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Titre : GENOMIC ANALYSIS OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN AFRICA REVEALED LINEAGE - DRUG RESISTANCE ASSOCIATION Type de document : thèse Auteurs : EL FATHI LALAOUI YASMINE, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : Mycobacterium tuberculosis Lineages Drug-resistance Genomic Analysis Africa Mycobacterium tuberculosis Lign ́ees resistance aux antibiotiques Analyse
G ́enomique Afrique المتفطرة السلية السالالت مقاومة األدوية التحليل الجيني إفريقياRésumé : Tuberculosis is a serious infectious respiratory disease caused by Mycobacterium
tuberculosis.
In this study, we used genomics, to determine the population structure of Mycobacterium
tuberculosis in Africa. Using the MTBseq pipeline, we analyzed samples from 28 different
African countries in order to determine the distribution of Mycobacterium tuberculosis
lineages as well as drug resistance in Africa and to verify the association between the two.
As a result, we have found out that the most dominant lineage is lineage 4 with a prevalence
of 54.33%, followed by lineage 3 (8.62%), 2 and 1 with a percentage of 7.41% and
7.31% respectively. West African lineages 6 and 5 have a prevalence of 3.61% and 1.25%
respectively, while lineage 7 with the lowest percentage of 0.58%.
We have also studied the association between lineages and drug resistance and the p value
for the drugs variable was 0.014 while it was 3.24*10-7
for lineages proving the presence
of an association between them.
Moreover, the number of sensitive and resistant samples was calculated and the result
showcased that the majority (12034) of samples were sensitive, 2512 samples were Multi-
Drug Resistant, 1674 samples are Mono-Drug resistant, 1198 samples are Pre-Extensively Drug
Resistant and 223 are resistant to other drugs.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0182022 Président : AANNIZ Tarik, Directeur : EL ALLALI Achraf ; LAAMARTI Mariam Co-encadrante Juge : BENTAYEBI Kaoutar GENOMIC ANALYSIS OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN AFRICA REVEALED LINEAGE - DRUG RESISTANCE ASSOCIATION [thèse] / EL FATHI LALAOUI YASMINE, Auteur . - 2022.
Langues : Anglais (eng)
Mots-clés : Mycobacterium tuberculosis Lineages Drug-resistance Genomic Analysis Africa Mycobacterium tuberculosis Lign ́ees resistance aux antibiotiques Analyse
G ́enomique Afrique المتفطرة السلية السالالت مقاومة األدوية التحليل الجيني إفريقياRésumé : Tuberculosis is a serious infectious respiratory disease caused by Mycobacterium
tuberculosis.
In this study, we used genomics, to determine the population structure of Mycobacterium
tuberculosis in Africa. Using the MTBseq pipeline, we analyzed samples from 28 different
African countries in order to determine the distribution of Mycobacterium tuberculosis
lineages as well as drug resistance in Africa and to verify the association between the two.
As a result, we have found out that the most dominant lineage is lineage 4 with a prevalence
of 54.33%, followed by lineage 3 (8.62%), 2 and 1 with a percentage of 7.41% and
7.31% respectively. West African lineages 6 and 5 have a prevalence of 3.61% and 1.25%
respectively, while lineage 7 with the lowest percentage of 0.58%.
We have also studied the association between lineages and drug resistance and the p value
for the drugs variable was 0.014 while it was 3.24*10-7
for lineages proving the presence
of an association between them.
Moreover, the number of sensitive and resistant samples was calculated and the result
showcased that the majority (12034) of samples were sensitive, 2512 samples were Multi-
Drug Resistant, 1674 samples are Mono-Drug resistant, 1198 samples are Pre-Extensively Drug
Resistant and 223 are resistant to other drugs.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0182022 Président : AANNIZ Tarik, Directeur : EL ALLALI Achraf ; LAAMARTI Mariam Co-encadrante Juge : BENTAYEBI Kaoutar Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0182022 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible Documents numériques
MM0182022URL
Titre : La situation de la pharmacovigilance en Afrique Et les facteurs contributifs à son développement Type de document : thèse Auteurs : Mariam Squalli Houssaini, Auteur Année de publication : 2014 Langues : Français (fre) Mots-clés : Pharmacovigilance Afrique Facteurs contributifs Performance. Résumé : Introduction :
En 1992, le premier pays africain a rejoint le réseau international de la pharmacovigilance. Mais malgré l’intégration croissante des pays africains au réseau, la pharmacovigilance en Afrique est toujours considérée comme faible. Cependant, aucune étude n’a été réalisée pour déterminer la situation actuelle de la pharmacovigilance et les conditions environnementales contributives à son développement.
Objectif :
Décrire la situation actuelle des systèmes de Pharmacovigilance dans les pays africains, d’en évaluer la performance et déterminer les facteurs contributifs à son développement.
Matériel et méthodes :
Une étude descriptive, analytique transversale a été réalisée pour évaluer la situation de la pharmacovigilance en Afrique. Les données ont été collectées à partir d'un questionnaire et ont été complétées par des données provenant de diverses sources. Un score a été attribué aux indicateurs structurels, de procédure et d’impact et les pays ont été classés en fonction de leurs scores finals de performance. Des analyses de régression linéaires simples ont été réalisées pour identifier la relation entre le score de performance et les facteurs contributifs sélectionnés.
RÉSULTATS :
40 questionnaires ont été envoyés aux pays africains et 32 ont été reçus soit un taux de réponse de 80 %. Le score moyen de performance obtenu par les pays participants était de 19,25 ± 7,38. Ce score est la somme des scores structurels, de procédure et d'impact dont ils sont respectivement 11,93 ± 3,78, 4,03 ± 2,66 et 3,28 ± 2,09. Une corrélation a été établie entre le score de performance et la taille de la population, la pauvreté multidimensionnelle, l’ancienneté, la langue du pays et les facteurs pharmaceutiques.
DISCUSSION :
Les résultats ont montré une grande différence de performance entre les pays africains. Les facteurs contributifs définis peuvent jouer un rôle majeur, mais le plaidoyer et la continuité sont une condition sine qua non pour la pharmacovigilance et sa viabilité. La Liaison avec le réseau international et le partenariat régional avec échange d'expériences est essentielle.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0142014 Président : ADNAOUI.M Directeur : SOULAYMANI.R Juge : TAOUFIK.J Juge : ABOUQUAL.R Juge : SOULAYMANI.A La situation de la pharmacovigilance en Afrique Et les facteurs contributifs à son développement [thèse] / Mariam Squalli Houssaini, Auteur . - 2014.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Pharmacovigilance Afrique Facteurs contributifs Performance. Résumé : Introduction :
En 1992, le premier pays africain a rejoint le réseau international de la pharmacovigilance. Mais malgré l’intégration croissante des pays africains au réseau, la pharmacovigilance en Afrique est toujours considérée comme faible. Cependant, aucune étude n’a été réalisée pour déterminer la situation actuelle de la pharmacovigilance et les conditions environnementales contributives à son développement.
Objectif :
Décrire la situation actuelle des systèmes de Pharmacovigilance dans les pays africains, d’en évaluer la performance et déterminer les facteurs contributifs à son développement.
Matériel et méthodes :
Une étude descriptive, analytique transversale a été réalisée pour évaluer la situation de la pharmacovigilance en Afrique. Les données ont été collectées à partir d'un questionnaire et ont été complétées par des données provenant de diverses sources. Un score a été attribué aux indicateurs structurels, de procédure et d’impact et les pays ont été classés en fonction de leurs scores finals de performance. Des analyses de régression linéaires simples ont été réalisées pour identifier la relation entre le score de performance et les facteurs contributifs sélectionnés.
RÉSULTATS :
40 questionnaires ont été envoyés aux pays africains et 32 ont été reçus soit un taux de réponse de 80 %. Le score moyen de performance obtenu par les pays participants était de 19,25 ± 7,38. Ce score est la somme des scores structurels, de procédure et d'impact dont ils sont respectivement 11,93 ± 3,78, 4,03 ± 2,66 et 3,28 ± 2,09. Une corrélation a été établie entre le score de performance et la taille de la population, la pauvreté multidimensionnelle, l’ancienneté, la langue du pays et les facteurs pharmaceutiques.
DISCUSSION :
Les résultats ont montré une grande différence de performance entre les pays africains. Les facteurs contributifs définis peuvent jouer un rôle majeur, mais le plaidoyer et la continuité sont une condition sine qua non pour la pharmacovigilance et sa viabilité. La Liaison avec le réseau international et le partenariat régional avec échange d'expériences est essentielle.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0142014 Président : ADNAOUI.M Directeur : SOULAYMANI.R Juge : TAOUFIK.J Juge : ABOUQUAL.R Juge : SOULAYMANI.A Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité P0142014 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesPharm2014 Disponible P0142014-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesPharm2014 Disponible
Titre : Trypanosomiase humaine africaine : épidémiologie et prophylaxie Type de document : thèse Auteurs : Zakaria ZOUAKI, Auteur Année de publication : 2014 Langues : Français (fre) Mots-clés : Trypanosoma brucei gambiense Trypanosoma brucei rhodesiense Afrique glossine mouche tsé-tsé . Résumé : La trypanosomiase humaine africaine ou maladie du sommeil est une maladie parasitaire d’Afrique sub-saharienne transmise aux humains par la mouche tsé-tsé. Il existe deux types de maladie du sommeil, qui sont causées par deux sous espèces de parasites : Trypanosoma brucei gambiense, que l'on retrouve en Afrique occidentale et centrale, et Trypanosoma brucei rhodesiense, que l'on retrouve en Afrique orientale et en Afrique australe. La forme la plus répandue est due à Trypanosoma brucei gambiense.
La maladie suit deux stades. Chancre, trypanides, adénopathies, fièvre, céphalées, prurit et oedèmes au cours du premier stade ou stade lymphatico -sanguin. Le second stade, dit méningo-encéphalitique, se produit lorsque le parasite franchit la barrière hémato-encéphalique et envahit le système nerveux central. Les patients présentent alors des signes neurologiques: réflexes anormaux, troubles moteurs, troubles sensoriels et mouvements anormaux. La maladie progresse vers des troubles du rythme veille-sommeil, la détérioration mentale et, finalement, le coma. En l’absence de traitement, la maladie est mortelle.
L'homme est le réservoir du parasite Trypanosoma brucei gambiense. On peut donc lutter contre la trypanosomiase humaine africaine et contrôler sa transmission en procédant au dépistage de masse de la population et au traitement de tous les patients infectés. Le dépistage de masse nécessite des équipes mobiles qui visitent tous les villages de la zone touchée et qui effectuent un dépistage sur une proportion aussi élevée que possible de la population. La lutte antivectorielle est une autre composante importante de la lutte contre cette maladie.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M1002014 Président : ZOUHDI.M Directeur : EL HAMZAOUI.S Juge : SEKHSOKH.Y Juge : MRANI.S Juge : TELLAL.S Trypanosomiase humaine africaine : épidémiologie et prophylaxie [thèse] / Zakaria ZOUAKI, Auteur . - 2014.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Trypanosoma brucei gambiense Trypanosoma brucei rhodesiense Afrique glossine mouche tsé-tsé . Résumé : La trypanosomiase humaine africaine ou maladie du sommeil est une maladie parasitaire d’Afrique sub-saharienne transmise aux humains par la mouche tsé-tsé. Il existe deux types de maladie du sommeil, qui sont causées par deux sous espèces de parasites : Trypanosoma brucei gambiense, que l'on retrouve en Afrique occidentale et centrale, et Trypanosoma brucei rhodesiense, que l'on retrouve en Afrique orientale et en Afrique australe. La forme la plus répandue est due à Trypanosoma brucei gambiense.
La maladie suit deux stades. Chancre, trypanides, adénopathies, fièvre, céphalées, prurit et oedèmes au cours du premier stade ou stade lymphatico -sanguin. Le second stade, dit méningo-encéphalitique, se produit lorsque le parasite franchit la barrière hémato-encéphalique et envahit le système nerveux central. Les patients présentent alors des signes neurologiques: réflexes anormaux, troubles moteurs, troubles sensoriels et mouvements anormaux. La maladie progresse vers des troubles du rythme veille-sommeil, la détérioration mentale et, finalement, le coma. En l’absence de traitement, la maladie est mortelle.
L'homme est le réservoir du parasite Trypanosoma brucei gambiense. On peut donc lutter contre la trypanosomiase humaine africaine et contrôler sa transmission en procédant au dépistage de masse de la population et au traitement de tous les patients infectés. Le dépistage de masse nécessite des équipes mobiles qui visitent tous les villages de la zone touchée et qui effectuent un dépistage sur une proportion aussi élevée que possible de la population. La lutte antivectorielle est une autre composante importante de la lutte contre cette maladie.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M1002014 Président : ZOUHDI.M Directeur : EL HAMZAOUI.S Juge : SEKHSOKH.Y Juge : MRANI.S Juge : TELLAL.S Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité M1002014 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2014 Disponible M1002014-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2014 Disponible Documents numériques
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