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CLINICAL AND MOLECULAR STUDY OF THE KRAS GENE IN NOONAN SYNDROME: ABOUT A SERIES OF 54 CASES / EL MAKHZEN Nada
Titre : CLINICAL AND MOLECULAR STUDY OF THE KRAS GENE IN NOONAN SYNDROME: ABOUT A SERIES OF 54 CASES Type de document : thèse Auteurs : EL MAKHZEN Nada, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : Noonan syndrome Kras pulmonary stenosis short stature mental retardation Résumé : Noonan syndrome (NS) is an autosomal dominant genetic disorder. However, most cases are sporadic. It affects 1/1000 - 1/2500 individuals. It is characterized by facial dysmorphia, cardiac malformation, small size, and mental retardation. The diagnosis is essentially clinical. The identified genetic mutations are involved in the RAS / MAPK signal transduction pathway and currently account for 60% of NS cases. The first gene described was PTPN11.
Our report highlighted a study of 54 Moroccan patients with Noonan syndrome and was tested negatively of the PTPN11 gene at the Genetics and Oncogenetics Unit of the Hassan II University Hospital Center in Fez. 90% of our cohort, occurred sporadically and only in 10%, there was the first degree of consanguinity. The manifestations that led to the diagnosis were characteristic facies in 100% of cases, cardiopathy of pulmonary stenosis type in 61% of cases, cryptorchidism in 5%, short stature in 36%, and mental retardation in 20% of cases.
In the light of these clinical observations, our study focused on looking for mutations in exons 2 and 3 of the Kras gene by simplex PCR followed by sanger sequencing for our cohort. This study revealed the absence of mutations in exons 2 and 3 of the Kras gene in our cohort.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0232021 Président : IBRAHIMI Azeddine Directeur : BOUGUENOUCH Laila ; ABBASSI Meriame Co-Supervisor CLINICAL AND MOLECULAR STUDY OF THE KRAS GENE IN NOONAN SYNDROME: ABOUT A SERIES OF 54 CASES [thèse] / EL MAKHZEN Nada, Auteur . - 2021.
Langues : Anglais (eng)
Mots-clés : Noonan syndrome Kras pulmonary stenosis short stature mental retardation Résumé : Noonan syndrome (NS) is an autosomal dominant genetic disorder. However, most cases are sporadic. It affects 1/1000 - 1/2500 individuals. It is characterized by facial dysmorphia, cardiac malformation, small size, and mental retardation. The diagnosis is essentially clinical. The identified genetic mutations are involved in the RAS / MAPK signal transduction pathway and currently account for 60% of NS cases. The first gene described was PTPN11.
Our report highlighted a study of 54 Moroccan patients with Noonan syndrome and was tested negatively of the PTPN11 gene at the Genetics and Oncogenetics Unit of the Hassan II University Hospital Center in Fez. 90% of our cohort, occurred sporadically and only in 10%, there was the first degree of consanguinity. The manifestations that led to the diagnosis were characteristic facies in 100% of cases, cardiopathy of pulmonary stenosis type in 61% of cases, cryptorchidism in 5%, short stature in 36%, and mental retardation in 20% of cases.
In the light of these clinical observations, our study focused on looking for mutations in exons 2 and 3 of the Kras gene by simplex PCR followed by sanger sequencing for our cohort. This study revealed the absence of mutations in exons 2 and 3 of the Kras gene in our cohort.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0232021 Président : IBRAHIMI Azeddine Directeur : BOUGUENOUCH Laila ; ABBASSI Meriame Co-Supervisor Réservation
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MM0232021URL IMPLICATION DES GENES KRAS, NRAS ET BRAF DANS LE CANCER COLORECTAL METASTATIQUE / TIGANA Sofia dite Safiatou
Titre : IMPLICATION DES GENES KRAS, NRAS ET BRAF DANS LE CANCER COLORECTAL METASTATIQUE Type de document : thèse Auteurs : TIGANA Sofia dite Safiatou, Auteur Année de publication : 2020 Langues : Français (fre) Mots-clés : Cancer colorectal métastatique KRAS NRAS BRAF Maroc Résumé : Introduction: Le statut RAS/BRAF est un biomarqueur prédictif de la réponse aux anti-EGFR dans
le cancer colorectal métastatique (CCRm). La technologie Idylla (TI) est un système de test
moléculaire entièrement automatisé, basé sur la PCR en temps réel et permet d’obtenir des résultats
rapidement pour un temps de préparation très court.
Objectif: Evaluer le statut mutationnel full RAS et BRAF chez les patients marocains atteints de
CCRm.
Matériel et méthodes: Les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE), obtenus entre
février et juin 2020, ont été analysés à l'aide de la TI. Le pourcentage de cellules tumorales minimal
était de 10%, après contrôle morphologique. 1 à 5 coupes de 5 microns étaient prélevées via un
microtome dédié et insérées directement dans la cartouche Idylla.
Résultats: 40 échantillons de CCRm ont fait l’objet d’une recherche de mutation RAS/BRAF, 8
(20%) n’ont pas pu être traités pour insuffisance de matériel tumoral. Au total, 32 patients ont été
inclus dans cette étude, 46,88% étaient des femmes et 53,12%des hommes, l'âge moyen étant de
54,81ans avec des extrêmes allant de 23 à 78 ans. Tous nos patients ont été diagnostiqués pour un
adénocarcinome (ADK). 53,12 % des tumeurs étaient des mutants KRAS et la majorité des
mutations se traduisait par une substitution d’acide aminé glycine par l’acide aspartique. Les
mutations dominantes sont les transversions G>T (42,3%) et les transitions G>A (41,3%). En
revanche, les mutations NRAS ont été détectées chez une patiente. Quant au gène BRAF, seulement
2 patients étaient porteurs de la mutation V600E. Aucune relation statistiquement significative entre
les caractéristiques des patients atteints de CCRm et les mutations KRAS/NRAS/BRAF n'a été
trouvée.
Discussion et conclusion: Plusieurs études ont montré que les tests de mutations RAS/BRAF
Idylla™ peuvent être appliqués comme outils de routine sans nécessiter d'infrastructure ou
d'expertise moléculaire, pour guider le traitement personnalisé des patients atteints de CCR. Nos
résultats suggèrent que les mutations KRAS sont plus fréquentes chez les patients marocains atteints
de CCRm, ce qui est en accord avec les études antérieures. D'autres études, portant sur un plus
grand nombre de patients atteints de CCRm, sont recommandées pour confirmer nos résultats.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0722020 Président : IBRAHIMI Azeddine Directeur : AANNIZ Tarik Juge : OUADGHIRI Mouna IMPLICATION DES GENES KRAS, NRAS ET BRAF DANS LE CANCER COLORECTAL METASTATIQUE [thèse] / TIGANA Sofia dite Safiatou, Auteur . - 2020.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Cancer colorectal métastatique KRAS NRAS BRAF Maroc Résumé : Introduction: Le statut RAS/BRAF est un biomarqueur prédictif de la réponse aux anti-EGFR dans
le cancer colorectal métastatique (CCRm). La technologie Idylla (TI) est un système de test
moléculaire entièrement automatisé, basé sur la PCR en temps réel et permet d’obtenir des résultats
rapidement pour un temps de préparation très court.
Objectif: Evaluer le statut mutationnel full RAS et BRAF chez les patients marocains atteints de
CCRm.
Matériel et méthodes: Les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE), obtenus entre
février et juin 2020, ont été analysés à l'aide de la TI. Le pourcentage de cellules tumorales minimal
était de 10%, après contrôle morphologique. 1 à 5 coupes de 5 microns étaient prélevées via un
microtome dédié et insérées directement dans la cartouche Idylla.
Résultats: 40 échantillons de CCRm ont fait l’objet d’une recherche de mutation RAS/BRAF, 8
(20%) n’ont pas pu être traités pour insuffisance de matériel tumoral. Au total, 32 patients ont été
inclus dans cette étude, 46,88% étaient des femmes et 53,12%des hommes, l'âge moyen étant de
54,81ans avec des extrêmes allant de 23 à 78 ans. Tous nos patients ont été diagnostiqués pour un
adénocarcinome (ADK). 53,12 % des tumeurs étaient des mutants KRAS et la majorité des
mutations se traduisait par une substitution d’acide aminé glycine par l’acide aspartique. Les
mutations dominantes sont les transversions G>T (42,3%) et les transitions G>A (41,3%). En
revanche, les mutations NRAS ont été détectées chez une patiente. Quant au gène BRAF, seulement
2 patients étaient porteurs de la mutation V600E. Aucune relation statistiquement significative entre
les caractéristiques des patients atteints de CCRm et les mutations KRAS/NRAS/BRAF n'a été
trouvée.
Discussion et conclusion: Plusieurs études ont montré que les tests de mutations RAS/BRAF
Idylla™ peuvent être appliqués comme outils de routine sans nécessiter d'infrastructure ou
d'expertise moléculaire, pour guider le traitement personnalisé des patients atteints de CCR. Nos
résultats suggèrent que les mutations KRAS sont plus fréquentes chez les patients marocains atteints
de CCRm, ce qui est en accord avec les études antérieures. D'autres études, portant sur un plus
grand nombre de patients atteints de CCRm, sont recommandées pour confirmer nos résultats.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0722020 Président : IBRAHIMI Azeddine Directeur : AANNIZ Tarik Juge : OUADGHIRI Mouna Réservation
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MM0722020URL IN SILICO STUDY OF THE KRAS PROTEIN: EVALUATION OF THE EFFECTS OF POINT MUTATION ,THEIR RELATIONSHIP TO RESPONSE AND EXPLORATION OF NON-TOXIC INHIBITOR / HOSROM NADIA AHMED NASSER
Titre : IN SILICO STUDY OF THE KRAS PROTEIN: EVALUATION OF THE EFFECTS OF POINT MUTATION ,THEIR RELATIONSHIP TO RESPONSE AND EXPLORATION OF NON-TOXIC INHIBITOR Type de document : thèse Auteurs : HOSROM NADIA AHMED NASSER, Auteur Année de publication : 2023 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : KRAS KRAS mutation KRAS inhibitor virtual screening Docking طفرة kRAS مثبط kRAS فحص افتراضي رسو mutation kRAS inhibiteur kRAS criblage virtuel Docking Résumé : MAPK families play a big part in complicated cellular processes like growth, development,
change, and death (apoptosis). The Ras/Raf/MAPK (MEK) pathway is the most critical signaling cascade among the MAPK signal transduction pathways, and it plays an essential role
in the continued existence and progression of tumor cells. The formation of malignant tumors
has been found to be most frequently related to mutations in the RAS protein family. Mutations in the KRAS protein cause cell division to happen too quickly, which helps tumors
grow. Stopping KRAS mutations would stop too many cells from dividing, which would stop
the growth of tumors. Inhibiting the KRAS mutant protein has been looked at as a possible
cancer treatment to stop KRAS from changing again.
The goal of this research is to find new possible KRAS inhibitors by using virtual screening
and docking, as well as to predict, in silico, how the stability and flexibility of mutations will
affect the way the protein works.
In our research, 36 mutations that cause cancer are studied in order to predict their effects on
the stability, flexibility, and function of the protein.
In addition, 224 different compounds that have an inhibitory impact on KRAS were chosen
from the binding database. Six compounds are used in docking. This is done after toxicity
and the Lipinski and Veber rules have been looked at. The results were compared to inhibitors used as a reference, such as 0375-0604 and sotorasib (AMG510), and according to that,
we see that the BDBM29608 inhibitor has the best affinity for most mutations.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0252023 Président : Mouna Ouadghiri Directeur : Ilham Kandoussi Juge : Rachid ElJaoudi Juge : Bentayebi Kaoutar IN SILICO STUDY OF THE KRAS PROTEIN: EVALUATION OF THE EFFECTS OF POINT MUTATION ,THEIR RELATIONSHIP TO RESPONSE AND EXPLORATION OF NON-TOXIC INHIBITOR [thèse] / HOSROM NADIA AHMED NASSER, Auteur . - 2023.
Langues : Anglais (eng)
Mots-clés : KRAS KRAS mutation KRAS inhibitor virtual screening Docking طفرة kRAS مثبط kRAS فحص افتراضي رسو mutation kRAS inhibiteur kRAS criblage virtuel Docking Résumé : MAPK families play a big part in complicated cellular processes like growth, development,
change, and death (apoptosis). The Ras/Raf/MAPK (MEK) pathway is the most critical signaling cascade among the MAPK signal transduction pathways, and it plays an essential role
in the continued existence and progression of tumor cells. The formation of malignant tumors
has been found to be most frequently related to mutations in the RAS protein family. Mutations in the KRAS protein cause cell division to happen too quickly, which helps tumors
grow. Stopping KRAS mutations would stop too many cells from dividing, which would stop
the growth of tumors. Inhibiting the KRAS mutant protein has been looked at as a possible
cancer treatment to stop KRAS from changing again.
The goal of this research is to find new possible KRAS inhibitors by using virtual screening
and docking, as well as to predict, in silico, how the stability and flexibility of mutations will
affect the way the protein works.
In our research, 36 mutations that cause cancer are studied in order to predict their effects on
the stability, flexibility, and function of the protein.
In addition, 224 different compounds that have an inhibitory impact on KRAS were chosen
from the binding database. Six compounds are used in docking. This is done after toxicity
and the Lipinski and Veber rules have been looked at. The results were compared to inhibitors used as a reference, such as 0375-0604 and sotorasib (AMG510), and according to that,
we see that the BDBM29608 inhibitor has the best affinity for most mutations.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0252023 Président : Mouna Ouadghiri Directeur : Ilham Kandoussi Juge : Rachid ElJaoudi Juge : Bentayebi Kaoutar Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0252023 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible