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3 résultat(s) recherche sur le mot-clé 'المتفطرة السلية' 
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Titre : GENOMIC ANALYSIS OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN AFRICA REVEALED LINEAGE - DRUG RESISTANCE ASSOCIATION Type de document : thèse Auteurs : EL FATHI LALAOUI YASMINE, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : Mycobacterium tuberculosis Lineages Drug-resistance Genomic Analysis Africa Mycobacterium tuberculosis Lign ́ees resistance aux antibiotiques Analyse
G ́enomique Afrique المتفطرة السلية السالالت مقاومة األدوية التحليل الجيني إفريقياRésumé : Tuberculosis is a serious infectious respiratory disease caused by Mycobacterium
tuberculosis.
In this study, we used genomics, to determine the population structure of Mycobacterium
tuberculosis in Africa. Using the MTBseq pipeline, we analyzed samples from 28 different
African countries in order to determine the distribution of Mycobacterium tuberculosis
lineages as well as drug resistance in Africa and to verify the association between the two.
As a result, we have found out that the most dominant lineage is lineage 4 with a prevalence
of 54.33%, followed by lineage 3 (8.62%), 2 and 1 with a percentage of 7.41% and
7.31% respectively. West African lineages 6 and 5 have a prevalence of 3.61% and 1.25%
respectively, while lineage 7 with the lowest percentage of 0.58%.
We have also studied the association between lineages and drug resistance and the p value
for the drugs variable was 0.014 while it was 3.24*10-7
for lineages proving the presence
of an association between them.
Moreover, the number of sensitive and resistant samples was calculated and the result
showcased that the majority (12034) of samples were sensitive, 2512 samples were Multi-
Drug Resistant, 1674 samples are Mono-Drug resistant, 1198 samples are Pre-Extensively Drug
Resistant and 223 are resistant to other drugs.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0182022 Président : AANNIZ Tarik, Directeur : EL ALLALI Achraf ; LAAMARTI Mariam Co-encadrante Juge : BENTAYEBI Kaoutar GENOMIC ANALYSIS OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN AFRICA REVEALED LINEAGE - DRUG RESISTANCE ASSOCIATION [thèse] / EL FATHI LALAOUI YASMINE, Auteur . - 2022.
Langues : Anglais (eng)
Mots-clés : Mycobacterium tuberculosis Lineages Drug-resistance Genomic Analysis Africa Mycobacterium tuberculosis Lign ́ees resistance aux antibiotiques Analyse
G ́enomique Afrique المتفطرة السلية السالالت مقاومة األدوية التحليل الجيني إفريقياRésumé : Tuberculosis is a serious infectious respiratory disease caused by Mycobacterium
tuberculosis.
In this study, we used genomics, to determine the population structure of Mycobacterium
tuberculosis in Africa. Using the MTBseq pipeline, we analyzed samples from 28 different
African countries in order to determine the distribution of Mycobacterium tuberculosis
lineages as well as drug resistance in Africa and to verify the association between the two.
As a result, we have found out that the most dominant lineage is lineage 4 with a prevalence
of 54.33%, followed by lineage 3 (8.62%), 2 and 1 with a percentage of 7.41% and
7.31% respectively. West African lineages 6 and 5 have a prevalence of 3.61% and 1.25%
respectively, while lineage 7 with the lowest percentage of 0.58%.
We have also studied the association between lineages and drug resistance and the p value
for the drugs variable was 0.014 while it was 3.24*10-7
for lineages proving the presence
of an association between them.
Moreover, the number of sensitive and resistant samples was calculated and the result
showcased that the majority (12034) of samples were sensitive, 2512 samples were Multi-
Drug Resistant, 1674 samples are Mono-Drug resistant, 1198 samples are Pre-Extensively Drug
Resistant and 223 are resistant to other drugs.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0182022 Président : AANNIZ Tarik, Directeur : EL ALLALI Achraf ; LAAMARTI Mariam Co-encadrante Juge : BENTAYEBI Kaoutar Réservation
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Exemplaires
Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0182022 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible Documents numériques
MM0182022URL
Titre : PROFIL EPIDEMIOLOGIQUE DE LA TUBERCULOSE AU NIVEAU DE LA PREFECTURE DE SKHIRAT-TEMARA ENTRE 2014 ET 2019 Type de document : thèse Auteurs : MALKI ZAKARIA, Auteur Année de publication : 2023 Langues : Français (fre) Mots-clés : Tuberculose Mycobacterium Tuberculosis Epidémiologie MDR Observance thérapeutique Tuberculosis TB Mycobacterium tuberculosis Epidemiology Antituberculosis
drugs Multidrug resistant TB MDR Therapeutic compliance Lost to follow-up السل المتفطرة السلية الوبائيات األدوية المضادة للسل المقاومة االمتثال العالجي الحاالت
المفقودة من التتبع.Résumé : La tuberculose est une maladie évitable et curable, qui demeure un défi majeur pour la santé
publique à l'échelle mondiale, en particulier dans les pays en développement tel que le Maroc.
C’est une infection bactérienne, due à une mycobactérie du complexe tuberculosis, qui peut se
présenter sous diverses formes cliniques. Le traitement est bien codifié, toutefois, l’émergence des
souches multi-résistantes constitue une réelle menace.
L’objectif de ce travail est d’établir et d’analyser le profil épidémiologique de la tuberculose
dans la préfecture de Skhirat-Témara.
Il s’agit d’une étude rétrospective descriptive et analytique, étalée sur une période de 6ans
(2014-2019), concernant l’état et le devenir de 3411 cas de tuberculose déclarés et pris en charge
au sein du CDTMR de la préfecture de Skhirat-Témara.
Le taux d’incidence annuel moyen est de 91,6 cas pour 100000 habitants. L´atteinte
pulmonaire était plus fréquente que l´atteinte extrapulmonaire (52,1% vs 47,9%). Le sexe masculin
était plus touché que le sexe féminin (58,9% vs 41,1%). La majorité des cas recensés (66%)
correspondent à la tranche d’âge comprise entre 15 et 44 ans.
Le taux de succès thérapeutique enregistré dans notre étude était de 90,1%, alors que le taux
de létalité était de 3 %. Ainsi 0,5% des cas présentaient une tuberculose pharmacorésistante.
Le taux de patients perdus de vue (PDV) était de 4,28%, la majorité de ces patients (62%) sont
du sexe masculin et âgés de 15 à 40 ans. On note aussi que la grande part des PDV (76%) présentait
une TPM+.
La tuberculose demeure un problème de santé publique dans la préfecture de Skhirat-Témara,
où l'incidence est concentrée dans les quartiers défavorisés. La non-observance thérapeutique
entrave les progrès. D'importants efforts, à tous les niveaux, restent encore à déployer afin que le
pays puisse atteindre son objectif d´éradication de la maladie à l'horizon de 2030.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2632023 Président : Mimoun ZOUHDI Directeur : Mariama CHADLI Juge : Ahmed GAOUZI Juge : Saida TELLAL Juge : Hafida NAOUI PROFIL EPIDEMIOLOGIQUE DE LA TUBERCULOSE AU NIVEAU DE LA PREFECTURE DE SKHIRAT-TEMARA ENTRE 2014 ET 2019 [thèse] / MALKI ZAKARIA, Auteur . - 2023.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Tuberculose Mycobacterium Tuberculosis Epidémiologie MDR Observance thérapeutique Tuberculosis TB Mycobacterium tuberculosis Epidemiology Antituberculosis
drugs Multidrug resistant TB MDR Therapeutic compliance Lost to follow-up السل المتفطرة السلية الوبائيات األدوية المضادة للسل المقاومة االمتثال العالجي الحاالت
المفقودة من التتبع.Résumé : La tuberculose est une maladie évitable et curable, qui demeure un défi majeur pour la santé
publique à l'échelle mondiale, en particulier dans les pays en développement tel que le Maroc.
C’est une infection bactérienne, due à une mycobactérie du complexe tuberculosis, qui peut se
présenter sous diverses formes cliniques. Le traitement est bien codifié, toutefois, l’émergence des
souches multi-résistantes constitue une réelle menace.
L’objectif de ce travail est d’établir et d’analyser le profil épidémiologique de la tuberculose
dans la préfecture de Skhirat-Témara.
Il s’agit d’une étude rétrospective descriptive et analytique, étalée sur une période de 6ans
(2014-2019), concernant l’état et le devenir de 3411 cas de tuberculose déclarés et pris en charge
au sein du CDTMR de la préfecture de Skhirat-Témara.
Le taux d’incidence annuel moyen est de 91,6 cas pour 100000 habitants. L´atteinte
pulmonaire était plus fréquente que l´atteinte extrapulmonaire (52,1% vs 47,9%). Le sexe masculin
était plus touché que le sexe féminin (58,9% vs 41,1%). La majorité des cas recensés (66%)
correspondent à la tranche d’âge comprise entre 15 et 44 ans.
Le taux de succès thérapeutique enregistré dans notre étude était de 90,1%, alors que le taux
de létalité était de 3 %. Ainsi 0,5% des cas présentaient une tuberculose pharmacorésistante.
Le taux de patients perdus de vue (PDV) était de 4,28%, la majorité de ces patients (62%) sont
du sexe masculin et âgés de 15 à 40 ans. On note aussi que la grande part des PDV (76%) présentait
une TPM+.
La tuberculose demeure un problème de santé publique dans la préfecture de Skhirat-Témara,
où l'incidence est concentrée dans les quartiers défavorisés. La non-observance thérapeutique
entrave les progrès. D'importants efforts, à tous les niveaux, restent encore à déployer afin que le
pays puisse atteindre son objectif d´éradication de la maladie à l'horizon de 2030.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2632023 Président : Mimoun ZOUHDI Directeur : Mariama CHADLI Juge : Ahmed GAOUZI Juge : Saida TELLAL Juge : Hafida NAOUI Réservation
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Titre : SHOTGUN COMPARATIVE PROTEOMICS FOR IDENTIFICATION OF DRUG RESISTANCE SIGNATURES IN MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS ISOLATES Type de document : thèse Auteurs : ELHAOU FATIMA EZZAHRAA, Auteur Année de publication : 2023 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : Tuberculosis Mycobacterium tuberculosis Comparative-proteomics Mass spectrometry Drug resistance Tuberculose Mycobacterium tuberculosis Protéomique-comparative Spectrométrie de masse Résistance aux antituberculeux السل المتفطرة السلية البروتينات المقارنة مطياف الكتلة مقاومة الأدوية Résumé : Tuberculosis (TB) is a persistent global health issue, especially due to the emergence of drug-resistant strains. Although TB rates have decreased worldwide, it remains a significant problem in certain regions like Morocco. In this study, we employed a Label-Free shotgun comparative proteomic approach to analyse protein expression differences between drugresistant and drug-sensitive Mycobacterium tuberculosis (MTB) isolates. To conduct the proteomic analysis, we used trypsin digestion in a bottom-up proteomic strategy to generate peptide fragments for further analysis. Ultra High-Performance Liquid Chromatography coupled with tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) was utilized to separate and analyse these peptide fragments, enabling the identification and quantification of proteins in the drug-resistant and drug-sensitive MTB samples. By comparing the protein expression levels, we identified several proteins that were downregulated or upregulated in the multidrugresistant (MDR) samples compared to the drug-sensitive ones. Additionally, we quantified twenty proteins that were not expressed in the drug-sensitive samples and among these was the protein UPPP known to confer drug resistance to bacteria due its role in cell wall biosynthesis. Functional annotation and protein interaction networks were employed and elucidated the roles of these proteins in virulence and drug resistance mechanisms. Leveraging proteomic approaches to study the differential expression of these proteins holds great significance in exploring effective strategies for controlling drug resistance in Tuberculosis.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0202023 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : El ALLALI Achraf Juge : DAOUD Rachid Juge : BENTAYEBI Kaoutar SHOTGUN COMPARATIVE PROTEOMICS FOR IDENTIFICATION OF DRUG RESISTANCE SIGNATURES IN MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS ISOLATES [thèse] / ELHAOU FATIMA EZZAHRAA, Auteur . - 2023.
Langues : Anglais (eng)
Mots-clés : Tuberculosis Mycobacterium tuberculosis Comparative-proteomics Mass spectrometry Drug resistance Tuberculose Mycobacterium tuberculosis Protéomique-comparative Spectrométrie de masse Résistance aux antituberculeux السل المتفطرة السلية البروتينات المقارنة مطياف الكتلة مقاومة الأدوية Résumé : Tuberculosis (TB) is a persistent global health issue, especially due to the emergence of drug-resistant strains. Although TB rates have decreased worldwide, it remains a significant problem in certain regions like Morocco. In this study, we employed a Label-Free shotgun comparative proteomic approach to analyse protein expression differences between drugresistant and drug-sensitive Mycobacterium tuberculosis (MTB) isolates. To conduct the proteomic analysis, we used trypsin digestion in a bottom-up proteomic strategy to generate peptide fragments for further analysis. Ultra High-Performance Liquid Chromatography coupled with tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) was utilized to separate and analyse these peptide fragments, enabling the identification and quantification of proteins in the drug-resistant and drug-sensitive MTB samples. By comparing the protein expression levels, we identified several proteins that were downregulated or upregulated in the multidrugresistant (MDR) samples compared to the drug-sensitive ones. Additionally, we quantified twenty proteins that were not expressed in the drug-sensitive samples and among these was the protein UPPP known to confer drug resistance to bacteria due its role in cell wall biosynthesis. Functional annotation and protein interaction networks were employed and elucidated the roles of these proteins in virulence and drug resistance mechanisms. Leveraging proteomic approaches to study the differential expression of these proteins holds great significance in exploring effective strategies for controlling drug resistance in Tuberculosis.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0202023 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : El ALLALI Achraf Juge : DAOUD Rachid Juge : BENTAYEBI Kaoutar Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0202023 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible
