| Titre : | ANALYSE GENETIQUE DU ROTAVIRUS GROUPE A ISOLES CHEZ L’HOMME, LES BOVINS ET LES CAPRINS AU MAROC PROUVE L'EMERGENCE DE NOUVEAUX GENOTYPES HUMAINS : PREUVES DE TRANSMISSION INTER ESPECES DES GENES DU ROTAVIRUS | | Type de document : | thèse | | Auteurs : | ALAOUI AMINE Sanaâ, Auteur | | Année de publication : | 2021 | | Langues : | Français (fre) | | Mots-clés : | Rotavirus groupe A Analyse phylogénétique Réassortiment Transmission inter
espèces Population nomade Marocaine انز رٔفٛز صٔ يج ػًٕخ أ، انزحهٛم انجٛ ُٙ، إػبدح انفزس، الا زَمبل ثٛ الأ إَع انسكب انزحم Rotavirus group A Phylogenetic analysis Reassortment Inter-species
transmission Moroccan nomadic population.
ان غًبرثخ | | Résumé : | Le rotavirus est l’agent pathogène le plus fréquent des gastro-entérites de l’enfant de moins de 2 ans dans le monde, il est également responsable d’une morbidité et d’une mortalité importante chez les jeunes animaux d’espèces différentes.
Les rotavirus sont généralement spécifiques à une espèce, mais la transmission inter-espèces est possible. La surveillance des rotavirus en circulation dans la population humaine a révélé la présence de plusieurs génotypes peu communs.
C’est dans ce contexte que le présent travail fourni, pour la première fois, d’une part des données génétiques sur le génome complet de trois souches marocaines de rotavirus groupe A (RVA) d’origine animale et humaine avec établissement de leur constellation complète et leur phylogénie moléculaire. D’autre part, ce travail examine le potentiel de transmission zoonotique des rotavirus dans une perspective marocaine.
La première partie de ce travail rapporte le séquençage complet du génome d’une souche inhabituelle Marocaine (ma31). L'analyse a révélé la constellation G8-P[14]-I2-R2-C2-M2-A11-N2-T6-E2-H3, présente chez d'autres souches zoonotiques. L'analyse phylogénétique révèle une configuration génétique mixte provenant d'animaux et d'humains, ainsi que son potentiel zoonotique de transmission.
La deuxième partie consiste à identifier le RVA chez des chèvres et des veaux de nomades lors de deux épidémies de diarrhée sévère survenues en 2012 et 2014 à Bouaarfa. La caractérisation de la constellation génomique complète de deux souches bovines et caprines (S18 et S19) a permis d’établir leur parenté génétique avec la souche humaine Marocaine ma31. L’analyse phylogénétique a révélé une similarité partagée avec des souches d’origine animale et humaine. Nos résultats ont révélé des cas de transmission zoonotique et confirmé le risque d'émergence de nouveaux génotypes dans les régions nomades. | | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | D0202021 | | Président : | Nadia TOUIL | | Directeur : | Elmostafa EL FAHIME | | Juge : | Mostapha EL OUANNAS | | Juge : | Khalid ENNIBI | | Juge : | Mohamed BELLAOUI ; Hassan AGUENAOU |
ANALYSE GENETIQUE DU ROTAVIRUS GROUPE A ISOLES CHEZ L’HOMME, LES BOVINS ET LES CAPRINS AU MAROC PROUVE L'EMERGENCE DE NOUVEAUX GENOTYPES HUMAINS : PREUVES DE TRANSMISSION INTER ESPECES DES GENES DU ROTAVIRUS [thèse] / ALAOUI AMINE Sanaâ, Auteur . - 2021. Langues : Français ( fre) | Mots-clés : | Rotavirus groupe A Analyse phylogénétique Réassortiment Transmission inter
espèces Population nomade Marocaine انز رٔفٛز صٔ يج ػًٕخ أ، انزحهٛم انجٛ ُٙ، إػبدح انفزس، الا زَمبل ثٛ الأ إَع انسكب انزحم Rotavirus group A Phylogenetic analysis Reassortment Inter-species
transmission Moroccan nomadic population.
ان غًبرثخ | | Résumé : | Le rotavirus est l’agent pathogène le plus fréquent des gastro-entérites de l’enfant de moins de 2 ans dans le monde, il est également responsable d’une morbidité et d’une mortalité importante chez les jeunes animaux d’espèces différentes.
Les rotavirus sont généralement spécifiques à une espèce, mais la transmission inter-espèces est possible. La surveillance des rotavirus en circulation dans la population humaine a révélé la présence de plusieurs génotypes peu communs.
C’est dans ce contexte que le présent travail fourni, pour la première fois, d’une part des données génétiques sur le génome complet de trois souches marocaines de rotavirus groupe A (RVA) d’origine animale et humaine avec établissement de leur constellation complète et leur phylogénie moléculaire. D’autre part, ce travail examine le potentiel de transmission zoonotique des rotavirus dans une perspective marocaine.
La première partie de ce travail rapporte le séquençage complet du génome d’une souche inhabituelle Marocaine (ma31). L'analyse a révélé la constellation G8-P[14]-I2-R2-C2-M2-A11-N2-T6-E2-H3, présente chez d'autres souches zoonotiques. L'analyse phylogénétique révèle une configuration génétique mixte provenant d'animaux et d'humains, ainsi que son potentiel zoonotique de transmission.
La deuxième partie consiste à identifier le RVA chez des chèvres et des veaux de nomades lors de deux épidémies de diarrhée sévère survenues en 2012 et 2014 à Bouaarfa. La caractérisation de la constellation génomique complète de deux souches bovines et caprines (S18 et S19) a permis d’établir leur parenté génétique avec la souche humaine Marocaine ma31. L’analyse phylogénétique a révélé une similarité partagée avec des souches d’origine animale et humaine. Nos résultats ont révélé des cas de transmission zoonotique et confirmé le risque d'émergence de nouveaux génotypes dans les régions nomades. | | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | D0202021 | | Président : | Nadia TOUIL | | Directeur : | Elmostafa EL FAHIME | | Juge : | Mostapha EL OUANNAS | | Juge : | Khalid ENNIBI | | Juge : | Mohamed BELLAOUI ; Hassan AGUENAOU |
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