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Titre : DIAGNOSTIC VIROLOGIQUE DE L’INFECTION A SARS-COV-2 : EXPERIENCE DU LABORATOIRE CENTRAL DE VIROLOGIE DU CHU IBN SINA Type de document : thèse Auteurs : ZOUBIR KAOUTAR, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : SARS-COV-2 COVID 19 Diagnostic Epidémiologie Symptomatologie RT-PCR Charge virale SARS-CoV-2 COVID-19 diagnosis epidemiology symptomatology RT-PCR viral load كورونا-سارس -2 مرض كوفيد 19 ،تشخيص علم األوبئة األعراض PCR-RT الحمل الفيروسي Résumé : Introduction : Le COVID-19 est une infection respiratoire aiguë, hautement contagieuse, causée par
le SARS-CoV-2. L’impact de la pandémie sur les différents systèmes de santé était accablant.
L’objectif de notre travail est de décrire le rôle du laboratoire dans le diagnostic virologique de
l’infection par le SARS-CoV-2 ainsi que de faire une analyse épidémiologique, clinique et
virologique.
Matériels et méthodes : Il s’agit d’une étude descriptive rétrospective, intéressant une série de cas,
réalisée au Laboratoire Central de Virologie (LCV) du CHU Ibn Sina, Hôpital des spécialités, Rabat,
sur une période de 12 mois, entre Avril 2020 et Mars 2021. Le diagnostic virologique s’est basé sur
une extraction automatisée de l’ARN viral suivie d’une RT-PCR en temps réel, selon la technologie
Taqman, utilisant le kit MAScIR.
Résultats : Durant notre étude, nous avons analysé 4002 échantillons provenant du CHU avec un
résultat RT-PCR positif pour le SARS-CoV-2. La médiane d’âge était de 44 ans avec un intervalle
interquartile de [29 ; 60]. Le sexe ratio H/F était de 0,77. Le pic de cas était situé au mois de
Novembre 2020.
Les comorbidités les plus fréquentes étaient le diabète (31%) et l’hypertension artérielle (28%).
Les signes cliniques étaient dominés par la fièvre (55%), la toux (53%), les céphalées (29 %), la
dyspnée (28%), les myalgies (26%) et le mal de gorge (26%). 10% des cas étaient asymptomatiques.
Le pourcentage des asymptomatiques chez les femmes était plus élevé que chez les hommes. Les
enfants présentaient aussi plus de formes asymptomatiques. Le pourcentage des cas symptomatiques
était plus élevé parmi les patients diabétiques (99,2%) que parmi les patients non diabétiques (93,1%).
Selon les valeurs des Ct des gènes cibles, la population de l’étude a été répartie en positif fort (29%),
positif (53%) et positif faible (18%). Le pourcentage de positifs faibles était plus élevé chez les enfants
que chez les adultes. Les patients réinfectés par le SARS-CoV-2 ont présenté des charges virales plus
faibles. Les charges virales étaient plus élevées chez les patients présentant les symptômes suivants :
mal de gorge, myalgies, céphalées, anosmie, agueusie. Elles étaient plus faibles chez les patients
présentant les symptômes suivants : dyspnée et détresse respiratoire. La charge virale n’était pas
influencée par la présence ou non de symptômes, soulignant le potentiel de propagation du virus par
les cas asymptomatiques.
Conclusion : L’impact de la pandémie sur le LCV a révélé l’importance de la coordination entre de
multiples partenaires et du soutien envers les professionnels de santé qui ont dû affronter plusieurs
défis et contraintes. Cette étude a démontré une association significative entre plusieurs paramètres
épidémiologiques, cliniques et virologiques du COVID-19. Ce travail a fait ressortir, entre autres,
l’importance des mesures prophylactiques pour la lutte contre cette pandémie et pourrait servir de
référence pour des études ultérieures sur les données virologiques de l’infection à SARS-CoV-2.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2312022 Président : Abdelkader ERROUGANI Directeur : Myriame SEFFAR Juge : Hakima KABBAJ Juge : Amine Idriss LAHLOU Juge : Redouane ABOUQUAL DIAGNOSTIC VIROLOGIQUE DE L’INFECTION A SARS-COV-2 : EXPERIENCE DU LABORATOIRE CENTRAL DE VIROLOGIE DU CHU IBN SINA [thèse] / ZOUBIR KAOUTAR, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : SARS-COV-2 COVID 19 Diagnostic Epidémiologie Symptomatologie RT-PCR Charge virale SARS-CoV-2 COVID-19 diagnosis epidemiology symptomatology RT-PCR viral load كورونا-سارس -2 مرض كوفيد 19 ،تشخيص علم األوبئة األعراض PCR-RT الحمل الفيروسي Résumé : Introduction : Le COVID-19 est une infection respiratoire aiguë, hautement contagieuse, causée par
le SARS-CoV-2. L’impact de la pandémie sur les différents systèmes de santé était accablant.
L’objectif de notre travail est de décrire le rôle du laboratoire dans le diagnostic virologique de
l’infection par le SARS-CoV-2 ainsi que de faire une analyse épidémiologique, clinique et
virologique.
Matériels et méthodes : Il s’agit d’une étude descriptive rétrospective, intéressant une série de cas,
réalisée au Laboratoire Central de Virologie (LCV) du CHU Ibn Sina, Hôpital des spécialités, Rabat,
sur une période de 12 mois, entre Avril 2020 et Mars 2021. Le diagnostic virologique s’est basé sur
une extraction automatisée de l’ARN viral suivie d’une RT-PCR en temps réel, selon la technologie
Taqman, utilisant le kit MAScIR.
Résultats : Durant notre étude, nous avons analysé 4002 échantillons provenant du CHU avec un
résultat RT-PCR positif pour le SARS-CoV-2. La médiane d’âge était de 44 ans avec un intervalle
interquartile de [29 ; 60]. Le sexe ratio H/F était de 0,77. Le pic de cas était situé au mois de
Novembre 2020.
Les comorbidités les plus fréquentes étaient le diabète (31%) et l’hypertension artérielle (28%).
Les signes cliniques étaient dominés par la fièvre (55%), la toux (53%), les céphalées (29 %), la
dyspnée (28%), les myalgies (26%) et le mal de gorge (26%). 10% des cas étaient asymptomatiques.
Le pourcentage des asymptomatiques chez les femmes était plus élevé que chez les hommes. Les
enfants présentaient aussi plus de formes asymptomatiques. Le pourcentage des cas symptomatiques
était plus élevé parmi les patients diabétiques (99,2%) que parmi les patients non diabétiques (93,1%).
Selon les valeurs des Ct des gènes cibles, la population de l’étude a été répartie en positif fort (29%),
positif (53%) et positif faible (18%). Le pourcentage de positifs faibles était plus élevé chez les enfants
que chez les adultes. Les patients réinfectés par le SARS-CoV-2 ont présenté des charges virales plus
faibles. Les charges virales étaient plus élevées chez les patients présentant les symptômes suivants :
mal de gorge, myalgies, céphalées, anosmie, agueusie. Elles étaient plus faibles chez les patients
présentant les symptômes suivants : dyspnée et détresse respiratoire. La charge virale n’était pas
influencée par la présence ou non de symptômes, soulignant le potentiel de propagation du virus par
les cas asymptomatiques.
Conclusion : L’impact de la pandémie sur le LCV a révélé l’importance de la coordination entre de
multiples partenaires et du soutien envers les professionnels de santé qui ont dû affronter plusieurs
défis et contraintes. Cette étude a démontré une association significative entre plusieurs paramètres
épidémiologiques, cliniques et virologiques du COVID-19. Ce travail a fait ressortir, entre autres,
l’importance des mesures prophylactiques pour la lutte contre cette pandémie et pourrait servir de
référence pour des études ultérieures sur les données virologiques de l’infection à SARS-CoV-2.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2312022 Président : Abdelkader ERROUGANI Directeur : Myriame SEFFAR Juge : Hakima KABBAJ Juge : Amine Idriss LAHLOU Juge : Redouane ABOUQUAL Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité M2312022 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMed2022 Disponible Documents numériques
M2312022URL
Titre : DIAGNOSTIC VIROLOGIQUE DU VIRUS DE LA RAGE : MISE AU POINT DE LA TECHNIQUE RT-PCR AU LABORATOIRE DE VIROLOGIE DE L’HMIMV Type de document : thèse Auteurs : Khalil BELKHAYAT, Auteur Année de publication : 2023 Langues : Français (fre) Mots-clés : Virus Rabique Diagnostic RT-PCR Laboratoire Résumé : La Rage est une zoonose virale largement répandue dans le monde, c’est une
encéphalomyélite transmise accidentellement à l’homme par le chien (98%).
La Rage humaine est une urgence diagnostique et prophylactique, c’est une maladie à
déclaration obligatoire. En l’absence d’un traitement curatif à ce jour, la Rage humaine est mortelle
en dehors d’une prophylaxie post exposition adaptée.
Le diagnostic rapide et précis de l’infection rabique est essentiel pour des stratégies de
contrôle et de prévention efficaces. Cela est entravé par le manque de structures habilitées, l’institut
pasteur de Casablanca est à ce jour le seul laboratoire au Maroc qui réalise cette prestation de
diagnostic biologique de la rage. A travers cette étude, nous avons cherché à mettre au point un test
PCR en temps réel pour la détection du lyssavirus dans le laboratoire de Virologie de l’HMIMV.
Le test PCR en temps réel a été mis au point pour cibler une région conservée du génome du
lyssavirus de la rage. Une série de test PCR a été menée dans le laboratoire de sécurité biologique 3,
l’extraction a été réalisée de façon automatisée par le biais du biorobot de QIAGEN EZ1 Advanced
XL utilisant le kit spécifique EZ1, ensuite l’amplification a été réalisé sur le Thermocycleur Cobas
Z 480 en utilisant les sondes et les amorces spécifiques du Kit TibMolBiol. Des prélèvements de
Salive, du LCR et de biopsie cutanée ont été analysés à l'aide du test mis au point. Les résultats de la
RT-PCR en temps réel ont été validés en utilisant un contrôle négatif et un contrôle positif du Kit
TibMolBiol.Numéro (Thèse ou Mémoire) : M1962023 Président : Ahmed GAOUZI Directeur : Rachid ÂBI Juge : Mohamed EL QATNI Juge : Elarbi BOUAITI DIAGNOSTIC VIROLOGIQUE DU VIRUS DE LA RAGE : MISE AU POINT DE LA TECHNIQUE RT-PCR AU LABORATOIRE DE VIROLOGIE DE L’HMIMV [thèse] / Khalil BELKHAYAT, Auteur . - 2023.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Virus Rabique Diagnostic RT-PCR Laboratoire Résumé : La Rage est une zoonose virale largement répandue dans le monde, c’est une
encéphalomyélite transmise accidentellement à l’homme par le chien (98%).
La Rage humaine est une urgence diagnostique et prophylactique, c’est une maladie à
déclaration obligatoire. En l’absence d’un traitement curatif à ce jour, la Rage humaine est mortelle
en dehors d’une prophylaxie post exposition adaptée.
Le diagnostic rapide et précis de l’infection rabique est essentiel pour des stratégies de
contrôle et de prévention efficaces. Cela est entravé par le manque de structures habilitées, l’institut
pasteur de Casablanca est à ce jour le seul laboratoire au Maroc qui réalise cette prestation de
diagnostic biologique de la rage. A travers cette étude, nous avons cherché à mettre au point un test
PCR en temps réel pour la détection du lyssavirus dans le laboratoire de Virologie de l’HMIMV.
Le test PCR en temps réel a été mis au point pour cibler une région conservée du génome du
lyssavirus de la rage. Une série de test PCR a été menée dans le laboratoire de sécurité biologique 3,
l’extraction a été réalisée de façon automatisée par le biais du biorobot de QIAGEN EZ1 Advanced
XL utilisant le kit spécifique EZ1, ensuite l’amplification a été réalisé sur le Thermocycleur Cobas
Z 480 en utilisant les sondes et les amorces spécifiques du Kit TibMolBiol. Des prélèvements de
Salive, du LCR et de biopsie cutanée ont été analysés à l'aide du test mis au point. Les résultats de la
RT-PCR en temps réel ont été validés en utilisant un contrôle négatif et un contrôle positif du Kit
TibMolBiol.Numéro (Thèse ou Mémoire) : M1962023 Président : Ahmed GAOUZI Directeur : Rachid ÂBI Juge : Mohamed EL QATNI Juge : Elarbi BOUAITI Réservation
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Titre : ESTIMATION DE L'EFFICACITE DU VACCIN CONTRE LA COVID-19 SELON LES RESULTATS DES TESTS PCR EN TEMPS REEL (BIOER GENEFINDER) Type de document : thèse Auteurs : ACHLOUJI MOHAMED, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : ة، RT-PCR Sars-Cov-2 19 كوفيد لقاح vaccin Covid-19 Sars-Cov-2 RT-PCR efficacité vaccine Covid-19 Sars-Cov-2 RT-PCR efficacy Résumé : Depuis le développement des vaccins contre le nouveau coronavirus 2 du syndrome
respiratoire aigu sévère (SARS CoV-2), à l’origine de la maladie à coronavirus 2019
(COVID-19), plusieurs questions fondamentales demeurent quant à l’efficacité des vaccins
contre la COVID-19 en situation réelle.
Seules des études sur l’efficacité des vaccins et précisément en relation avec des facteurs
tels que l’âge et le sexe peuvent y apporter des réponses.
Il s’agit donc d’une étude rétrospective, observationnelle et comparative, utilisant
une collection des données des patients prélevés au Laboratoire International à l’intérieur
de l’unité biologie moléculaire à Sidi Kacem.
Après analyse des données, la comparaison entre les tests a donné une
augmentation de 82% d’efficacité après la vaccination. Nos résultats montrent
qu’après la vaccination, le plus grand pourcentage de l'efficacité des vaccins
appartient aux femmes en général, et aux femmes aux extrémités d'âge en particulier.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0042022 Président : OUADCHIRI Mouna Directeur : BAHJI Mostafa Juge : KANDOUSSI Ilham ESTIMATION DE L'EFFICACITE DU VACCIN CONTRE LA COVID-19 SELON LES RESULTATS DES TESTS PCR EN TEMPS REEL (BIOER GENEFINDER) [thèse] / ACHLOUJI MOHAMED, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : ة، RT-PCR Sars-Cov-2 19 كوفيد لقاح vaccin Covid-19 Sars-Cov-2 RT-PCR efficacité vaccine Covid-19 Sars-Cov-2 RT-PCR efficacy Résumé : Depuis le développement des vaccins contre le nouveau coronavirus 2 du syndrome
respiratoire aigu sévère (SARS CoV-2), à l’origine de la maladie à coronavirus 2019
(COVID-19), plusieurs questions fondamentales demeurent quant à l’efficacité des vaccins
contre la COVID-19 en situation réelle.
Seules des études sur l’efficacité des vaccins et précisément en relation avec des facteurs
tels que l’âge et le sexe peuvent y apporter des réponses.
Il s’agit donc d’une étude rétrospective, observationnelle et comparative, utilisant
une collection des données des patients prélevés au Laboratoire International à l’intérieur
de l’unité biologie moléculaire à Sidi Kacem.
Après analyse des données, la comparaison entre les tests a donné une
augmentation de 82% d’efficacité après la vaccination. Nos résultats montrent
qu’après la vaccination, le plus grand pourcentage de l'efficacité des vaccins
appartient aux femmes en général, et aux femmes aux extrémités d'âge en particulier.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0042022 Président : OUADCHIRI Mouna Directeur : BAHJI Mostafa Juge : KANDOUSSI Ilham Réservation
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MM0042022URL
Titre : Etude épidemio-moléculaire des virus émergents (influenza virus A(H1N1)pdm09 et West Nile Virus) dans la population marocaine (2009-2012) Type de document : thèse Auteurs : Hicham EL RHAFFOULI, Auteur Année de publication : 2015 Langues : Français (fre) Mots-clés : Virus influenza A(H1N1)pdm09, West Nile virus inhibition de l’hémagglutination séroneutralisation RT-PCR séquençage phylogénie Maroc. Résumé : Dans cette étude, nous nous sommes proposés d’étudier les caractéristiques épidémiomoléculaire
de deux virus émergents au Maroc, le virus influenza A(H1N1)pdm09 et le West
Nile virus (WNV).
Concernant la première partie de notre travail, nous avons commencé par l’étude des
caractéristiques épidémio-cliniques de l’infection à virus influenza A(H1N1)pdm09 chez les
patients consultants à l’Hôpital Militaire d’Instruction Mohammed V de Rabat. Cette étude a
été complétée par une enquête sérologique dans les régions de Rabat et de Meknès par
inhibition de l’hémagglutination (IHA) ainsi que le séquençage de la partie HA1 du gène de
l’hémagglutinine d’une sélection représentative de souches marocaines. Les données du
séquençage ont également été utilisées pour réaliser l’analyse phylogénétique. Les résultats
obtenus ont montré que l’infection à virus influenza A(H1N1)pdm09 a concerné principalement
des jeunes patients âgés de moins de 40 ans avec 76% des cas. Les signes cliniques de
l’infection étaient comparables à ceux de la grippe saisonnière avec une prédominance de la
toux (83%) et de la fièvre (81%). L’étude sérologique a démontré que La prévalence globale
des anticorps inhibant l’hémagglutination au niveau de la région de Rabat (67 %) est
significativement plus élevée que celle de Meknès (53 %). Les sujets âgés de moins de 25 ans
issus de la région de Rabat présentaient le taux d’infection le plus élevé avec un Odds Ratio
de 2,45. Le taux de vaccination anti-A(H1N1)pdm09 dans la région de Rabat est de 7 %.La
comparaison des séquences des souches a démontré que les virus qui ont circulé entre 2009 et
2011 présentent une grande homologie avec la souche vaccinale
A/California/07/2009(H1N1). L’analyse phylogénétique a révélé la co-circulation de 3
groupes génétiques bien identifiés avec des proportions de 64%, 32% et 4% pour les groupes
A/England/676/2010(H1N1), A/Astrakhan/1/2011(H1N1) et A/Christchurch/16/2010(H1N1)
respectivement.
Concernant la deuxième partie de notre travail, nous avons réalisé des enquêtes sérologiques
pour la recherche des anticorps anti-WNV par séroneutralisation chez la population humaine
au niveau de 4 régions du Maroc. Ces études ont été complétées par la mise au point de
techniques de diagnostic moléculaire par RT-PCR conventionnelle et en temps réel. Les
résultats obtenus ont confirmé la circulation du WNV chez la population marocaine avec des
prévalences variables en fonction des régions. Ainsi les prévalences les plus élevées ont été
détectées au niveau des régions de Kénitra et de Rabat avec des taux de 18,8% et de 12%
respectivement. Par contre, cette prévalence n’est que de 4,7% au niveau de l’intérieur du
pays (région de Meknès) et de 5,2% au niveau des provinces du Sud (région de Dakhla). Par
ailleurs, Les protocoles de RT-PCR développés au niveau du Laboratoire de Recherche et de
Biosécurité P3, permettent la détection des souches marocaines à partir de plusieurs types de
prélèvements et offre une bonne alternative au techniques commerciales en terme de
disponibilité, d’économie et praticité.Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0082014 Président : LOUZI.L Directeur : LAHLOU AMINE.I Juge : FASSI FIHRI.O Juge : SEKHSOKH.Y Juge : RABHI.M Etude épidemio-moléculaire des virus émergents (influenza virus A(H1N1)pdm09 et West Nile Virus) dans la population marocaine (2009-2012) [thèse] / Hicham EL RHAFFOULI, Auteur . - 2015.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Virus influenza A(H1N1)pdm09, West Nile virus inhibition de l’hémagglutination séroneutralisation RT-PCR séquençage phylogénie Maroc. Résumé : Dans cette étude, nous nous sommes proposés d’étudier les caractéristiques épidémiomoléculaire
de deux virus émergents au Maroc, le virus influenza A(H1N1)pdm09 et le West
Nile virus (WNV).
Concernant la première partie de notre travail, nous avons commencé par l’étude des
caractéristiques épidémio-cliniques de l’infection à virus influenza A(H1N1)pdm09 chez les
patients consultants à l’Hôpital Militaire d’Instruction Mohammed V de Rabat. Cette étude a
été complétée par une enquête sérologique dans les régions de Rabat et de Meknès par
inhibition de l’hémagglutination (IHA) ainsi que le séquençage de la partie HA1 du gène de
l’hémagglutinine d’une sélection représentative de souches marocaines. Les données du
séquençage ont également été utilisées pour réaliser l’analyse phylogénétique. Les résultats
obtenus ont montré que l’infection à virus influenza A(H1N1)pdm09 a concerné principalement
des jeunes patients âgés de moins de 40 ans avec 76% des cas. Les signes cliniques de
l’infection étaient comparables à ceux de la grippe saisonnière avec une prédominance de la
toux (83%) et de la fièvre (81%). L’étude sérologique a démontré que La prévalence globale
des anticorps inhibant l’hémagglutination au niveau de la région de Rabat (67 %) est
significativement plus élevée que celle de Meknès (53 %). Les sujets âgés de moins de 25 ans
issus de la région de Rabat présentaient le taux d’infection le plus élevé avec un Odds Ratio
de 2,45. Le taux de vaccination anti-A(H1N1)pdm09 dans la région de Rabat est de 7 %.La
comparaison des séquences des souches a démontré que les virus qui ont circulé entre 2009 et
2011 présentent une grande homologie avec la souche vaccinale
A/California/07/2009(H1N1). L’analyse phylogénétique a révélé la co-circulation de 3
groupes génétiques bien identifiés avec des proportions de 64%, 32% et 4% pour les groupes
A/England/676/2010(H1N1), A/Astrakhan/1/2011(H1N1) et A/Christchurch/16/2010(H1N1)
respectivement.
Concernant la deuxième partie de notre travail, nous avons réalisé des enquêtes sérologiques
pour la recherche des anticorps anti-WNV par séroneutralisation chez la population humaine
au niveau de 4 régions du Maroc. Ces études ont été complétées par la mise au point de
techniques de diagnostic moléculaire par RT-PCR conventionnelle et en temps réel. Les
résultats obtenus ont confirmé la circulation du WNV chez la population marocaine avec des
prévalences variables en fonction des régions. Ainsi les prévalences les plus élevées ont été
détectées au niveau des régions de Kénitra et de Rabat avec des taux de 18,8% et de 12%
respectivement. Par contre, cette prévalence n’est que de 4,7% au niveau de l’intérieur du
pays (région de Meknès) et de 5,2% au niveau des provinces du Sud (région de Dakhla). Par
ailleurs, Les protocoles de RT-PCR développés au niveau du Laboratoire de Recherche et de
Biosécurité P3, permettent la détection des souches marocaines à partir de plusieurs types de
prélèvements et offre une bonne alternative au techniques commerciales en terme de
disponibilité, d’économie et praticité.Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0082014 Président : LOUZI.L Directeur : LAHLOU AMINE.I Juge : FASSI FIHRI.O Juge : SEKHSOKH.Y Juge : RABHI.M Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité D0082014 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Doctorat SVS 2015 Disponible D0082014-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Doctorat SVS 2015 Disponible
Titre : ETUDE DE PERFORMANCE DE LA METHODE ABBOTT ID-NOW PAR RAPPORT A LA METHODE MULTIPLEX EUROBIOLPLEX SARS-COV-2 POUR LA DETECTION DE SARS-COV-2 A PARTIR DES ECHANTILLONS NASOPHARYNGES Type de document : thèse Auteurs : ZOUAOUI Amal, Auteur Année de publication : 2023 Langues : Français (fre) Mots-clés : Abbott ID-Now COVID-19 SRAS-CoV-2 Écouvillons nasopharyngés. Diagnostic moléculaire RT-PCR Résumé : Introduction : Le virus SARS-CoV-2 est apparu à Wuhan en décembre 2019 en chine, et depuis,
il s’est rapidement répandu dans le monde entier. Ceci a été à l’origine des millions de
contaminations et des milliers de décès à travers le monde. L'initiative visant à étendre et à
accélérer les tests a allégé l'examen minutieux auquel sont normalement soumis les nouveaux
tests avant leur mise sur le marché. Cela oblige les laboratoires cliniques à évaluer plus
soigneusement les performances globales des diverses plates-formes d'essai qui se développent
rapidement avant leur mise en œuvre.
Notre étude a pour objectif d’évaluer la performance du test moléculaire rapide ID-NOW pour
la détection du SARS-COV-2 en comparaison avec la méthode de référence RT-PCR.
Matériels et méthodes : Il s’agit d’une étude prospective réalisée sur 224 échantillons des
patients en consultation externe, hospitalisés ou du service d'urgence. Les prélèvements
effectués étaient des écouvillons nasopharyngés reçus dans un milieu de transport
universel VIRCELL. Chaque échantillon a été traité de façon concomitante par les 2 méthodes
objet de cette étude : Méthode de référence RT-PCR et le Test moléculaire rapide ID-Now
COVID-19.
Résultats: Notre étude a porté sur 224 échantillons dont 154 se sont avérés positifs et 70 négatifs
à la RT-PCR (méthode de référence). La totalité des prélèvements négatifs par la RT-PCR
étaient aussi négatifs par ID-NOW. Cependant, parmi les 154 prélèvements qui étaient positifs
à la RT-PCR, 32 prélèvements se sont révélés négatifs par ID-Now. La sensibilité globale du
test ID-Now était de 79,22% et sa spécificité globale de 100%. Sa valeur prédictive positive
était de 79,22% et sa valeur prédictive négative de 68,63%. La sensibilité du test ID-Now était
de 31,91% pour les échantillons dont le Ct est faible, 100% pour les échantillons dont le Ct est
moyen et 100% pour les échantillons dont les Ct est élevé.
Conclusion : Cette étude met en évidence une limite importante de l'ID Now dans le cas des
échantillons à faibles concentrations virales.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MS1232023 Directeur : AABI Rachid ETUDE DE PERFORMANCE DE LA METHODE ABBOTT ID-NOW PAR RAPPORT A LA METHODE MULTIPLEX EUROBIOLPLEX SARS-COV-2 POUR LA DETECTION DE SARS-COV-2 A PARTIR DES ECHANTILLONS NASOPHARYNGES [thèse] / ZOUAOUI Amal, Auteur . - 2023.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Abbott ID-Now COVID-19 SRAS-CoV-2 Écouvillons nasopharyngés. Diagnostic moléculaire RT-PCR Résumé : Introduction : Le virus SARS-CoV-2 est apparu à Wuhan en décembre 2019 en chine, et depuis,
il s’est rapidement répandu dans le monde entier. Ceci a été à l’origine des millions de
contaminations et des milliers de décès à travers le monde. L'initiative visant à étendre et à
accélérer les tests a allégé l'examen minutieux auquel sont normalement soumis les nouveaux
tests avant leur mise sur le marché. Cela oblige les laboratoires cliniques à évaluer plus
soigneusement les performances globales des diverses plates-formes d'essai qui se développent
rapidement avant leur mise en œuvre.
Notre étude a pour objectif d’évaluer la performance du test moléculaire rapide ID-NOW pour
la détection du SARS-COV-2 en comparaison avec la méthode de référence RT-PCR.
Matériels et méthodes : Il s’agit d’une étude prospective réalisée sur 224 échantillons des
patients en consultation externe, hospitalisés ou du service d'urgence. Les prélèvements
effectués étaient des écouvillons nasopharyngés reçus dans un milieu de transport
universel VIRCELL. Chaque échantillon a été traité de façon concomitante par les 2 méthodes
objet de cette étude : Méthode de référence RT-PCR et le Test moléculaire rapide ID-Now
COVID-19.
Résultats: Notre étude a porté sur 224 échantillons dont 154 se sont avérés positifs et 70 négatifs
à la RT-PCR (méthode de référence). La totalité des prélèvements négatifs par la RT-PCR
étaient aussi négatifs par ID-NOW. Cependant, parmi les 154 prélèvements qui étaient positifs
à la RT-PCR, 32 prélèvements se sont révélés négatifs par ID-Now. La sensibilité globale du
test ID-Now était de 79,22% et sa spécificité globale de 100%. Sa valeur prédictive positive
était de 79,22% et sa valeur prédictive négative de 68,63%. La sensibilité du test ID-Now était
de 31,91% pour les échantillons dont le Ct est faible, 100% pour les échantillons dont le Ct est
moyen et 100% pour les échantillons dont les Ct est élevé.
Conclusion : Cette étude met en évidence une limite importante de l'ID Now dans le cas des
échantillons à faibles concentrations virales.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MS1232023 Directeur : AABI Rachid Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MS1232023 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Spécialités Disponible
Titre : EVALUATION DE TROIS TESTS RAPIDES ANTIGÉNIQUES DANS LE DIAGNOSTIC DU SARS-COV-2 Type de document : thèse Auteurs : Rim EL BACHA, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : RT-PCR COVID-19 TDR Résumé : Introduction : La RT-PCR a été désignée comme le test de référence pour le diagnostic
de la COVID-19. Les autres alternatives diagnostiques sont les tests de diagnostic rapide
antigéniques (TDR). Nous avons mené une évaluation des performances de trois tests:
FREND ® (FA), STANDARD Q (SA), PANBIO ™(PA) par rapport aux résultats de RTPCR.
Matériel et méthodes : Il s’agit d’une étude d’une cohorte de 240 patients, en trois
groupes de 80 patients selon le délai d’apparition des symptômes : le groupe S1, entre J0 et J5
de symptomatologie, pour le S2 au-delà de J5 de symptomatologie et le S3 asymptomatique.
Tous les prélèvements ont été traités par PCR en temps réel et les 3 TDR.
Résultats : Dans le groupe S1, la sensibilité du PA est de 100 %, celle du SA est de
98%, celle du FA COVID-19 est de 77%. La Valeur prédictive négative est de 100% pour le
PA, 89% pour le SA et 33% pour le FA. Dans le groupe S2, la sensibilité du PA est de 81%,
celle du SA est de 78 % et, celle du FA COVID-19 est de 49%. La valeur prédictive négative
est de 58 % pour le PA, 54% pour le SA et enfin 34 % pour le FA. La spécificité et la valeur
prédictive positive est aux alentours de 100% pour les 3 kits.
Discussion et conclusion: La recommandation de l’OMS concernant les tests
antigéniques est d’atteindre un minimum de performance de 80% de sensibilité et de 97% de
spécificité. Notre étude a confirmé la bonne sensibilité et spécificité des tests antigéniques PA
et SA. La performance est maximale durant les 5 premiers jours de symptomatologie.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MS0612022 Directeur : Rachid ABI -Rida TAGAJDID EVALUATION DE TROIS TESTS RAPIDES ANTIGÉNIQUES DANS LE DIAGNOSTIC DU SARS-COV-2 [thèse] / Rim EL BACHA, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : RT-PCR COVID-19 TDR Résumé : Introduction : La RT-PCR a été désignée comme le test de référence pour le diagnostic
de la COVID-19. Les autres alternatives diagnostiques sont les tests de diagnostic rapide
antigéniques (TDR). Nous avons mené une évaluation des performances de trois tests:
FREND ® (FA), STANDARD Q (SA), PANBIO ™(PA) par rapport aux résultats de RTPCR.
Matériel et méthodes : Il s’agit d’une étude d’une cohorte de 240 patients, en trois
groupes de 80 patients selon le délai d’apparition des symptômes : le groupe S1, entre J0 et J5
de symptomatologie, pour le S2 au-delà de J5 de symptomatologie et le S3 asymptomatique.
Tous les prélèvements ont été traités par PCR en temps réel et les 3 TDR.
Résultats : Dans le groupe S1, la sensibilité du PA est de 100 %, celle du SA est de
98%, celle du FA COVID-19 est de 77%. La Valeur prédictive négative est de 100% pour le
PA, 89% pour le SA et 33% pour le FA. Dans le groupe S2, la sensibilité du PA est de 81%,
celle du SA est de 78 % et, celle du FA COVID-19 est de 49%. La valeur prédictive négative
est de 58 % pour le PA, 54% pour le SA et enfin 34 % pour le FA. La spécificité et la valeur
prédictive positive est aux alentours de 100% pour les 3 kits.
Discussion et conclusion: La recommandation de l’OMS concernant les tests
antigéniques est d’atteindre un minimum de performance de 80% de sensibilité et de 97% de
spécificité. Notre étude a confirmé la bonne sensibilité et spécificité des tests antigéniques PA
et SA. La performance est maximale durant les 5 premiers jours de symptomatologie.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MS0612022 Directeur : Rachid ABI -Rida TAGAJDID Réservation
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Titre : INFECTIONS NEONATALES : ÉTAT DES LIEUX AU MAROC ET APPORT DU DIAGNOSTIC BIOLOGIQUE ET MOLECULAIRE DANS LA PRISE EN CHARGE Type de document : thèse Auteurs : Kenza HATTOUFI, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : Nouveau-né Nourrisson Rubéole Système de notification Toxoplasmose Séroprévalence Infection néonatale Pneumonie RT-PCR Newborn Infant Rubella Reporting system Toxoplasmosis Seroprevalence Neonatal infection Pneumonia RT-PCR حديثي الوالدة رضيع الحصبة األلمانية، نظام اإلبالغ داء المقوسات االنتشار المصلي عدوى حديثي
الوالدة االلتهاب الرئوي PCR-RTRésumé : Ce travail, réalisé au sein du Centre National de Référence en Néonatologie et Nutrition de
l'Hôpital d'Enfants du CHU-Rabat, met en lumière quatre maladies infectieuses qui touchent le
fœtus, le nouveau-né et le nourrisson. Il s’agit de la rubéole, de la toxoplasmose, de l’infection
néonatale bactérienne précoce et de la pneumonie.
Le premier volet de cette thèse a été consacré à la rubéole et la toxoplasmose dont les agents
pathogènes peuvent être transmis au fœtus au cours de la grossesse en causant respectivement le
syndrome de rubéole congénitale (SRC) et la toxoplasmose congénitale (TC).
Parmi les femmes ayant déjà effectué une sérologie de la rubéole, 85 % étaient immunisées.
En effet, la vaccination des femmes en âge de procréer reste le moyen préventif le plus efficace
contre le SRC. La mise en place d’un système national de notification des cas de SRC permettra
une meilleure connaissance de l’épidémiologie de la maladie, un bon suivi et une meilleure prise
en charge des cas dépistés et un contrôle rationnel de sa transmission. Concernant l’évaluation du
niveau de connaissance sur la toxoplasmose, 71 % des femmes interrogées n’avaient jamais
entendu parler de cette maladie. Parmi les 129 femmes dont le statut sérologique a été vérifié,
41 % étaient immunisées. Pour une sensibilisation accrue aux dangers de la TC, une collaboration
étroite entre professionnels de santé doit être mise en œuvre pour instaurer un programme éducatif
destiné aux femmes en âge de procréation. Il est également à prévoir un dépistage sérologique
généralisé pour la détection et le suivi des femmes séronégatives.
Le deuxième volet a été consacré aux infections néonatales bactériennes précoces. Au
cours de la période d’étude et sur 2787 hospitalisations, 1253 nouveau-nés (soit 45 %) étaient
admis pour prise en charge d’un risque infectieux. Selon les résultats de la présente étude, la
situation des infections néonatales reste inquiétante. De ce fait, le dépistage et la prise en charge
des infections néonatales représentent un défi majeur qui nécessite une coordination entre
pédiatres, obstétriciens et biologistes.
Au troisième volet, on a abordé la pneumonie du nourrisson, première cause de mortalité
par maladie infectieuse chez les enfants de moins de 5 ans au Maroc. Parmi 86 cas suspects de
pneumonie, 71 enfants (83 %) avaient au moins un agent pathogène. En utilisant un test qualitatif
de RT-PCR multiplex (RespiFinder® 22), neuf espèces virales et une espèce bactérienne ont été
identifiées. Les étiologies identifiées étaient dominées par le virus respiratoire syncytial (49 %).
Le diagnostic étiologique des pneumonies permet au praticien de prescrire le traitement approprié
et de réduire l'usage abusif d’antibiotiques.
Mots clès : Nouveau-né, Nourrisson, Rubéole, Système de notification, Toxoplasmose,
Séroprévalence, Infection néonatale, Pneumonie, RT-PCR.Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0342021 Président : ZOUHDI Mimoun Directeur : KHARBACH Aicha Juge : BARKAT Amina Juge : TLIGUI Houssain Juge : CHEBABE Milouda ; OBTEL Majdouline Examinateur INFECTIONS NEONATALES : ÉTAT DES LIEUX AU MAROC ET APPORT DU DIAGNOSTIC BIOLOGIQUE ET MOLECULAIRE DANS LA PRISE EN CHARGE [thèse] / Kenza HATTOUFI, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Nouveau-né Nourrisson Rubéole Système de notification Toxoplasmose Séroprévalence Infection néonatale Pneumonie RT-PCR Newborn Infant Rubella Reporting system Toxoplasmosis Seroprevalence Neonatal infection Pneumonia RT-PCR حديثي الوالدة رضيع الحصبة األلمانية، نظام اإلبالغ داء المقوسات االنتشار المصلي عدوى حديثي
الوالدة االلتهاب الرئوي PCR-RTRésumé : Ce travail, réalisé au sein du Centre National de Référence en Néonatologie et Nutrition de
l'Hôpital d'Enfants du CHU-Rabat, met en lumière quatre maladies infectieuses qui touchent le
fœtus, le nouveau-né et le nourrisson. Il s’agit de la rubéole, de la toxoplasmose, de l’infection
néonatale bactérienne précoce et de la pneumonie.
Le premier volet de cette thèse a été consacré à la rubéole et la toxoplasmose dont les agents
pathogènes peuvent être transmis au fœtus au cours de la grossesse en causant respectivement le
syndrome de rubéole congénitale (SRC) et la toxoplasmose congénitale (TC).
Parmi les femmes ayant déjà effectué une sérologie de la rubéole, 85 % étaient immunisées.
En effet, la vaccination des femmes en âge de procréer reste le moyen préventif le plus efficace
contre le SRC. La mise en place d’un système national de notification des cas de SRC permettra
une meilleure connaissance de l’épidémiologie de la maladie, un bon suivi et une meilleure prise
en charge des cas dépistés et un contrôle rationnel de sa transmission. Concernant l’évaluation du
niveau de connaissance sur la toxoplasmose, 71 % des femmes interrogées n’avaient jamais
entendu parler de cette maladie. Parmi les 129 femmes dont le statut sérologique a été vérifié,
41 % étaient immunisées. Pour une sensibilisation accrue aux dangers de la TC, une collaboration
étroite entre professionnels de santé doit être mise en œuvre pour instaurer un programme éducatif
destiné aux femmes en âge de procréation. Il est également à prévoir un dépistage sérologique
généralisé pour la détection et le suivi des femmes séronégatives.
Le deuxième volet a été consacré aux infections néonatales bactériennes précoces. Au
cours de la période d’étude et sur 2787 hospitalisations, 1253 nouveau-nés (soit 45 %) étaient
admis pour prise en charge d’un risque infectieux. Selon les résultats de la présente étude, la
situation des infections néonatales reste inquiétante. De ce fait, le dépistage et la prise en charge
des infections néonatales représentent un défi majeur qui nécessite une coordination entre
pédiatres, obstétriciens et biologistes.
Au troisième volet, on a abordé la pneumonie du nourrisson, première cause de mortalité
par maladie infectieuse chez les enfants de moins de 5 ans au Maroc. Parmi 86 cas suspects de
pneumonie, 71 enfants (83 %) avaient au moins un agent pathogène. En utilisant un test qualitatif
de RT-PCR multiplex (RespiFinder® 22), neuf espèces virales et une espèce bactérienne ont été
identifiées. Les étiologies identifiées étaient dominées par le virus respiratoire syncytial (49 %).
Le diagnostic étiologique des pneumonies permet au praticien de prescrire le traitement approprié
et de réduire l'usage abusif d’antibiotiques.
Mots clès : Nouveau-né, Nourrisson, Rubéole, Système de notification, Toxoplasmose,
Séroprévalence, Infection néonatale, Pneumonie, RT-PCR.Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0342021 Président : ZOUHDI Mimoun Directeur : KHARBACH Aicha Juge : BARKAT Amina Juge : TLIGUI Houssain Juge : CHEBABE Milouda ; OBTEL Majdouline Examinateur Réservation
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D0342021URL
Titre : PCR SARS-COV-2 : COMPARAISON ENTRE LE KIT MASCIR SARS-COV-2 M 0.2 ET LE KIT GENEFINDERTM COVID-19 PLUS REALAMP KIT Type de document : thèse Auteurs : ANZI HASNA, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Français (fre) Mots-clés : SARS-CoV-2 RT-PCR MAScIR SARS-CoV-2 M 0.2 GeneFinderTM COVID-19 plus RealAmp Kit Résumé : L’infection à SARS-CoV-2 constitue un problème de santé publique à l’échelle mondiale. La compréhension et le suivi de l'évolution génétique du virus, de ses caractéristiques, et sa stabilité sont particulièrement importants pour contrôler la propagation de la maladie et surtout pour le développement de très nombreux tests diagnostiques ciblant les différents gènes du virus.
L’objectif de cette étude est de faire une comparaison entre le nouveau kit MAScIR SARS-CoV-2 M kit 2.0 et le kit de référence GeneFinderTM COVID-19 Plus RealAmp kit qui sont des tests qualitatifs basés sur la technologie RT-qPCR permettant la détection de l’ARN du virus SARS-COV-2. Cette étude a été réalisée au Laboratoire Central de Virologie du CHU Ibn Sina de Rabat sur des échantillons prélevés par écouvillonnages nasopharyngés ou oropharyngés, pour la recherche du Génome du SRAS-COV-2 par RT PCR. Elle a portée sur 61 échantillons dont 38 étaient des échantillons fortement positifs, 14 étaient faiblement positifs et 9 étaient négatifs et sur trois thermocyleurs (ABI 7500 Applied Biosystems, QuantStudio™ 5 Applied Biosystems et Exicycler™ 96 Bioneer.)
Les résultats qualitatifs de cette comparaison étaient globalement concordants. Aucune discordance ayant un impact clinique n’a été détectée. La sensibilité et la spécificité du kit MAScIR SARS-CoV-2 M 2.0 ont été estimées à 100%, en prenant le test GeneFinder comme référence.
Notre étude a permis de conclure que les résultats des paramètres de recherche répondent aux recommandations du fournisseur et sont cohérents avec les résultats de la technique de référence.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0072021 Président : OUADGHIRI MOUNA Directeur : KABBAJ HAKIMA Juge : LMIMOUNI BADREDDINE Juge : EL ANNAZ HICHAM PCR SARS-COV-2 : COMPARAISON ENTRE LE KIT MASCIR SARS-COV-2 M 0.2 ET LE KIT GENEFINDERTM COVID-19 PLUS REALAMP KIT [thèse] / ANZI HASNA, Auteur . - 2021.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : SARS-CoV-2 RT-PCR MAScIR SARS-CoV-2 M 0.2 GeneFinderTM COVID-19 plus RealAmp Kit Résumé : L’infection à SARS-CoV-2 constitue un problème de santé publique à l’échelle mondiale. La compréhension et le suivi de l'évolution génétique du virus, de ses caractéristiques, et sa stabilité sont particulièrement importants pour contrôler la propagation de la maladie et surtout pour le développement de très nombreux tests diagnostiques ciblant les différents gènes du virus.
L’objectif de cette étude est de faire une comparaison entre le nouveau kit MAScIR SARS-CoV-2 M kit 2.0 et le kit de référence GeneFinderTM COVID-19 Plus RealAmp kit qui sont des tests qualitatifs basés sur la technologie RT-qPCR permettant la détection de l’ARN du virus SARS-COV-2. Cette étude a été réalisée au Laboratoire Central de Virologie du CHU Ibn Sina de Rabat sur des échantillons prélevés par écouvillonnages nasopharyngés ou oropharyngés, pour la recherche du Génome du SRAS-COV-2 par RT PCR. Elle a portée sur 61 échantillons dont 38 étaient des échantillons fortement positifs, 14 étaient faiblement positifs et 9 étaient négatifs et sur trois thermocyleurs (ABI 7500 Applied Biosystems, QuantStudio™ 5 Applied Biosystems et Exicycler™ 96 Bioneer.)
Les résultats qualitatifs de cette comparaison étaient globalement concordants. Aucune discordance ayant un impact clinique n’a été détectée. La sensibilité et la spécificité du kit MAScIR SARS-CoV-2 M 2.0 ont été estimées à 100%, en prenant le test GeneFinder comme référence.
Notre étude a permis de conclure que les résultats des paramètres de recherche répondent aux recommandations du fournisseur et sont cohérents avec les résultats de la technique de référence.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0072021 Président : OUADGHIRI MOUNA Directeur : KABBAJ HAKIMA Juge : LMIMOUNI BADREDDINE Juge : EL ANNAZ HICHAM Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0072021 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible MM0072021-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible Documents numériques
MM0072021URL
Titre : PLACE DU LABORATOIRE DANS LE DIAGNOSTIC DE L'INFECTION PAR SARS COV2 Type de document : thèse Auteurs : KERROUMI SOUAD, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Français (fre) Mots-clés : COVID 19 SARS COV2 RT-PCR Tests rapides Séquençage Génomique Résumé : "À la fin de l’année 2019, des cas groupés de pneumonies survenus à Wuhan ont été rapportés à la transmission interhumaine d’un nouveau coronavirus, le SARS-CoV-2. Cette maladie émergente a donné lieu à une pandémie mondiale. La présentation clinique de cette maladie, appelée « Coronavirus infectious disease 2019 » Covid-19, varie de formes asymptomatiques ou de symptômes modérés de type pseudo-grippal à une pneumonie bilatérale sévère avec détresse respiratoire aiguë pouvant aller jusqu’au décès.
L’objectif de notre travail est de décrire le rôle du laboratoire dans le diagnostic virologique de l’infection covid19. Cependant, Pour faire face à l’émergence du Sars-CoV-2, de très nombreux tests diagnostiques ont été développés et mis sur le marché dans un délai très court. La RT-PCR sur prélèvement rhino-pharyngé est la méthode de référence pour le diagnostic et le dépistage de l’infection à Sars-CoV-2 mais les tests développés présentent de grande variabilité en termes de sensibilité et de délai de rendu des résultats. Les tests antigéniques présentent en général une sensibilité plus faible mais présentent l’avantage d’une mise en œuvre plus simple et plus rapide. Le laboratoire joue aussi un rôle important dans l’identification des variants de Sars-Cov2 et leur caractérisation par séquençage génomique.
Dans ce travail, nous allons rapporter des informations actualisées sur le virus SARS-CoV2, concernant les données épidémiologiques, les aspects virologiques, et physiopathologiques, y compris les manifestations cliniques, les moyens diagnostiques et thérapeutiques.
"
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M1652021 Président : ZOUHDI MIMOUN Directeur : SEKHSOKH YASSINE Juge : GAOUZI AHMED Juge : CHADLI MARIAMA PLACE DU LABORATOIRE DANS LE DIAGNOSTIC DE L'INFECTION PAR SARS COV2 [thèse] / KERROUMI SOUAD, Auteur . - 2021.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : COVID 19 SARS COV2 RT-PCR Tests rapides Séquençage Génomique Résumé : "À la fin de l’année 2019, des cas groupés de pneumonies survenus à Wuhan ont été rapportés à la transmission interhumaine d’un nouveau coronavirus, le SARS-CoV-2. Cette maladie émergente a donné lieu à une pandémie mondiale. La présentation clinique de cette maladie, appelée « Coronavirus infectious disease 2019 » Covid-19, varie de formes asymptomatiques ou de symptômes modérés de type pseudo-grippal à une pneumonie bilatérale sévère avec détresse respiratoire aiguë pouvant aller jusqu’au décès.
L’objectif de notre travail est de décrire le rôle du laboratoire dans le diagnostic virologique de l’infection covid19. Cependant, Pour faire face à l’émergence du Sars-CoV-2, de très nombreux tests diagnostiques ont été développés et mis sur le marché dans un délai très court. La RT-PCR sur prélèvement rhino-pharyngé est la méthode de référence pour le diagnostic et le dépistage de l’infection à Sars-CoV-2 mais les tests développés présentent de grande variabilité en termes de sensibilité et de délai de rendu des résultats. Les tests antigéniques présentent en général une sensibilité plus faible mais présentent l’avantage d’une mise en œuvre plus simple et plus rapide. Le laboratoire joue aussi un rôle important dans l’identification des variants de Sars-Cov2 et leur caractérisation par séquençage génomique.
Dans ce travail, nous allons rapporter des informations actualisées sur le virus SARS-CoV2, concernant les données épidémiologiques, les aspects virologiques, et physiopathologiques, y compris les manifestations cliniques, les moyens diagnostiques et thérapeutiques.
"
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M1652021 Président : ZOUHDI MIMOUN Directeur : SEKHSOKH YASSINE Juge : GAOUZI AHMED Juge : CHADLI MARIAMA Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité M1652021 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2021 Disponible M1652021-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2021 Disponible Documents numériques
M1652021URL
Titre : PROFIL ÉPIDÉMIOLOGIQUE DE LA COVID 19 DANS LA RÉGION DE SIDI KACEM : EXPÉRIENCE D’UN LABORATOIRE DE VILLE Type de document : thèse Auteurs : RADI ANOIR, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : Covid-19 Sars-CoV-2 RT-PCR Tests rapides sérologie Covid-19 Sars-CoV-2 RT-PCR Rapid tests Serology كوفيد 19 فيروس كرونا تفاعل البوليميراز المتسلسل ذي التناسخ العكسي الاختبار السريع،
الأمصالRésumé : L'épidémie du COVID-19 causée par le coronavirus SARS CoV 2 a eu un impact majeur mondial au cours des derniers mois. Le diagnostic repose sur des arguments épidémiologiques, cliniques, radiologiques et biologiques. Au laboratoire, différents outils peuvent être utilisés permettant le dépistage des personnes infectées, par la détection du génome virale RT PCR ou indirectement par des sérologies ou des tests antigéniques.
Notre travail est une étude rétrospective étalée sur dix mois, du janvier 2021 à l’octobre 2021, dans un laboratoire privé à Sidi Kacem. Les résultats de notre étude concorde avec les données de la littérature, que ce soit le nombre des tests diagnostiques réalisés : sérologie, RT PCR et le test antigénique, les indications de ses tests, le pourcentage de la positivité des RT PCR selon l’indication, selon la tranche d’âge et le sex- ratio des cas positifs.
En plus, notre étude a montré la place des laboratoires privés et leur rôle important dans la lutte contre la Covid 19.Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2172022 Président : Mimoun ZOUHDI Directeur : Yassine SEKHSOKH Juge : Ahmed GAOUZI Juge : Saïda TELLAL PROFIL ÉPIDÉMIOLOGIQUE DE LA COVID 19 DANS LA RÉGION DE SIDI KACEM : EXPÉRIENCE D’UN LABORATOIRE DE VILLE [thèse] / RADI ANOIR, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Covid-19 Sars-CoV-2 RT-PCR Tests rapides sérologie Covid-19 Sars-CoV-2 RT-PCR Rapid tests Serology كوفيد 19 فيروس كرونا تفاعل البوليميراز المتسلسل ذي التناسخ العكسي الاختبار السريع،
الأمصالRésumé : L'épidémie du COVID-19 causée par le coronavirus SARS CoV 2 a eu un impact majeur mondial au cours des derniers mois. Le diagnostic repose sur des arguments épidémiologiques, cliniques, radiologiques et biologiques. Au laboratoire, différents outils peuvent être utilisés permettant le dépistage des personnes infectées, par la détection du génome virale RT PCR ou indirectement par des sérologies ou des tests antigéniques.
Notre travail est une étude rétrospective étalée sur dix mois, du janvier 2021 à l’octobre 2021, dans un laboratoire privé à Sidi Kacem. Les résultats de notre étude concorde avec les données de la littérature, que ce soit le nombre des tests diagnostiques réalisés : sérologie, RT PCR et le test antigénique, les indications de ses tests, le pourcentage de la positivité des RT PCR selon l’indication, selon la tranche d’âge et le sex- ratio des cas positifs.
En plus, notre étude a montré la place des laboratoires privés et leur rôle important dans la lutte contre la Covid 19.Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2172022 Président : Mimoun ZOUHDI Directeur : Yassine SEKHSOKH Juge : Ahmed GAOUZI Juge : Saïda TELLAL Réservation
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Exemplaires
Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité M2172022 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMed2022 Disponible Documents numériques
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