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Affiner la recherche Faire une suggestionEVALUATION IN SILICO DES EFFETS DES MUTATIONS PNCTUELLES SUR LA PROTEINE BRAF ET LEUR IMPACT SUR LE CHOIX DE TRAITEMENT / KOUROU JOUHAINA
Titre : EVALUATION IN SILICO DES EFFETS DES MUTATIONS PNCTUELLES SUR LA PROTEINE BRAF ET LEUR IMPACT SUR LE CHOIX DE TRAITEMENT Type de document : thèse Auteurs : KOUROU JOUHAINA, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : MAPK BRAF Inhibiteur Cancer Criblage virtuel MAPK BRAF inhibitor cancer virtual screening Docking APK BRAF المانع السرطان الفحص االفتراضي اإلرساء Résumé : "La voie de signalisation MAPK reste l’une des principales voies de prolifération cellulaire. Celle-ci est essentielle pour la croissance, la différenciation et la survie cellulaire. La voie de MAPK a un complexe unique de phosphorylation « RAS/RAF/MEK/ERK ». Dans cette voie, la protéine BRAF joue un rôle important dans cette cascade. Cette protéine sérine/thréonine kinase, en fonctionnant comme un proto-oncogène, est la cause de plusieurs types de cancer, notamment les mélanomes. L’étude des fonctions de cette protéine est indispensable pour mieux comprendre les mécanismes d’altération oncogénique. Pour cela, plusieurs thérapies ont été développé, ciblant BRAF, afin de traiter le cancer.
Ce travail a pour but de prédire, in silico, l’effet de stabilité et de flexibilité des mutations sur la fonction de la protéine, ainsi d’identifier des nouveaux inhibiteurs potentiels de BRAF, en utilisant le criblage virtuel et le Docking.
Lors de notre travail, 491 mutations ont été étudiées, afin de prédire leurs effets sur la stabilité, la flexibilité et la fonction de la protéine. 3 mutations, qui sont respectivement (G469E, L584F, A621S), ont été sélectionnées de différents 3 domaines de la protéine BRAF : ATP-binding, kinase, boucle d’activation.
En outre, 101 composés ont été sélectionnés de Binding dB, ayant un effet inhibiteur contre BRAF. Après une évaluation de toxicité et des règles de Lipinski et Veber, 78 composés sont utilisés en Docking. Les résultats ont été comparés avec les inhibiteurs de référence : Sorafénib, Dabrafénib, Vémurafénib, et Encorafénib. Alors, 1 seul composé « BDBM300299 », ayant des bons résultats, est proposé comme traitement anti-cancéreux."
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0372022 Président : IBRAHIMI AZEDDINE Directeur : OUADGHIRI MOUNA Juge : ILHAM KANDOUSSI EVALUATION IN SILICO DES EFFETS DES MUTATIONS PNCTUELLES SUR LA PROTEINE BRAF ET LEUR IMPACT SUR LE CHOIX DE TRAITEMENT [thèse] / KOUROU JOUHAINA, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : MAPK BRAF Inhibiteur Cancer Criblage virtuel MAPK BRAF inhibitor cancer virtual screening Docking APK BRAF المانع السرطان الفحص االفتراضي اإلرساء Résumé : "La voie de signalisation MAPK reste l’une des principales voies de prolifération cellulaire. Celle-ci est essentielle pour la croissance, la différenciation et la survie cellulaire. La voie de MAPK a un complexe unique de phosphorylation « RAS/RAF/MEK/ERK ». Dans cette voie, la protéine BRAF joue un rôle important dans cette cascade. Cette protéine sérine/thréonine kinase, en fonctionnant comme un proto-oncogène, est la cause de plusieurs types de cancer, notamment les mélanomes. L’étude des fonctions de cette protéine est indispensable pour mieux comprendre les mécanismes d’altération oncogénique. Pour cela, plusieurs thérapies ont été développé, ciblant BRAF, afin de traiter le cancer.
Ce travail a pour but de prédire, in silico, l’effet de stabilité et de flexibilité des mutations sur la fonction de la protéine, ainsi d’identifier des nouveaux inhibiteurs potentiels de BRAF, en utilisant le criblage virtuel et le Docking.
Lors de notre travail, 491 mutations ont été étudiées, afin de prédire leurs effets sur la stabilité, la flexibilité et la fonction de la protéine. 3 mutations, qui sont respectivement (G469E, L584F, A621S), ont été sélectionnées de différents 3 domaines de la protéine BRAF : ATP-binding, kinase, boucle d’activation.
En outre, 101 composés ont été sélectionnés de Binding dB, ayant un effet inhibiteur contre BRAF. Après une évaluation de toxicité et des règles de Lipinski et Veber, 78 composés sont utilisés en Docking. Les résultats ont été comparés avec les inhibiteurs de référence : Sorafénib, Dabrafénib, Vémurafénib, et Encorafénib. Alors, 1 seul composé « BDBM300299 », ayant des bons résultats, est proposé comme traitement anti-cancéreux."
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0372022 Président : IBRAHIMI AZEDDINE Directeur : OUADGHIRI MOUNA Juge : ILHAM KANDOUSSI Réservation
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MM0372022URL
Titre : IMPLICATION DES GENES KRAS, NRAS ET BRAF DANS LE CANCER COLORECTAL METASTATIQUE Type de document : thèse Auteurs : TIGANA Sofia dite Safiatou, Auteur Année de publication : 2020 Langues : Français (fre) Mots-clés : Cancer colorectal métastatique KRAS NRAS BRAF Maroc Résumé : Introduction: Le statut RAS/BRAF est un biomarqueur prédictif de la réponse aux anti-EGFR dans
le cancer colorectal métastatique (CCRm). La technologie Idylla (TI) est un système de test
moléculaire entièrement automatisé, basé sur la PCR en temps réel et permet d’obtenir des résultats
rapidement pour un temps de préparation très court.
Objectif: Evaluer le statut mutationnel full RAS et BRAF chez les patients marocains atteints de
CCRm.
Matériel et méthodes: Les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE), obtenus entre
février et juin 2020, ont été analysés à l'aide de la TI. Le pourcentage de cellules tumorales minimal
était de 10%, après contrôle morphologique. 1 à 5 coupes de 5 microns étaient prélevées via un
microtome dédié et insérées directement dans la cartouche Idylla.
Résultats: 40 échantillons de CCRm ont fait l’objet d’une recherche de mutation RAS/BRAF, 8
(20%) n’ont pas pu être traités pour insuffisance de matériel tumoral. Au total, 32 patients ont été
inclus dans cette étude, 46,88% étaient des femmes et 53,12%des hommes, l'âge moyen étant de
54,81ans avec des extrêmes allant de 23 à 78 ans. Tous nos patients ont été diagnostiqués pour un
adénocarcinome (ADK). 53,12 % des tumeurs étaient des mutants KRAS et la majorité des
mutations se traduisait par une substitution d’acide aminé glycine par l’acide aspartique. Les
mutations dominantes sont les transversions G>T (42,3%) et les transitions G>A (41,3%). En
revanche, les mutations NRAS ont été détectées chez une patiente. Quant au gène BRAF, seulement
2 patients étaient porteurs de la mutation V600E. Aucune relation statistiquement significative entre
les caractéristiques des patients atteints de CCRm et les mutations KRAS/NRAS/BRAF n'a été
trouvée.
Discussion et conclusion: Plusieurs études ont montré que les tests de mutations RAS/BRAF
Idylla™ peuvent être appliqués comme outils de routine sans nécessiter d'infrastructure ou
d'expertise moléculaire, pour guider le traitement personnalisé des patients atteints de CCR. Nos
résultats suggèrent que les mutations KRAS sont plus fréquentes chez les patients marocains atteints
de CCRm, ce qui est en accord avec les études antérieures. D'autres études, portant sur un plus
grand nombre de patients atteints de CCRm, sont recommandées pour confirmer nos résultats.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0722020 Président : IBRAHIMI Azeddine Directeur : AANNIZ Tarik Juge : OUADGHIRI Mouna IMPLICATION DES GENES KRAS, NRAS ET BRAF DANS LE CANCER COLORECTAL METASTATIQUE [thèse] / TIGANA Sofia dite Safiatou, Auteur . - 2020.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Cancer colorectal métastatique KRAS NRAS BRAF Maroc Résumé : Introduction: Le statut RAS/BRAF est un biomarqueur prédictif de la réponse aux anti-EGFR dans
le cancer colorectal métastatique (CCRm). La technologie Idylla (TI) est un système de test
moléculaire entièrement automatisé, basé sur la PCR en temps réel et permet d’obtenir des résultats
rapidement pour un temps de préparation très court.
Objectif: Evaluer le statut mutationnel full RAS et BRAF chez les patients marocains atteints de
CCRm.
Matériel et méthodes: Les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE), obtenus entre
février et juin 2020, ont été analysés à l'aide de la TI. Le pourcentage de cellules tumorales minimal
était de 10%, après contrôle morphologique. 1 à 5 coupes de 5 microns étaient prélevées via un
microtome dédié et insérées directement dans la cartouche Idylla.
Résultats: 40 échantillons de CCRm ont fait l’objet d’une recherche de mutation RAS/BRAF, 8
(20%) n’ont pas pu être traités pour insuffisance de matériel tumoral. Au total, 32 patients ont été
inclus dans cette étude, 46,88% étaient des femmes et 53,12%des hommes, l'âge moyen étant de
54,81ans avec des extrêmes allant de 23 à 78 ans. Tous nos patients ont été diagnostiqués pour un
adénocarcinome (ADK). 53,12 % des tumeurs étaient des mutants KRAS et la majorité des
mutations se traduisait par une substitution d’acide aminé glycine par l’acide aspartique. Les
mutations dominantes sont les transversions G>T (42,3%) et les transitions G>A (41,3%). En
revanche, les mutations NRAS ont été détectées chez une patiente. Quant au gène BRAF, seulement
2 patients étaient porteurs de la mutation V600E. Aucune relation statistiquement significative entre
les caractéristiques des patients atteints de CCRm et les mutations KRAS/NRAS/BRAF n'a été
trouvée.
Discussion et conclusion: Plusieurs études ont montré que les tests de mutations RAS/BRAF
Idylla™ peuvent être appliqués comme outils de routine sans nécessiter d'infrastructure ou
d'expertise moléculaire, pour guider le traitement personnalisé des patients atteints de CCR. Nos
résultats suggèrent que les mutations KRAS sont plus fréquentes chez les patients marocains atteints
de CCRm, ce qui est en accord avec les études antérieures. D'autres études, portant sur un plus
grand nombre de patients atteints de CCRm, sont recommandées pour confirmer nos résultats.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0722020 Président : IBRAHIMI Azeddine Directeur : AANNIZ Tarik Juge : OUADGHIRI Mouna Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0722020 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible MM0722020-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible Documents numériques
MM0722020URL
Titre : STATUT MUTATIONNEL DE L’EGFR, L’HER2 ET LE BRAF DANS LE CANCER BRONCHIQUE NON A PETITES CELLULES AU MAROC. Type de document : thèse Auteurs : ZAROUK AHLAM, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : Cancer du poumon cancer bronchique non à petites cellules (CBNPC) thérapie ciblée inhibiteurs de la tyrosine kinase biomarqueurs EGFR, BRAF HER2 Lung cancer non-small cell lung cancer (NSCLC) targeted therapy tyrosine kinase inhibitors biomarkers EGFR BRAF HER2 سرطان الرئة سرطان الرئة ذو الخلايا غير الصغيرة (NSCLC) العلاج الموجه مثبطات التيروزين
كينيز المؤشرات الحيوية، EGFR BRAF HER2Résumé : Le cancer du poumon (CP) est le deuxième cancer le plus répandu et la première cause de mortalité par cancer dans le monde. Le type histologique le plus fréquent est le cancer bronchique non à petites cellules représentant 85% des cas. Le cancer du poumon constitue un problème majeur de santé publique à cause de son diagnostic tardif, sa prise en charge lourde et de son incidence qui ne cessent d’augmenter d’une année à l’autre.
Des cibles potentielles de diagnostics, pronostiques et thérapeutiques sont déterminées à travers l’exploration des altérations moléculaires de cancer du poumon à l’aide des outils de biologie moléculaire.
Notre projet a porté sur l’étude du statut mutationnel de trois biomarqueurs du CBNPC à savoir l’EGFR, l’HER2 et le BRAF chez 30 patients marocains atteints d’un cancer du poumon primitif et qui sont hospitalisés au service de chirurgie thoracique du Centre Hospitalier Universitaire Ibn Rochd Casablanca (CHU Ibn Rochd). Moyennant une Polymerase Chain Reaction (PCR) conventionnelle suivie d’un séquençage de Sanger, nous avons pu explorer l’absence ou la présence des mutations les plus répertoriées et les plus impliquées dans la réponse aux traitements via les inhibiteurs de la tyrosine kinase (ITK). Les résultats du séquençage ont révélé la présence d’une mutation au niveau de l’exon 19 du gène EGFR, il s’agit de la délétion E746_A750 ; c’est la mutation la plus fréquente de cet exon qui joue un rôle important dans l’amélioration de la prise en charge des patients représentant cette altération. Aucune mutation n’a été détectée au niveau des autres exons du gène EGFR ni au niveau des gènes BRAF et HER2.
Le travail sera poursuivi sur un large panel pour l’identification des mutations dans les gènes étudiés afin d’établir le paysage moléculaire des patients atteints du CP et leur éligibilité à la thérapie ciblée.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0522022 Président : AANNIZ Tarik Directeur : EL MZIBRI Mohammed Juge : BENSAID Mounia STATUT MUTATIONNEL DE L’EGFR, L’HER2 ET LE BRAF DANS LE CANCER BRONCHIQUE NON A PETITES CELLULES AU MAROC. [thèse] / ZAROUK AHLAM, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Cancer du poumon cancer bronchique non à petites cellules (CBNPC) thérapie ciblée inhibiteurs de la tyrosine kinase biomarqueurs EGFR, BRAF HER2 Lung cancer non-small cell lung cancer (NSCLC) targeted therapy tyrosine kinase inhibitors biomarkers EGFR BRAF HER2 سرطان الرئة سرطان الرئة ذو الخلايا غير الصغيرة (NSCLC) العلاج الموجه مثبطات التيروزين
كينيز المؤشرات الحيوية، EGFR BRAF HER2Résumé : Le cancer du poumon (CP) est le deuxième cancer le plus répandu et la première cause de mortalité par cancer dans le monde. Le type histologique le plus fréquent est le cancer bronchique non à petites cellules représentant 85% des cas. Le cancer du poumon constitue un problème majeur de santé publique à cause de son diagnostic tardif, sa prise en charge lourde et de son incidence qui ne cessent d’augmenter d’une année à l’autre.
Des cibles potentielles de diagnostics, pronostiques et thérapeutiques sont déterminées à travers l’exploration des altérations moléculaires de cancer du poumon à l’aide des outils de biologie moléculaire.
Notre projet a porté sur l’étude du statut mutationnel de trois biomarqueurs du CBNPC à savoir l’EGFR, l’HER2 et le BRAF chez 30 patients marocains atteints d’un cancer du poumon primitif et qui sont hospitalisés au service de chirurgie thoracique du Centre Hospitalier Universitaire Ibn Rochd Casablanca (CHU Ibn Rochd). Moyennant une Polymerase Chain Reaction (PCR) conventionnelle suivie d’un séquençage de Sanger, nous avons pu explorer l’absence ou la présence des mutations les plus répertoriées et les plus impliquées dans la réponse aux traitements via les inhibiteurs de la tyrosine kinase (ITK). Les résultats du séquençage ont révélé la présence d’une mutation au niveau de l’exon 19 du gène EGFR, il s’agit de la délétion E746_A750 ; c’est la mutation la plus fréquente de cet exon qui joue un rôle important dans l’amélioration de la prise en charge des patients représentant cette altération. Aucune mutation n’a été détectée au niveau des autres exons du gène EGFR ni au niveau des gènes BRAF et HER2.
Le travail sera poursuivi sur un large panel pour l’identification des mutations dans les gènes étudiés afin d’établir le paysage moléculaire des patients atteints du CP et leur éligibilité à la thérapie ciblée.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0522022 Président : AANNIZ Tarik Directeur : EL MZIBRI Mohammed Juge : BENSAID Mounia Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0522022 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible Documents numériques
MM0522022URL
