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MISE EN PLACE D’UN WORKFLOW POUR L’ÉTUDE PHARMACOGÉNÉTIQUE DES ANTIVITAMINES K / NAHM-TCHOUGLI Christiana Philippa Linanipo
Titre : MISE EN PLACE D’UN WORKFLOW POUR L’ÉTUDE PHARMACOGÉNÉTIQUE DES ANTIVITAMINES K Type de document : thèse Auteurs : NAHM-TCHOUGLI Christiana Philippa Linanipo, Auteur Langues : Français (fre) Mots-clés : Pharmacogénétique PCR-RFLP Antivitamines K SNP Optimisation Résumé : L’avènement des « OMICS » et la maitrise des biomarqueurs tels que les SNP impliqués dans les différents processus physiopathologiques ont impacté la pratique médicale en permettant une prise en charge personnalisée du patient
Bien que l’on ait identifié des associations entre des polymorphismes génétiques, la dose etla réponse aux antivitamines K , leurs applications ne sont pas encore intégrées dans la pratique médicale au Maroc faute du coût ,du délai associés aux tests génétiques, de la disponibilité des tests, des considérations éthiques et du manque de données probantes .
L’objectif de notre étude est de mettre en place un processus intégrant tout le flux des techniques qui entrent dans la réalisation du génotypage des six polymorphismes impliqués dans la pharmacogénétique des antivitamines K (l’acenocoumarol) au sein de la population marocaine. Il s’agit de : VKORC1-1639 G>A, VKORC1 1173 C>T, CYP2C9*2, CYP2C9*3, CYP4F2 1347 G>A et GGCX 12970 C>G.
Nous avons procédé à l’analyse des six SNP à partir de l’ADN génomique des patients sous acenocoumarol. Le processus inclut une étape d’extraction à partir du sang par deux méthodes : une classique au phénol/ chloroforme et une autre par chromatographie échangeuse d’ions. Les gènes ont été amplifiés par PCR classique. Les amplicons purifiés ont été génotypés pour tous les SNP étudiés en utilisant la technique RFLP. Les produits après digestion enzymatique par des endonucléases ont été analysés sur un gel d'agarose à 2% et 3%.
Les résultats après électrophorèse des produits digérés ont montré des bandes de fragments d’ADNtraduisant des phénotypes soit sauvages (WT), (soit) mutés (Mut) ou hétérozygotes (Htz) pour chacun des gènes.
Cette méthode d’étude appliquée à grande échelle dans la population marocaine servirait à établir un algorithme de prédiction de dose de l’acenocoumarol ou d’autres médicaments.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0242019 Président : MESSAOUDI.N Directeur : IBRAHIMI.A Juge : EL HAFIDI.N Juge : LAKHAL.Z Juge : BOUSLIMAN.Y MISE EN PLACE D’UN WORKFLOW POUR L’ÉTUDE PHARMACOGÉNÉTIQUE DES ANTIVITAMINES K [thèse] / NAHM-TCHOUGLI Christiana Philippa Linanipo, Auteur . - [s.d.].
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Pharmacogénétique PCR-RFLP Antivitamines K SNP Optimisation Résumé : L’avènement des « OMICS » et la maitrise des biomarqueurs tels que les SNP impliqués dans les différents processus physiopathologiques ont impacté la pratique médicale en permettant une prise en charge personnalisée du patient
Bien que l’on ait identifié des associations entre des polymorphismes génétiques, la dose etla réponse aux antivitamines K , leurs applications ne sont pas encore intégrées dans la pratique médicale au Maroc faute du coût ,du délai associés aux tests génétiques, de la disponibilité des tests, des considérations éthiques et du manque de données probantes .
L’objectif de notre étude est de mettre en place un processus intégrant tout le flux des techniques qui entrent dans la réalisation du génotypage des six polymorphismes impliqués dans la pharmacogénétique des antivitamines K (l’acenocoumarol) au sein de la population marocaine. Il s’agit de : VKORC1-1639 G>A, VKORC1 1173 C>T, CYP2C9*2, CYP2C9*3, CYP4F2 1347 G>A et GGCX 12970 C>G.
Nous avons procédé à l’analyse des six SNP à partir de l’ADN génomique des patients sous acenocoumarol. Le processus inclut une étape d’extraction à partir du sang par deux méthodes : une classique au phénol/ chloroforme et une autre par chromatographie échangeuse d’ions. Les gènes ont été amplifiés par PCR classique. Les amplicons purifiés ont été génotypés pour tous les SNP étudiés en utilisant la technique RFLP. Les produits après digestion enzymatique par des endonucléases ont été analysés sur un gel d'agarose à 2% et 3%.
Les résultats après électrophorèse des produits digérés ont montré des bandes de fragments d’ADNtraduisant des phénotypes soit sauvages (WT), (soit) mutés (Mut) ou hétérozygotes (Htz) pour chacun des gènes.
Cette méthode d’étude appliquée à grande échelle dans la population marocaine servirait à établir un algorithme de prédiction de dose de l’acenocoumarol ou d’autres médicaments.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0242019 Président : MESSAOUDI.N Directeur : IBRAHIMI.A Juge : EL HAFIDI.N Juge : LAKHAL.Z Juge : BOUSLIMAN.Y Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité P0242019 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesPharm2019 Disponible P0242019-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesPharm2019 Disponible Documents numériques
P0242019URL RECHERCHE DES POLYMORPHISMES DU GENE CYP2C9 IMPLIQUE DANS LA VARIABILITE DE LA REPONSE AUX ANTI-VITAMINES K / ALTURK HAMZA
Titre : RECHERCHE DES POLYMORPHISMES DU GENE CYP2C9 IMPLIQUE DANS LA VARIABILITE DE LA REPONSE AUX ANTI-VITAMINES K Type de document : thèse Auteurs : ALTURK HAMZA, Auteur Année de publication : 2023 Langues : Français (fre) Mots-clés : Pharmacogénétique AVK gène CYP2C9 PCR-RFLP Médecine personnalisée Génotypage البحث عن متحورات الجين المرتبط بتباين الاستجابة لمضادات الفيتامين CYP2C9 K Pharmacogenetics VKAs CYP2C9 gene PCR-RFLP Personalized medicine Genotyping Résumé : Les antivitamines K, sont des médicaments prescrits pour diverses pathologies, telles que la thrombose veineuse profonde, l'embolie pulmonaire. En inhibant le processus de coagulation, les antivitamines K contribuent à réduire le risque de formation de caillots sanguins pouvant entraîner des complications graves telles que des accidents vasculaires cérébraux. Mais, leur efficacité et leur sécurité peuvent varier considérablement d'un individu à un autre. Des études antérieures ont révélé que le polymorphisme génétique du gène CYP2C9, qui code pour une enzyme du cytochrome P450 impliquée dans le métabolisme des antivitamines K, pourrait jouer un rôle crucial dans la réponse individuelle à ces médicaments.
Les polymorphismes du gène CYP2C9 ont été détecté et évalué à partir d’une trentaine d’échantillons d’ADN provenant d’une DNAthèque assez riche en matériel génétique extrait, pendant des études antérieures, des patients marocains.
Le gène CYP2C9 a été amplifié par PCR, puis nous avons utilisé la RFLP afin de détecter la variante CYP2C9*2 (rs1799853). En évaluant les caractéristiques génétiques de la population, cette étude a révélé deux génotypes du gène CYP2C9 (homozygote sauvage 96,6% et 3,4% hétérozygote) avec absence du génotype doublement muté, tandis que les fréquences alléliques C, T sont respectivement 0,98 et 0,02.
Malgré les avancées dans notre compréhension des facteurs pharmacogénomiques et cliniques, l'origine de plus de 40 % de la variabilité de la réponse à la dose des AVK reste incertaine. Il est important de noter que des recherches supplémentaires sont nécessaires pour mieux les comprendre et les intégrer dans la pratique clinique.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0022023 Président : ELJAOUDI RACHID Directeur : LOUATI SARA Juge : OUADGHIRI MOUNA Juge : AANNIZ Tarik RECHERCHE DES POLYMORPHISMES DU GENE CYP2C9 IMPLIQUE DANS LA VARIABILITE DE LA REPONSE AUX ANTI-VITAMINES K [thèse] / ALTURK HAMZA, Auteur . - 2023.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Pharmacogénétique AVK gène CYP2C9 PCR-RFLP Médecine personnalisée Génotypage البحث عن متحورات الجين المرتبط بتباين الاستجابة لمضادات الفيتامين CYP2C9 K Pharmacogenetics VKAs CYP2C9 gene PCR-RFLP Personalized medicine Genotyping Résumé : Les antivitamines K, sont des médicaments prescrits pour diverses pathologies, telles que la thrombose veineuse profonde, l'embolie pulmonaire. En inhibant le processus de coagulation, les antivitamines K contribuent à réduire le risque de formation de caillots sanguins pouvant entraîner des complications graves telles que des accidents vasculaires cérébraux. Mais, leur efficacité et leur sécurité peuvent varier considérablement d'un individu à un autre. Des études antérieures ont révélé que le polymorphisme génétique du gène CYP2C9, qui code pour une enzyme du cytochrome P450 impliquée dans le métabolisme des antivitamines K, pourrait jouer un rôle crucial dans la réponse individuelle à ces médicaments.
Les polymorphismes du gène CYP2C9 ont été détecté et évalué à partir d’une trentaine d’échantillons d’ADN provenant d’une DNAthèque assez riche en matériel génétique extrait, pendant des études antérieures, des patients marocains.
Le gène CYP2C9 a été amplifié par PCR, puis nous avons utilisé la RFLP afin de détecter la variante CYP2C9*2 (rs1799853). En évaluant les caractéristiques génétiques de la population, cette étude a révélé deux génotypes du gène CYP2C9 (homozygote sauvage 96,6% et 3,4% hétérozygote) avec absence du génotype doublement muté, tandis que les fréquences alléliques C, T sont respectivement 0,98 et 0,02.
Malgré les avancées dans notre compréhension des facteurs pharmacogénomiques et cliniques, l'origine de plus de 40 % de la variabilité de la réponse à la dose des AVK reste incertaine. Il est important de noter que des recherches supplémentaires sont nécessaires pour mieux les comprendre et les intégrer dans la pratique clinique.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0022023 Président : ELJAOUDI RACHID Directeur : LOUATI SARA Juge : OUADGHIRI MOUNA Juge : AANNIZ Tarik Réservation
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