améliorer la prise en charge des patients. Ainsi, la dynamique moléculaire est envisagée afin de détecter l’effet de la mutation sur la protéine EGFR et sa fonction. Das les pays où la recherche d’altérations moléculaire est encore are comme le Maroc, notre étude demeure d’un grand intérêt scientifique et clinique d’autant plus que nous utilisons le séquençage de l’exome entier, ce qui permettra d’établir le profil mutationnel spécifique de la population marocaine et ouvrir les opportunités vers une prise en charge personnalisée des patients marocains atteints du CBNPC.
| | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | MM0272024 | | Président : | OUADGHIRI Mouna | | Directeur : | KHYATTI Meriem | | Juge : | GIHBID Amina | | Juge : | LOUATI Sara |
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