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3 résultat(s) recherche sur le mot-clé 'Séquençage à haut débit' 
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Titre : ETUDE MOLÉCULAIRE DES MALADIES GÉNÉTIQUES AVEC RISQUE DE CANCER: LA XERODERMA PIGMENTOSUM ET L’ANÉMIE DE FANCONI COMME EXEMPLES Type de document : thèse Auteurs : DOUBAJ YASSAMINE, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Français (fre) Mots-clés : Cancer Xéroderma pigmentosum Anémie de Fanconi Séquençage Sanger Séquençage à haut débit Résumé : "Introduction : De nombreuses maladies génétiques, notamment celles dues à des anomalies de réparation de l’ADN, sont associées à un risque accru de cancer. L'étude de ces syndromes a considérablement évolué et a conduit à l'identification de gènes impliqués dans la carcinogenèse. Dans ce travail, nous nous sommes intéressés à deux pathologies: La Xéroderma Pigmentosum (XP) et l’Anémie de Fanconi (AF).
Matériels et méthodes : Pour la famille avec XP, nous avons appliqué le Séquençage de Sanger pour la recherche de la mutation récurrente c.1643_1644delTG au niveau de l’exon 9 du gène XPC. Concernant les familles atteintes de l’AF, nous avons opté pour le Séquençage haut débit pour analyser les trois gènes les plus fréquemment mutés FANCA, FANCC, et FANCG et qui représentent 84% de tous les gènes impliqués dans l’AF.
Résultats : Le séquençage ciblé de l’exon 9 du gène XPC a révélé la présence d’une nouvelle mutation à l’état homozygote de type insertion de 4 bases chez le propositus. Les parents ont été testés et se sont révélés porteurs de cette mutation à l’état hétérozygote. L’analyse moléculaire effectuée chez neuf patients atteints d’AF et présentant tous une grande instabilité chromosomique sous mitomycine, a confirmé le diagnostic dans 88.8% des cas avec trois nouvelles mutations prédites comme pathogènes. Des variations du gène FANCA et dugène FANCGont été retrouvées respectivement dans 62.5% et 37.5% des cas. .
Conclusion : Grâce aux techniques de séquençage, le diagnostic moléculaire est actuellement possible même pour les maladies génétiques avec une grande hétérogénéité génétique. Le choix du test moléculaire dépend du profil génétique de la pathologie. L’identification de la mutation causale permet d’adapter la prise en charge des malades et de prodiguer aux familles un conseil génétique adéquat.
"
Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0232019 Président : Taghzouti Mohammed Khalid Directeur : Sefiani Abdelaziz Juge : Ouldim Karim Juge : Ratbi Ilham Juge : Lyahyai Jaber ; El Kababri Maria ETUDE MOLÉCULAIRE DES MALADIES GÉNÉTIQUES AVEC RISQUE DE CANCER: LA XERODERMA PIGMENTOSUM ET L’ANÉMIE DE FANCONI COMME EXEMPLES [thèse] / DOUBAJ YASSAMINE, Auteur . - 2021.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Cancer Xéroderma pigmentosum Anémie de Fanconi Séquençage Sanger Séquençage à haut débit Résumé : "Introduction : De nombreuses maladies génétiques, notamment celles dues à des anomalies de réparation de l’ADN, sont associées à un risque accru de cancer. L'étude de ces syndromes a considérablement évolué et a conduit à l'identification de gènes impliqués dans la carcinogenèse. Dans ce travail, nous nous sommes intéressés à deux pathologies: La Xéroderma Pigmentosum (XP) et l’Anémie de Fanconi (AF).
Matériels et méthodes : Pour la famille avec XP, nous avons appliqué le Séquençage de Sanger pour la recherche de la mutation récurrente c.1643_1644delTG au niveau de l’exon 9 du gène XPC. Concernant les familles atteintes de l’AF, nous avons opté pour le Séquençage haut débit pour analyser les trois gènes les plus fréquemment mutés FANCA, FANCC, et FANCG et qui représentent 84% de tous les gènes impliqués dans l’AF.
Résultats : Le séquençage ciblé de l’exon 9 du gène XPC a révélé la présence d’une nouvelle mutation à l’état homozygote de type insertion de 4 bases chez le propositus. Les parents ont été testés et se sont révélés porteurs de cette mutation à l’état hétérozygote. L’analyse moléculaire effectuée chez neuf patients atteints d’AF et présentant tous une grande instabilité chromosomique sous mitomycine, a confirmé le diagnostic dans 88.8% des cas avec trois nouvelles mutations prédites comme pathogènes. Des variations du gène FANCA et dugène FANCGont été retrouvées respectivement dans 62.5% et 37.5% des cas. .
Conclusion : Grâce aux techniques de séquençage, le diagnostic moléculaire est actuellement possible même pour les maladies génétiques avec une grande hétérogénéité génétique. Le choix du test moléculaire dépend du profil génétique de la pathologie. L’identification de la mutation causale permet d’adapter la prise en charge des malades et de prodiguer aux familles un conseil génétique adéquat.
"
Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0232019 Président : Taghzouti Mohammed Khalid Directeur : Sefiani Abdelaziz Juge : Ouldim Karim Juge : Ratbi Ilham Juge : Lyahyai Jaber ; El Kababri Maria Réservation
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Titre : LE MICROBIOTE PULMONAIRE ET SES APPLICATIONS DANS L'ASTHME ET LA MUCOVISCIDOSE Type de document : thèse Auteurs : ELANTARI FADOUA, Auteur Année de publication : 2020 Langues : Français (fre) Mots-clés : Asthme Microbiote pulmonaire Mucoviscidose Séquençage à haut débit Résumé : Le microbiote pulmonaire est l’ensemble de micro organismes qui existent dans le tractus respiratoire inférieur. Sa découverte a été associée aux techniques de séquençage à haut débit qui ont permis de tuer le dogme de stérilité pulmonaire, et de détecter les différentes espèces, dans les poumons normaux. Chez les sujets sains, la population bactérienne est essentiellement composée par les firmicutes et les bacteroidetes. Prevotella, Veillonella et Streptococcus sont les genres prédominants dans le microbiome pulmonaire. La composante fongique est dominée par les Aspergillus et comporte 75 genres. En fin, le virome est principalement fait par des bactériophages et des eucaryotes. Au cours de l’asthme, on détecte des changements faits par la prédominance des protéobactéries dans le type non sévère, ainsi que des actinobactéries et des firmicutes dans l’asthme sévère. Dans la mucoviscidose, le microbiote pulmonaire est variable selon l’âge du patient, la gravité de la maladie, et l’exposition aux antibiotiques. Ces changements au cours des affections chroniques font penser que la manipulation du microbiote peut être une approche efficace dans la thérapie et la prévention de certaines maladies. Numéro (Thèse ou Mémoire) : M3192020 Président : SEKHSOKH YASSINE Directeur : ZOUHDI MIMOUN Juge : GAOUZI AHMED Juge : CHADLI MARIAMA LE MICROBIOTE PULMONAIRE ET SES APPLICATIONS DANS L'ASTHME ET LA MUCOVISCIDOSE [thèse] / ELANTARI FADOUA, Auteur . - 2020.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Asthme Microbiote pulmonaire Mucoviscidose Séquençage à haut débit Résumé : Le microbiote pulmonaire est l’ensemble de micro organismes qui existent dans le tractus respiratoire inférieur. Sa découverte a été associée aux techniques de séquençage à haut débit qui ont permis de tuer le dogme de stérilité pulmonaire, et de détecter les différentes espèces, dans les poumons normaux. Chez les sujets sains, la population bactérienne est essentiellement composée par les firmicutes et les bacteroidetes. Prevotella, Veillonella et Streptococcus sont les genres prédominants dans le microbiome pulmonaire. La composante fongique est dominée par les Aspergillus et comporte 75 genres. En fin, le virome est principalement fait par des bactériophages et des eucaryotes. Au cours de l’asthme, on détecte des changements faits par la prédominance des protéobactéries dans le type non sévère, ainsi que des actinobactéries et des firmicutes dans l’asthme sévère. Dans la mucoviscidose, le microbiote pulmonaire est variable selon l’âge du patient, la gravité de la maladie, et l’exposition aux antibiotiques. Ces changements au cours des affections chroniques font penser que la manipulation du microbiote peut être une approche efficace dans la thérapie et la prévention de certaines maladies. Numéro (Thèse ou Mémoire) : M3192020 Président : SEKHSOKH YASSINE Directeur : ZOUHDI MIMOUN Juge : GAOUZI AHMED Juge : CHADLI MARIAMA Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité M3192020 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2020 Disponible M3192020-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2020 Disponible Documents numériques
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Titre : LE SYNDROME DE HEIMLER : DESCRIPTION PHENOTYPIQUE ET IDENTIFICATION DES GENES DE BIOGENESE DES PEROXYSOMES PEX1 ET PEX6 EN CAUSE PAR SEQUENCAGE A HAUT DEBIT Type de document : thèse Auteurs : RATBI ILHAM, Auteur Année de publication : 2019-2020 Langues : Français (fre) Mots-clés : Syndrome de Heimler phénotype surdité amélogenèse imparfaite séquençage à haut débit exome peroxysome gène PEX1, gène PEX6 Heimler syndrome phenotype amelogenesis imperfecta Next Generation Sequening exome peroxysome PEX1 gene PEX6 gene متلازمة هيملر النمط الظاهري عيب التخليق الناشئ تسلسل الجيل التالي تسلسل عالي السرعة Résumé : Le syndrome de Heimler est une maladie autosomique récessive très rare, caractérisée par une surdité neurosensorielle (SNS) et une amélogenèse imparfaite (AI). Le substratum génétique du syndrome de Heimler est encore inconnu. Nous présentons dans ce travail les résultats de l’étude de huit familles, ayant un ou plusieurs enfants atteints par le syndrome de Heimler. Le séquençage à haut débit d’exome a permis la caractérisation de mutations bi-alléliques au niveau des gènes PEX1 et PEX6 chez six familles. Les mutations perte de fonction des gènes PEX1 et PEX6 sont connues comme responsables du spectre de désordres de la biogenèse des peroxysomes (DBP) de transmission autosomique récessive. Les patients étudiés avaient quelques signes cliniques discrets retrouvés dans les désordres de biogenèse des peroxysomes tels que la surdité et les anomalies dentaires, toutefois les analyses biochimiques de routine de ces troubles dans leur plasma et leurs fibroblastes cutanés étaient normales. Nous démontrons par des études fonctionnelles réalisées sur des fibroblastes des patients que deux mutations hypomorphes ou l’association d’une mutation hypomorphe et d’une mutation perte de fonction des gènes PEX1 et PEX6 sont responsables du syndrome de Heimler. Suite à l’identification des gènes en cause dans le syndrome de Heimler, nous avons considéré dans la deuxième partie de notre travail la possibilité de ce diagnostic chez une deuxième famille marocaine. Le séquençage Sanger du gène PEX1 a identifié chez la patiente une mutation hypomorphe homozygote du gène PEX1 confirmant chez elle le diagnostic de syndrome de Heimler. En conclusion, les résultats de notre travail collaboratif définissent aujourd’hui le syndrome de Heimler comme une maladie métabolique et la forme la plus modérée connue à ce jour des désordres de biogenèse des peroxysomes, non détecté par les tests biochimiques de routine, et associé à un spectre mutationnel pléiotropique des gènes PEX1 et PEX6. Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0212019 Président : TAGHZOUTI Mohammed Khalid Directeur : SEFIANI Abdelaziz Juge : HIDA Moustapha Juge : OULDIM Karim Juge : LYAHYAI Jaber ; RAMDI Hind Examinatrice LE SYNDROME DE HEIMLER : DESCRIPTION PHENOTYPIQUE ET IDENTIFICATION DES GENES DE BIOGENESE DES PEROXYSOMES PEX1 ET PEX6 EN CAUSE PAR SEQUENCAGE A HAUT DEBIT [thèse] / RATBI ILHAM, Auteur . - 2019-2020.
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Mots-clés : Syndrome de Heimler phénotype surdité amélogenèse imparfaite séquençage à haut débit exome peroxysome gène PEX1, gène PEX6 Heimler syndrome phenotype amelogenesis imperfecta Next Generation Sequening exome peroxysome PEX1 gene PEX6 gene متلازمة هيملر النمط الظاهري عيب التخليق الناشئ تسلسل الجيل التالي تسلسل عالي السرعة Résumé : Le syndrome de Heimler est une maladie autosomique récessive très rare, caractérisée par une surdité neurosensorielle (SNS) et une amélogenèse imparfaite (AI). Le substratum génétique du syndrome de Heimler est encore inconnu. Nous présentons dans ce travail les résultats de l’étude de huit familles, ayant un ou plusieurs enfants atteints par le syndrome de Heimler. Le séquençage à haut débit d’exome a permis la caractérisation de mutations bi-alléliques au niveau des gènes PEX1 et PEX6 chez six familles. Les mutations perte de fonction des gènes PEX1 et PEX6 sont connues comme responsables du spectre de désordres de la biogenèse des peroxysomes (DBP) de transmission autosomique récessive. Les patients étudiés avaient quelques signes cliniques discrets retrouvés dans les désordres de biogenèse des peroxysomes tels que la surdité et les anomalies dentaires, toutefois les analyses biochimiques de routine de ces troubles dans leur plasma et leurs fibroblastes cutanés étaient normales. Nous démontrons par des études fonctionnelles réalisées sur des fibroblastes des patients que deux mutations hypomorphes ou l’association d’une mutation hypomorphe et d’une mutation perte de fonction des gènes PEX1 et PEX6 sont responsables du syndrome de Heimler. Suite à l’identification des gènes en cause dans le syndrome de Heimler, nous avons considéré dans la deuxième partie de notre travail la possibilité de ce diagnostic chez une deuxième famille marocaine. Le séquençage Sanger du gène PEX1 a identifié chez la patiente une mutation hypomorphe homozygote du gène PEX1 confirmant chez elle le diagnostic de syndrome de Heimler. En conclusion, les résultats de notre travail collaboratif définissent aujourd’hui le syndrome de Heimler comme une maladie métabolique et la forme la plus modérée connue à ce jour des désordres de biogenèse des peroxysomes, non détecté par les tests biochimiques de routine, et associé à un spectre mutationnel pléiotropique des gènes PEX1 et PEX6. Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0212019 Président : TAGHZOUTI Mohammed Khalid Directeur : SEFIANI Abdelaziz Juge : HIDA Moustapha Juge : OULDIM Karim Juge : LYAHYAI Jaber ; RAMDI Hind Examinatrice Réservation
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