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2 résultat(s) recherche sur le mot-clé 'Diversité génétique' 
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Titre : CARACTERISATION GENOMIQUE DES VARIANTS DU SARS-COV-2 CIRCULANT AU MAROC Type de document : thèse Auteurs : KHAYI RAJAE, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : SARS-CoV-2 Maroc Diversité génétique analyse phylogénique mutations SNP SARS-CoV-2 Morocco Genetic diversity phylogenic analysis mutations SNP سارس كوف 2 المغرب التنوع الوراثي الطفرات Résumé : La pandémie de COVID19 causée par le virus SARS-CoV-2 a gravement touché la plupart des
pays du monde y compris le Maroc. Dans ce travail de recherche, nous avons effectué une
analyse de génomique comparative des séquences du génome entier de 65 souches de SARSCoV-2 isolées au Maroc et 333 isolats de 20 autres pays pour prédire les voies de transmission
possibles de COVID19 au Maroc et voire les variations génétiques les plus fréquentes.
L'analyse phylogénétique a indiqué que les 65 séquences du Maroc appartenaient à trois clades
de GISAID : GRA, GK et O avec une forte dominance du clade GRA qui correspond au variant
Omicron.
La comparaison génomique des isolats avec la souche de référence a montré que la variabilité
génétique globale entre deux souches de Sars-Cov-2 est comprise entre 2 variants et 75 variants.
De plus, une moyenne de 53 mutations par souche été identifiée dans les séquences du SARSCoV-2 marocain, dont 50 % étaient non synonymes (faux-sens) et présents dans sept gènes (S,
M, N, E, ORF1ab, ORF3a, ORF6, ORF7b) à fréquences variables. D’autre part le changement
de nucléotide C>T était le plus répandu et la mutation la plus fréquente dans la région non
codante était 241C>T.
Cette étude fournit un aperçu global sur la diversité des isolats marocains du SARS-CoV-2 et
montre l’importance des outils génomique pour contrôler la dissémination des variants du
SARS-CoV-2 et la veille génomique.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0362022 Président : KANDOUSSI Ilham Directeur : MOUMNI Mohieddine Juge : KARTTI Souad CARACTERISATION GENOMIQUE DES VARIANTS DU SARS-COV-2 CIRCULANT AU MAROC [thèse] / KHAYI RAJAE, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : SARS-CoV-2 Maroc Diversité génétique analyse phylogénique mutations SNP SARS-CoV-2 Morocco Genetic diversity phylogenic analysis mutations SNP سارس كوف 2 المغرب التنوع الوراثي الطفرات Résumé : La pandémie de COVID19 causée par le virus SARS-CoV-2 a gravement touché la plupart des
pays du monde y compris le Maroc. Dans ce travail de recherche, nous avons effectué une
analyse de génomique comparative des séquences du génome entier de 65 souches de SARSCoV-2 isolées au Maroc et 333 isolats de 20 autres pays pour prédire les voies de transmission
possibles de COVID19 au Maroc et voire les variations génétiques les plus fréquentes.
L'analyse phylogénétique a indiqué que les 65 séquences du Maroc appartenaient à trois clades
de GISAID : GRA, GK et O avec une forte dominance du clade GRA qui correspond au variant
Omicron.
La comparaison génomique des isolats avec la souche de référence a montré que la variabilité
génétique globale entre deux souches de Sars-Cov-2 est comprise entre 2 variants et 75 variants.
De plus, une moyenne de 53 mutations par souche été identifiée dans les séquences du SARSCoV-2 marocain, dont 50 % étaient non synonymes (faux-sens) et présents dans sept gènes (S,
M, N, E, ORF1ab, ORF3a, ORF6, ORF7b) à fréquences variables. D’autre part le changement
de nucléotide C>T était le plus répandu et la mutation la plus fréquente dans la région non
codante était 241C>T.
Cette étude fournit un aperçu global sur la diversité des isolats marocains du SARS-CoV-2 et
montre l’importance des outils génomique pour contrôler la dissémination des variants du
SARS-CoV-2 et la veille génomique.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0362022 Président : KANDOUSSI Ilham Directeur : MOUMNI Mohieddine Juge : KARTTI Souad Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0362022 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible Documents numériques
MM0362022URL
Titre : DIVERSITE GENETIQUE DU VIH : LES SOUCHES DU VIH-1 CIRCULANTES AU MAROC Type de document : thèse Auteurs : BOUREIMA KONATE, Auteur Année de publication : 2011 Langues : Français (fre) Mots-clés : VIH-1 SOUS-TYPES DIVERSITE GENETIQUE EPIDEMIOLOGIE MOLECULAIRE. Résumé : Introduction : le VIH connait une extrême diversité. En effet, La répartition des différents génotypes varie d’une région continentale à l’autre. Notre étude a pour objectif de déterminer les souches de VIH-1 circulantes au Maroc et d’analyser leurs origines.
Patients et Méthodes : l’étude a inclus 51 marocains, suivis pour une infection à VIH-1 à l’HMIM V de Rabat. Le séquençage des gènes de la reverse transcriptase et de la protéase a été réalisé sur le séquenceur CEQ 2000® de Beckman Coulter. Les génotypes ont été obtenus grâce aux arbres phylogéniques élaborés par le logiciel Mega 5.05 à partir des séquences obtenues.
Résultats : Notre population d’étude est constituée de 84% d’hommes et 16% de femmes. La majorité des patients avait un stade clinique A et C dans 39% et 37% respectivement. La médiane de la charge virale était de 2 000 555 copies/ml et celle des CD4 était de 511 Cellules/µl. L’analyse phylogénique des souches identifiées a montré que le sous-type B représente 72% des souches étudiées, alors que les sous-types non-B représentent 28% dont 10% du A1, 10% du CRF02_AG, 2% du C, 2% du G, 2% du CRF25_cpx et 2% du A1/CRF22.
Discussion : Diverses souches de VIH-1 circulent au Maroc parmi lesquelles les non-B qui proviendraient principalement de l’Afrique subsaharienne par le biais de l’immigration clandestine et des marocains y séjournant. Quant au sous-type B, son origine pourrait être liée aux flux des populations entre le Maroc et les pays occidentaux.
Conclusion : Vu l’émergence des souches non-B qui soulève leur implication épidémiologique, diagnostic et thérapeutique, une surveillance moléculaire du VIH s’impose.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0892011 Président : MIMOUN ZOUHDI Directeur : SAAD MRANI Juge : MOUNCEF RABHI Juge : OMAR AGDR DIVERSITE GENETIQUE DU VIH : LES SOUCHES DU VIH-1 CIRCULANTES AU MAROC [thèse] / BOUREIMA KONATE, Auteur . - 2011.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : VIH-1 SOUS-TYPES DIVERSITE GENETIQUE EPIDEMIOLOGIE MOLECULAIRE. Résumé : Introduction : le VIH connait une extrême diversité. En effet, La répartition des différents génotypes varie d’une région continentale à l’autre. Notre étude a pour objectif de déterminer les souches de VIH-1 circulantes au Maroc et d’analyser leurs origines.
Patients et Méthodes : l’étude a inclus 51 marocains, suivis pour une infection à VIH-1 à l’HMIM V de Rabat. Le séquençage des gènes de la reverse transcriptase et de la protéase a été réalisé sur le séquenceur CEQ 2000® de Beckman Coulter. Les génotypes ont été obtenus grâce aux arbres phylogéniques élaborés par le logiciel Mega 5.05 à partir des séquences obtenues.
Résultats : Notre population d’étude est constituée de 84% d’hommes et 16% de femmes. La majorité des patients avait un stade clinique A et C dans 39% et 37% respectivement. La médiane de la charge virale était de 2 000 555 copies/ml et celle des CD4 était de 511 Cellules/µl. L’analyse phylogénique des souches identifiées a montré que le sous-type B représente 72% des souches étudiées, alors que les sous-types non-B représentent 28% dont 10% du A1, 10% du CRF02_AG, 2% du C, 2% du G, 2% du CRF25_cpx et 2% du A1/CRF22.
Discussion : Diverses souches de VIH-1 circulent au Maroc parmi lesquelles les non-B qui proviendraient principalement de l’Afrique subsaharienne par le biais de l’immigration clandestine et des marocains y séjournant. Quant au sous-type B, son origine pourrait être liée aux flux des populations entre le Maroc et les pays occidentaux.
Conclusion : Vu l’émergence des souches non-B qui soulève leur implication épidémiologique, diagnostic et thérapeutique, une surveillance moléculaire du VIH s’impose.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0892011 Président : MIMOUN ZOUHDI Directeur : SAAD MRANI Juge : MOUNCEF RABHI Juge : OMAR AGDR Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité P0892011 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesPharm2011 Disponible
