| Titre : | Etude épidemio-moléculaire des virus émergents (influenza virus A(H1N1)pdm09 et West Nile Virus) dans la population marocaine (2009-2012) | | Type de document : | thèse | | Auteurs : | Hicham EL RHAFFOULI, Auteur | | Année de publication : | 2015 | | Langues : | Français (fre) | | Mots-clés : | Virus influenza A(H1N1)pdm09, West Nile virus inhibition de l’hémagglutination séroneutralisation RT-PCR séquençage phylogénie Maroc. | | Résumé : | Dans cette étude, nous nous sommes proposés d’étudier les caractéristiques épidémiomoléculaire
de deux virus émergents au Maroc, le virus influenza A(H1N1)pdm09 et le West
Nile virus (WNV).
Concernant la première partie de notre travail, nous avons commencé par l’étude des
caractéristiques épidémio-cliniques de l’infection à virus influenza A(H1N1)pdm09 chez les
patients consultants à l’Hôpital Militaire d’Instruction Mohammed V de Rabat. Cette étude a
été complétée par une enquête sérologique dans les régions de Rabat et de Meknès par
inhibition de l’hémagglutination (IHA) ainsi que le séquençage de la partie HA1 du gène de
l’hémagglutinine d’une sélection représentative de souches marocaines. Les données du
séquençage ont également été utilisées pour réaliser l’analyse phylogénétique. Les résultats
obtenus ont montré que l’infection à virus influenza A(H1N1)pdm09 a concerné principalement
des jeunes patients âgés de moins de 40 ans avec 76% des cas. Les signes cliniques de
l’infection étaient comparables à ceux de la grippe saisonnière avec une prédominance de la
toux (83%) et de la fièvre (81%). L’étude sérologique a démontré que La prévalence globale
des anticorps inhibant l’hémagglutination au niveau de la région de Rabat (67 %) est
significativement plus élevée que celle de Meknès (53 %). Les sujets âgés de moins de 25 ans
issus de la région de Rabat présentaient le taux d’infection le plus élevé avec un Odds Ratio
de 2,45. Le taux de vaccination anti-A(H1N1)pdm09 dans la région de Rabat est de 7 %.La
comparaison des séquences des souches a démontré que les virus qui ont circulé entre 2009 et
2011 présentent une grande homologie avec la souche vaccinale
A/California/07/2009(H1N1). L’analyse phylogénétique a révélé la co-circulation de 3
groupes génétiques bien identifiés avec des proportions de 64%, 32% et 4% pour les groupes
A/England/676/2010(H1N1), A/Astrakhan/1/2011(H1N1) et A/Christchurch/16/2010(H1N1)
respectivement.
Concernant la deuxième partie de notre travail, nous avons réalisé des enquêtes sérologiques
pour la recherche des anticorps anti-WNV par séroneutralisation chez la population humaine
au niveau de 4 régions du Maroc. Ces études ont été complétées par la mise au point de
techniques de diagnostic moléculaire par RT-PCR conventionnelle et en temps réel. Les
résultats obtenus ont confirmé la circulation du WNV chez la population marocaine avec des
prévalences variables en fonction des régions. Ainsi les prévalences les plus élevées ont été
détectées au niveau des régions de Kénitra et de Rabat avec des taux de 18,8% et de 12%
respectivement. Par contre, cette prévalence n’est que de 4,7% au niveau de l’intérieur du
pays (région de Meknès) et de 5,2% au niveau des provinces du Sud (région de Dakhla). Par
ailleurs, Les protocoles de RT-PCR développés au niveau du Laboratoire de Recherche et de
Biosécurité P3, permettent la détection des souches marocaines à partir de plusieurs types de
prélèvements et offre une bonne alternative au techniques commerciales en terme de
disponibilité, d’économie et praticité. | | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | D0082014 | | Président : | LOUZI.L | | Directeur : | LAHLOU AMINE.I | | Juge : | FASSI FIHRI.O | | Juge : | SEKHSOKH.Y | | Juge : | RABHI.M |
Etude épidemio-moléculaire des virus émergents (influenza virus A(H1N1)pdm09 et West Nile Virus) dans la population marocaine (2009-2012) [thèse] / Hicham EL RHAFFOULI, Auteur . - 2015. Langues : Français ( fre) | Mots-clés : | Virus influenza A(H1N1)pdm09, West Nile virus inhibition de l’hémagglutination séroneutralisation RT-PCR séquençage phylogénie Maroc. | | Résumé : | Dans cette étude, nous nous sommes proposés d’étudier les caractéristiques épidémiomoléculaire
de deux virus émergents au Maroc, le virus influenza A(H1N1)pdm09 et le West
Nile virus (WNV).
Concernant la première partie de notre travail, nous avons commencé par l’étude des
caractéristiques épidémio-cliniques de l’infection à virus influenza A(H1N1)pdm09 chez les
patients consultants à l’Hôpital Militaire d’Instruction Mohammed V de Rabat. Cette étude a
été complétée par une enquête sérologique dans les régions de Rabat et de Meknès par
inhibition de l’hémagglutination (IHA) ainsi que le séquençage de la partie HA1 du gène de
l’hémagglutinine d’une sélection représentative de souches marocaines. Les données du
séquençage ont également été utilisées pour réaliser l’analyse phylogénétique. Les résultats
obtenus ont montré que l’infection à virus influenza A(H1N1)pdm09 a concerné principalement
des jeunes patients âgés de moins de 40 ans avec 76% des cas. Les signes cliniques de
l’infection étaient comparables à ceux de la grippe saisonnière avec une prédominance de la
toux (83%) et de la fièvre (81%). L’étude sérologique a démontré que La prévalence globale
des anticorps inhibant l’hémagglutination au niveau de la région de Rabat (67 %) est
significativement plus élevée que celle de Meknès (53 %). Les sujets âgés de moins de 25 ans
issus de la région de Rabat présentaient le taux d’infection le plus élevé avec un Odds Ratio
de 2,45. Le taux de vaccination anti-A(H1N1)pdm09 dans la région de Rabat est de 7 %.La
comparaison des séquences des souches a démontré que les virus qui ont circulé entre 2009 et
2011 présentent une grande homologie avec la souche vaccinale
A/California/07/2009(H1N1). L’analyse phylogénétique a révélé la co-circulation de 3
groupes génétiques bien identifiés avec des proportions de 64%, 32% et 4% pour les groupes
A/England/676/2010(H1N1), A/Astrakhan/1/2011(H1N1) et A/Christchurch/16/2010(H1N1)
respectivement.
Concernant la deuxième partie de notre travail, nous avons réalisé des enquêtes sérologiques
pour la recherche des anticorps anti-WNV par séroneutralisation chez la population humaine
au niveau de 4 régions du Maroc. Ces études ont été complétées par la mise au point de
techniques de diagnostic moléculaire par RT-PCR conventionnelle et en temps réel. Les
résultats obtenus ont confirmé la circulation du WNV chez la population marocaine avec des
prévalences variables en fonction des régions. Ainsi les prévalences les plus élevées ont été
détectées au niveau des régions de Kénitra et de Rabat avec des taux de 18,8% et de 12%
respectivement. Par contre, cette prévalence n’est que de 4,7% au niveau de l’intérieur du
pays (région de Meknès) et de 5,2% au niveau des provinces du Sud (région de Dakhla). Par
ailleurs, Les protocoles de RT-PCR développés au niveau du Laboratoire de Recherche et de
Biosécurité P3, permettent la détection des souches marocaines à partir de plusieurs types de
prélèvements et offre une bonne alternative au techniques commerciales en terme de
disponibilité, d’économie et praticité. | | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | D0082014 | | Président : | LOUZI.L | | Directeur : | LAHLOU AMINE.I | | Juge : | FASSI FIHRI.O | | Juge : | SEKHSOKH.Y | | Juge : | RABHI.M |
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