| Titre : | INHIBITION DU QUORUM SENSING CHEZ HELICOBACTER PYLORI PAR APPROCHE IN SILICO | | Type de document : | thèse | | Auteurs : | WAKRIM Hajar, Auteur | | Année de publication : | 2021 | | Langues : | Français (fre) | | Mots-clés : | Hélicobactere pylori Quorum sensing TLPB LUXS Modeller Docking moléculaire Autodock vina | | Résumé : | Le quorum sensing (QS) permet aux bactéries d'organiser leurs activités au niveau de la population. Il a été démontré que certaines petites molécules, connus sous le nom d'inhibiteurs de détection de quorum (QSI), bloquent efficacement le QS et atténuent par la suite la virulence bactérienne. Dans cette étude, une approche de criblage virtuel basé sur la structure (SBVS) a été utilisée pour la découverte de nouveaux candidats QSI chez hélicobacter pylori. Pour ce faire nous avons ciblé le blocage de l’activité de LUXS et TLPB, deux protéines clés de quorum sensing chez ladite bactérie. Nous avons réalisé le repositionnement de 190 médicaments en plus d’un criblage d’une base de données de 400 molécules d’origine naturelles, d’une base de données de molécules chimiques ‘Mcule’ (10000 molécules) et de 10 dérivés synthétiques. Le docking moléculaire a été réalisé via Autodock Vina, les règles de lipinski ont été vérifiées et le test de toxicité a été évalué pour les ligands ayant donnés les meilleures affinités.
Au total, 23 molécules ayant montré des meilleures affinités (entre -7,0 et -6,1 kcal/mol) envers LUXS par rapport à son ligand naturel, méthionine (-3,9 kcal/mol). Ces ligands incluent 9 médicaments, 2 molécules d’origine naturelle, 9 molécules extraites de la base de données Mcule et 3 dérivés synthétiques. En parallèle, 30 molécules ont été retenues pour leurs fortes affinités (entre -10,0 et -8,0) envers TLPB, à savoir 17 médicaments, 2 molécules d’origine naturelle, 7 molécules extraites de la base de données Mcule en plus de 4 dérivés synthétiques. | | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | MM0452021 | | Président : | OUADGHIIR Mouna | | Directeur : | AANNIZ Tarik | | Juge : | KANDOUSSI Ilham |
INHIBITION DU QUORUM SENSING CHEZ HELICOBACTER PYLORI PAR APPROCHE IN SILICO [thèse] / WAKRIM Hajar, Auteur . - 2021. Langues : Français ( fre) | Mots-clés : | Hélicobactere pylori Quorum sensing TLPB LUXS Modeller Docking moléculaire Autodock vina | | Résumé : | Le quorum sensing (QS) permet aux bactéries d'organiser leurs activités au niveau de la population. Il a été démontré que certaines petites molécules, connus sous le nom d'inhibiteurs de détection de quorum (QSI), bloquent efficacement le QS et atténuent par la suite la virulence bactérienne. Dans cette étude, une approche de criblage virtuel basé sur la structure (SBVS) a été utilisée pour la découverte de nouveaux candidats QSI chez hélicobacter pylori. Pour ce faire nous avons ciblé le blocage de l’activité de LUXS et TLPB, deux protéines clés de quorum sensing chez ladite bactérie. Nous avons réalisé le repositionnement de 190 médicaments en plus d’un criblage d’une base de données de 400 molécules d’origine naturelles, d’une base de données de molécules chimiques ‘Mcule’ (10000 molécules) et de 10 dérivés synthétiques. Le docking moléculaire a été réalisé via Autodock Vina, les règles de lipinski ont été vérifiées et le test de toxicité a été évalué pour les ligands ayant donnés les meilleures affinités.
Au total, 23 molécules ayant montré des meilleures affinités (entre -7,0 et -6,1 kcal/mol) envers LUXS par rapport à son ligand naturel, méthionine (-3,9 kcal/mol). Ces ligands incluent 9 médicaments, 2 molécules d’origine naturelle, 9 molécules extraites de la base de données Mcule et 3 dérivés synthétiques. En parallèle, 30 molécules ont été retenues pour leurs fortes affinités (entre -10,0 et -8,0) envers TLPB, à savoir 17 médicaments, 2 molécules d’origine naturelle, 7 molécules extraites de la base de données Mcule en plus de 4 dérivés synthétiques. | | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | MM0452021 | | Président : | OUADGHIIR Mouna | | Directeur : | AANNIZ Tarik | | Juge : | KANDOUSSI Ilham |
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