| Titre : | EXPLORATION GENOMIQUE DES FUSARIUM DE BLE | | Type de document : | thèse | | Auteurs : | MESKINE MERYEM, Auteur | | Année de publication : | 2022 | | Langues : | Français (fre) | | Mots-clés : | Fusariose de l’épi Fusarium graminearum gènes de virulence analyse
comparative microsatellite (SSR) mapping SNPs Fusarium head blight F. graminearum virulence genes microsatellite (SSR) mapping SNP | | Résumé : | La fusariose du blé est une maladie fongique causée par un complexe d’espèces de champignons
appartenant aux genres Fusarium. La problématique repose sur la pathogénicité de ces espèces
du genre Fusarium de blé plus exactement Fusarium graminearum qui possède un nombre
important de gènes de virulence induisant la production des mycotoxines ce qui engendre des
problèmes en agriculture et agroalimentaire.
Pour répondre à cette problématique, il est nécessaire de mieux comprendre la biologie des
agents pathogènes pour développer des stratégies de contrôle plus efficaces et durables, en
utilisant les outils bio-informatiques adéquats.
L’étude a porté sur la collecte des séquences nucléotidiques et protéiques des gènes de
virulences qui participent dans la biosynthèse des mycotoxines produites par F. graminearum
et par d’autres espèces fusariums de blé en format ‘Fasta’. Ces données seront utilisées dans
l’alignement multiple via ClustalW et Jalview. Nous réalisons par la suite un arbre
phylogénétique et nous detectant les SSRs des trois espèces (F.graminearum, F.asiaticum,
F.graminearum).
Nous allons effectuer un deuxième travail qui repose sur le mapping génomes des deux souches
PH1 et T10 de l’espèce F.pseudograminearum par rapport au génome de référence
(F.graminearum) pour identifier les SNPs. | | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | MM0422022 | | Président : | AANNIZ Tarik | | Directeur : | GABOUN Fatima | | Juge : | LABHILILI Mustapha | | Juge : | KARTTI Souad |
EXPLORATION GENOMIQUE DES FUSARIUM DE BLE [thèse] / MESKINE MERYEM, Auteur . - 2022. Langues : Français ( fre) | Mots-clés : | Fusariose de l’épi Fusarium graminearum gènes de virulence analyse
comparative microsatellite (SSR) mapping SNPs Fusarium head blight F. graminearum virulence genes microsatellite (SSR) mapping SNP | | Résumé : | La fusariose du blé est une maladie fongique causée par un complexe d’espèces de champignons
appartenant aux genres Fusarium. La problématique repose sur la pathogénicité de ces espèces
du genre Fusarium de blé plus exactement Fusarium graminearum qui possède un nombre
important de gènes de virulence induisant la production des mycotoxines ce qui engendre des
problèmes en agriculture et agroalimentaire.
Pour répondre à cette problématique, il est nécessaire de mieux comprendre la biologie des
agents pathogènes pour développer des stratégies de contrôle plus efficaces et durables, en
utilisant les outils bio-informatiques adéquats.
L’étude a porté sur la collecte des séquences nucléotidiques et protéiques des gènes de
virulences qui participent dans la biosynthèse des mycotoxines produites par F. graminearum
et par d’autres espèces fusariums de blé en format ‘Fasta’. Ces données seront utilisées dans
l’alignement multiple via ClustalW et Jalview. Nous réalisons par la suite un arbre
phylogénétique et nous detectant les SSRs des trois espèces (F.graminearum, F.asiaticum,
F.graminearum).
Nous allons effectuer un deuxième travail qui repose sur le mapping génomes des deux souches
PH1 et T10 de l’espèce F.pseudograminearum par rapport au génome de référence
(F.graminearum) pour identifier les SNPs. | | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | MM0422022 | | Président : | AANNIZ Tarik | | Directeur : | GABOUN Fatima | | Juge : | LABHILILI Mustapha | | Juge : | KARTTI Souad |
|
Accueil
Affiner la recherche Faire une suggestionEXPLORATION GENOMIQUE DES FUSARIUM DE BLE / MESKINE MERYEM
