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Approche syndromique dans le diagnostic des infections respiratoires en milieu hospitalier / AZNAG Mohamed Amine
Titre : Approche syndromique dans le diagnostic des infections respiratoires en milieu hospitalier Type de document : thèse Auteurs : AZNAG Mohamed Amine, Auteur Année de publication : 2018 Langues : Français (fre) Mots-clés : Infection respiratoire PCR multiplex Filmarray Résumé : Les infections respiratoires aigües représentent un réel problème de santé publique au Maroc par sa morbi-mortalité et ses complications.L’approche syndromique est une nouvelle méthode de diagnostiquer les maladies infectieuses qui permet de rechercher simultanément et en un seul test l’ensemble des microorganismes les plus fréquemment responsables d’une infection.
La plateforme PCR multiplex actuellement disponible (BioFireFilmarrayrespiratory) effectue simultanément les analyses de 20 virus et bactéries.
Il s’agit d’une étude prospective réalisée au sein du laboratoire de microbiologie, virologie et biologie moléculaire de l’hôpital Militaire Avicenne de Marrakech de janvier à Mai 2018 portant sur les prélèvements nasopharyngés des patients atteint d’une infection respiratoire aigüe hospitalisés dans les différents services du CHU Mohammed VI de Marrakech.L’objectif de notre étude est d’évaluer l’apport de la PCR multiplex dans le diagnostic des infections respiratoires en milieu hospitalier.
Sur une période de 5 mois, 35 patients hospitalisés ont été inclus dans notre étude). 31.4 % des patients sont exposés au tabac. La toux était le symptôme le plus fréquent. 34% des radiographies du thorax réalisés ont montré des consolidations alvéolaires. Le taux de positivité était de 28.57 %, Le Rhinovirus était le plus détecté (n=8). On a identifié un cas de Coronavirus, et un cas d’Influenza A H3.L’évolution a été favorable chez 28 patients (80%), tandis qu’il y a eu 7 décès ayant un état clinique prédisposant.
L’approche syndromique dans le diagnostic des infections respiratoires a permis l’amélioration du diagnostic étiologique, une meilleure maitrise du risque infectieux viral, minimiser l’exposition aux antibiotiques et améliorer le parcours de soins.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2642018 Président : BELMEKKI.A Directeur : ZOUHAIR.S Juge : BELYAMANI.L Juge : GAOUZI.A Approche syndromique dans le diagnostic des infections respiratoires en milieu hospitalier [thèse] / AZNAG Mohamed Amine, Auteur . - 2018.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Infection respiratoire PCR multiplex Filmarray Résumé : Les infections respiratoires aigües représentent un réel problème de santé publique au Maroc par sa morbi-mortalité et ses complications.L’approche syndromique est une nouvelle méthode de diagnostiquer les maladies infectieuses qui permet de rechercher simultanément et en un seul test l’ensemble des microorganismes les plus fréquemment responsables d’une infection.
La plateforme PCR multiplex actuellement disponible (BioFireFilmarrayrespiratory) effectue simultanément les analyses de 20 virus et bactéries.
Il s’agit d’une étude prospective réalisée au sein du laboratoire de microbiologie, virologie et biologie moléculaire de l’hôpital Militaire Avicenne de Marrakech de janvier à Mai 2018 portant sur les prélèvements nasopharyngés des patients atteint d’une infection respiratoire aigüe hospitalisés dans les différents services du CHU Mohammed VI de Marrakech.L’objectif de notre étude est d’évaluer l’apport de la PCR multiplex dans le diagnostic des infections respiratoires en milieu hospitalier.
Sur une période de 5 mois, 35 patients hospitalisés ont été inclus dans notre étude). 31.4 % des patients sont exposés au tabac. La toux était le symptôme le plus fréquent. 34% des radiographies du thorax réalisés ont montré des consolidations alvéolaires. Le taux de positivité était de 28.57 %, Le Rhinovirus était le plus détecté (n=8). On a identifié un cas de Coronavirus, et un cas d’Influenza A H3.L’évolution a été favorable chez 28 patients (80%), tandis qu’il y a eu 7 décès ayant un état clinique prédisposant.
L’approche syndromique dans le diagnostic des infections respiratoires a permis l’amélioration du diagnostic étiologique, une meilleure maitrise du risque infectieux viral, minimiser l’exposition aux antibiotiques et améliorer le parcours de soins.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2642018 Président : BELMEKKI.A Directeur : ZOUHAIR.S Juge : BELYAMANI.L Juge : GAOUZI.A Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité M2642018 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2018 Disponible M2642018-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2018 Disponible
Titre : DIAGNOSTIC PAR PCR MULTIPLEX DE L’INFECTION A VIRUS RESPIRATOIRE SYNCYTIAL (VRS) Type de document : thèse Auteurs : MEDKOURI Aya, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : VRS Diagnostic PCR multiplex RSV -Diagnosis Multiplex PCR VRS التشخیص PCR multiplex Résumé : entrainant une bronchiolite. Dans le contexte de pandémie de SARS-CoV-2, une approche
syndromique est privilégiée. Le diagnostic simultané de 23 pathogènes par PCR multiplex
aide à la détection de ces agents infectieux.
MATERIELS ET METHODES: Nous avons réalisé une étude descriptive, rétrospective,
des infections respiratoires détectées par PCR Multiplex du 1erjanvier au 31 août 2021.
RESULTATS: Sur 492 échantillons, 333 étaient positifs à au moins un pathogène soit
67,7%. Le VRS a été détecté dans 116 cas soit 23,6%. Le VRS se retrouve en deuxième
position après le Rhinovirus/Enterovirus qui a été détecté dans 136 échantillons soit 27,6%.
Sur les 116 échantillons positifs au VRS, le sex ratio M/F est estimé à 1,41. 75% des patients
positifs avaient moins de deux ans (p<0,001). Le principal service prescripteur était le service
de Pédiatrie 1 avec 175 demandes suivi par le service de Réanimation Médicale avec 157
demandes. Le taux de détection du VRS a été le plus haut au cours du mois de juin 2021 avec
69 prélèvements positifs sur 78 soit 88%. Les signes cliniques retrouvés chez les patients
positifs au VRS sont la toux chez 98 patients (89%) et une fièvre >38°C chez 87 patients (soit
79% de l’effectif total).
Le VRS a été retrouvé en co-détection avec le SARS-CoV-2 dans cinq cas soit 4,5% des
échantillons positifs au VRS.
CONCLUSION: La saisonnalité du VRS a été décalée vers les mois d’été (juin, juillet et
août). Le sexe masculin et l’âge inférieur à deux ans sont des facteurs de risque significatifs
d’une IRAB au VRS. Les signes cliniques ne permettent pas de distinguer entre deux
infections respiratoires en période d’épidémie.Numéro (Thèse ou Mémoire) : M1932022 Président : Idriss LAHLOU AMINE Directeur : Myriam SEFFAR Juge : Chafik MAHRAOUI Juge : Tarek DENDANE DIAGNOSTIC PAR PCR MULTIPLEX DE L’INFECTION A VIRUS RESPIRATOIRE SYNCYTIAL (VRS) [thèse] / MEDKOURI Aya, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : VRS Diagnostic PCR multiplex RSV -Diagnosis Multiplex PCR VRS التشخیص PCR multiplex Résumé : entrainant une bronchiolite. Dans le contexte de pandémie de SARS-CoV-2, une approche
syndromique est privilégiée. Le diagnostic simultané de 23 pathogènes par PCR multiplex
aide à la détection de ces agents infectieux.
MATERIELS ET METHODES: Nous avons réalisé une étude descriptive, rétrospective,
des infections respiratoires détectées par PCR Multiplex du 1erjanvier au 31 août 2021.
RESULTATS: Sur 492 échantillons, 333 étaient positifs à au moins un pathogène soit
67,7%. Le VRS a été détecté dans 116 cas soit 23,6%. Le VRS se retrouve en deuxième
position après le Rhinovirus/Enterovirus qui a été détecté dans 136 échantillons soit 27,6%.
Sur les 116 échantillons positifs au VRS, le sex ratio M/F est estimé à 1,41. 75% des patients
positifs avaient moins de deux ans (p<0,001). Le principal service prescripteur était le service
de Pédiatrie 1 avec 175 demandes suivi par le service de Réanimation Médicale avec 157
demandes. Le taux de détection du VRS a été le plus haut au cours du mois de juin 2021 avec
69 prélèvements positifs sur 78 soit 88%. Les signes cliniques retrouvés chez les patients
positifs au VRS sont la toux chez 98 patients (89%) et une fièvre >38°C chez 87 patients (soit
79% de l’effectif total).
Le VRS a été retrouvé en co-détection avec le SARS-CoV-2 dans cinq cas soit 4,5% des
échantillons positifs au VRS.
CONCLUSION: La saisonnalité du VRS a été décalée vers les mois d’été (juin, juillet et
août). Le sexe masculin et l’âge inférieur à deux ans sont des facteurs de risque significatifs
d’une IRAB au VRS. Les signes cliniques ne permettent pas de distinguer entre deux
infections respiratoires en période d’épidémie.Numéro (Thèse ou Mémoire) : M1932022 Président : Idriss LAHLOU AMINE Directeur : Myriam SEFFAR Juge : Chafik MAHRAOUI Juge : Tarek DENDANE Réservation
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M1932022URL ETUDE MOLECULAIRE DU GENE DE LA DYSTROPHINE CHEZ LES PATIENTS ATTEINTS DE DYSTROPHIE MUSCULAIRE DE DUCHENNE (DMD) ET DE BECKER (DMB) DE LA REGION DE L'ORIENTAL. / MESSAOUDI Maryam
Titre : ETUDE MOLECULAIRE DU GENE DE LA DYSTROPHINE CHEZ LES PATIENTS ATTEINTS DE DYSTROPHIE MUSCULAIRE DE DUCHENNE (DMD) ET DE BECKER (DMB) DE LA REGION DE L'ORIENTAL. Type de document : thèse Auteurs : MESSAOUDI Maryam, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : Dystrophinopathie Duchenne Becker PCR Multiplex délétion Dystrophinopathy Duchenne Becker multiplex PCR deletion الضمور العضلي دوشين بيكر تفاعل البوليميراز المتسلسل المتعدد الحذف. Résumé : Les dystrophinopathies représentées principalement par la dystrophie musculaire de
Duchenne (DMD) et sa variante allélique, la dystrophie musculaire de Becker (BMD) sont les
premières causes de myopathie de l'enfant de sexe masculin. Elles sont transmises selon un
mode récessif lié à l’X. Ces maladies sont dues à un large spectre de mutations du gène de la
dystrophine (DMD).
L'objectif de cette étude est de rapporter les différents aspects cliniques et moléculaires des
patients recrutés au sien de la biobanque de la région de l’Orientale présentant un phénotype
de dystrophinopathie.
L’ADN de 35 patients a été analysé par PCR multiplex pour déterminer les exons délétés dans
le gène DMD, afin d’estimer la fréquence de cette anomalie et aussi d’évaluer les résultats
obtenus par une comparaison entre le génotype et le phénotype clinique. En résultat, 31% des
patients présentent des délétions du gène DMD dont 90,9% sont de phénotype DMD. La
région hotspots 3’ est la plus fréquemment délétée (85,7%), de préférence au niveau de
séquence 49-50 (42,86%).
Cette étude a permis d’identifier les délétions du gène de la dystrophine les plus fréquentes
chez les patients de la région de l’Oriental. Ces résultats avaient généré des données
considérables sur les réarrangements mutationnels susceptibles de promouvoir de futures
thérapies expérimentales au Maroc.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0432022 Président : BENTAYEBI Kaoutar Directeur : CHARIF Majida Juge : BOULOUIZ Redouane Juge : ELIDRISSI ERRAHHALI Mounia ETUDE MOLECULAIRE DU GENE DE LA DYSTROPHINE CHEZ LES PATIENTS ATTEINTS DE DYSTROPHIE MUSCULAIRE DE DUCHENNE (DMD) ET DE BECKER (DMB) DE LA REGION DE L'ORIENTAL. [thèse] / MESSAOUDI Maryam, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Dystrophinopathie Duchenne Becker PCR Multiplex délétion Dystrophinopathy Duchenne Becker multiplex PCR deletion الضمور العضلي دوشين بيكر تفاعل البوليميراز المتسلسل المتعدد الحذف. Résumé : Les dystrophinopathies représentées principalement par la dystrophie musculaire de
Duchenne (DMD) et sa variante allélique, la dystrophie musculaire de Becker (BMD) sont les
premières causes de myopathie de l'enfant de sexe masculin. Elles sont transmises selon un
mode récessif lié à l’X. Ces maladies sont dues à un large spectre de mutations du gène de la
dystrophine (DMD).
L'objectif de cette étude est de rapporter les différents aspects cliniques et moléculaires des
patients recrutés au sien de la biobanque de la région de l’Orientale présentant un phénotype
de dystrophinopathie.
L’ADN de 35 patients a été analysé par PCR multiplex pour déterminer les exons délétés dans
le gène DMD, afin d’estimer la fréquence de cette anomalie et aussi d’évaluer les résultats
obtenus par une comparaison entre le génotype et le phénotype clinique. En résultat, 31% des
patients présentent des délétions du gène DMD dont 90,9% sont de phénotype DMD. La
région hotspots 3’ est la plus fréquemment délétée (85,7%), de préférence au niveau de
séquence 49-50 (42,86%).
Cette étude a permis d’identifier les délétions du gène de la dystrophine les plus fréquentes
chez les patients de la région de l’Oriental. Ces résultats avaient généré des données
considérables sur les réarrangements mutationnels susceptibles de promouvoir de futures
thérapies expérimentales au Maroc.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0432022 Président : BENTAYEBI Kaoutar Directeur : CHARIF Majida Juge : BOULOUIZ Redouane Juge : ELIDRISSI ERRAHHALI Mounia Réservation
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MM0432022URL VINGT-SEPT ANS DE DIAGNOSTIC MOLÉCULAIRE DES DYSTROPHINOPATHIE PAR PCR MULTIPLEX AU MAROC - A PROPOS D'UNE SÉRIE DE 365 CAS / SELOUANI YASSIR
Titre : VINGT-SEPT ANS DE DIAGNOSTIC MOLÉCULAIRE DES DYSTROPHINOPATHIE PAR PCR MULTIPLEX AU MAROC - A PROPOS D'UNE SÉRIE DE 365 CAS Type de document : thèse Auteurs : SELOUANI YASSIR, Auteur Année de publication : 2020 Langues : Français (fre) Mots-clés : Becker Duchenne Dystrophinopathie PCR multiplex Délétion Résumé : Les dystrophinopathies sont les maladies neuromusculaires d’origine génétique les plus fréquentes dans la population pédiatrique. Elles regroupent deux entités : la Dystrophinomyopathie de Duchenne (DMD, MIM≠310200) et celle de Becker (BMD, MIM≠300376). Caractérisées par une transmission récessive liée à l’X, ces maladies sont dues à un large spectre de mutations du gène de la Dystrophine (DMD) en Xp21.2.
L’objectif de ce travail est de déterminer la fréquence des différentes délétions du gène DMD chez les patients marocains myopathes.
Nous avons analysé les données de 365 garçons, avec une suspicion de dystrophinopathie, référés au Département de Génétique Médicale de l’Institut National d’Hygiène entre Novembre 1992 et Janvier 2019, testés par PCR multiplex à la rechercher les délétions d’exons fréquentes du gène DMD.
Parmi les 365 patients analysés, 163 soit 44,66% avaient une délétion du gène DMD. Dans notre cohorte, cinquante combinaisons de délétions différentes ont été identifiées. La délétion la plus fréquente s’étendait de l’exon 48 à l’exon 50, présente chez 12 patients (7,36%), suivie par la délétion de l’exon 45, présente chez 10 patients (6,13%).
Au total, 98,16% des délétions étaient localisées au niveau d’au moins un des 2 hotspots connus, dont 73,01% au niveau du hotspot 5’ (Exon 44 à 52), 17,18% au niveau du hotspot 3’ (Exon 3 à 19) et seulement 7,98% des délétions étaient étalées sur les deux hotspots.
La PCR multiplex reste une approche diagnostique phare dans les dystrophinopathies avec un excellent rapport coût-bénéfice, même à l’ère des nouvelles technologies de séquençage à haut débit, encore difficilement applicables à large échelle dans notre pays.Numéro (Thèse ou Mémoire) : M4032020 Président : RATBI ILHAM Directeur : SEFIANI ABDELAZIZ Juge : AGADR AOMAR Juge : KRIOUILE YAMNA Juge : ABILKASSEM RACHID VINGT-SEPT ANS DE DIAGNOSTIC MOLÉCULAIRE DES DYSTROPHINOPATHIE PAR PCR MULTIPLEX AU MAROC - A PROPOS D'UNE SÉRIE DE 365 CAS [thèse] / SELOUANI YASSIR, Auteur . - 2020.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Becker Duchenne Dystrophinopathie PCR multiplex Délétion Résumé : Les dystrophinopathies sont les maladies neuromusculaires d’origine génétique les plus fréquentes dans la population pédiatrique. Elles regroupent deux entités : la Dystrophinomyopathie de Duchenne (DMD, MIM≠310200) et celle de Becker (BMD, MIM≠300376). Caractérisées par une transmission récessive liée à l’X, ces maladies sont dues à un large spectre de mutations du gène de la Dystrophine (DMD) en Xp21.2.
L’objectif de ce travail est de déterminer la fréquence des différentes délétions du gène DMD chez les patients marocains myopathes.
Nous avons analysé les données de 365 garçons, avec une suspicion de dystrophinopathie, référés au Département de Génétique Médicale de l’Institut National d’Hygiène entre Novembre 1992 et Janvier 2019, testés par PCR multiplex à la rechercher les délétions d’exons fréquentes du gène DMD.
Parmi les 365 patients analysés, 163 soit 44,66% avaient une délétion du gène DMD. Dans notre cohorte, cinquante combinaisons de délétions différentes ont été identifiées. La délétion la plus fréquente s’étendait de l’exon 48 à l’exon 50, présente chez 12 patients (7,36%), suivie par la délétion de l’exon 45, présente chez 10 patients (6,13%).
Au total, 98,16% des délétions étaient localisées au niveau d’au moins un des 2 hotspots connus, dont 73,01% au niveau du hotspot 5’ (Exon 44 à 52), 17,18% au niveau du hotspot 3’ (Exon 3 à 19) et seulement 7,98% des délétions étaient étalées sur les deux hotspots.
La PCR multiplex reste une approche diagnostique phare dans les dystrophinopathies avec un excellent rapport coût-bénéfice, même à l’ère des nouvelles technologies de séquençage à haut débit, encore difficilement applicables à large échelle dans notre pays.Numéro (Thèse ou Mémoire) : M4032020 Président : RATBI ILHAM Directeur : SEFIANI ABDELAZIZ Juge : AGADR AOMAR Juge : KRIOUILE YAMNA Juge : ABILKASSEM RACHID Réservation
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Exemplaires
Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité M4032020 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2020 Disponible M4032020-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2020 Disponible Documents numériques
M4032020URL