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ETUDE DE PERFORMANCE DE LA METHODE ABBOTT ID-NOW PAR RAPPORT A LA METHODE MULTIPLEX EUROBIOLPLEX SARS-COV-2 POUR LA DETECTION DE SARS-COV-2 A PARTIR DES ECHANTILLONS NASOPHARYNGES / ZOUAOUI Amal
Titre : ETUDE DE PERFORMANCE DE LA METHODE ABBOTT ID-NOW PAR RAPPORT A LA METHODE MULTIPLEX EUROBIOLPLEX SARS-COV-2 POUR LA DETECTION DE SARS-COV-2 A PARTIR DES ECHANTILLONS NASOPHARYNGES Type de document : thèse Auteurs : ZOUAOUI Amal, Auteur Année de publication : 2023 Langues : Français (fre) Mots-clés : Abbott ID-Now COVID-19 SRAS-CoV-2 Écouvillons nasopharyngés. Diagnostic moléculaire RT-PCR Résumé : Introduction : Le virus SARS-CoV-2 est apparu à Wuhan en décembre 2019 en chine, et depuis,
il s’est rapidement répandu dans le monde entier. Ceci a été à l’origine des millions de
contaminations et des milliers de décès à travers le monde. L'initiative visant à étendre et à
accélérer les tests a allégé l'examen minutieux auquel sont normalement soumis les nouveaux
tests avant leur mise sur le marché. Cela oblige les laboratoires cliniques à évaluer plus
soigneusement les performances globales des diverses plates-formes d'essai qui se développent
rapidement avant leur mise en œuvre.
Notre étude a pour objectif d’évaluer la performance du test moléculaire rapide ID-NOW pour
la détection du SARS-COV-2 en comparaison avec la méthode de référence RT-PCR.
Matériels et méthodes : Il s’agit d’une étude prospective réalisée sur 224 échantillons des
patients en consultation externe, hospitalisés ou du service d'urgence. Les prélèvements
effectués étaient des écouvillons nasopharyngés reçus dans un milieu de transport
universel VIRCELL. Chaque échantillon a été traité de façon concomitante par les 2 méthodes
objet de cette étude : Méthode de référence RT-PCR et le Test moléculaire rapide ID-Now
COVID-19.
Résultats: Notre étude a porté sur 224 échantillons dont 154 se sont avérés positifs et 70 négatifs
à la RT-PCR (méthode de référence). La totalité des prélèvements négatifs par la RT-PCR
étaient aussi négatifs par ID-NOW. Cependant, parmi les 154 prélèvements qui étaient positifs
à la RT-PCR, 32 prélèvements se sont révélés négatifs par ID-Now. La sensibilité globale du
test ID-Now était de 79,22% et sa spécificité globale de 100%. Sa valeur prédictive positive
était de 79,22% et sa valeur prédictive négative de 68,63%. La sensibilité du test ID-Now était
de 31,91% pour les échantillons dont le Ct est faible, 100% pour les échantillons dont le Ct est
moyen et 100% pour les échantillons dont les Ct est élevé.
Conclusion : Cette étude met en évidence une limite importante de l'ID Now dans le cas des
échantillons à faibles concentrations virales.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MS1232023 Directeur : AABI Rachid ETUDE DE PERFORMANCE DE LA METHODE ABBOTT ID-NOW PAR RAPPORT A LA METHODE MULTIPLEX EUROBIOLPLEX SARS-COV-2 POUR LA DETECTION DE SARS-COV-2 A PARTIR DES ECHANTILLONS NASOPHARYNGES [thèse] / ZOUAOUI Amal, Auteur . - 2023.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Abbott ID-Now COVID-19 SRAS-CoV-2 Écouvillons nasopharyngés. Diagnostic moléculaire RT-PCR Résumé : Introduction : Le virus SARS-CoV-2 est apparu à Wuhan en décembre 2019 en chine, et depuis,
il s’est rapidement répandu dans le monde entier. Ceci a été à l’origine des millions de
contaminations et des milliers de décès à travers le monde. L'initiative visant à étendre et à
accélérer les tests a allégé l'examen minutieux auquel sont normalement soumis les nouveaux
tests avant leur mise sur le marché. Cela oblige les laboratoires cliniques à évaluer plus
soigneusement les performances globales des diverses plates-formes d'essai qui se développent
rapidement avant leur mise en œuvre.
Notre étude a pour objectif d’évaluer la performance du test moléculaire rapide ID-NOW pour
la détection du SARS-COV-2 en comparaison avec la méthode de référence RT-PCR.
Matériels et méthodes : Il s’agit d’une étude prospective réalisée sur 224 échantillons des
patients en consultation externe, hospitalisés ou du service d'urgence. Les prélèvements
effectués étaient des écouvillons nasopharyngés reçus dans un milieu de transport
universel VIRCELL. Chaque échantillon a été traité de façon concomitante par les 2 méthodes
objet de cette étude : Méthode de référence RT-PCR et le Test moléculaire rapide ID-Now
COVID-19.
Résultats: Notre étude a porté sur 224 échantillons dont 154 se sont avérés positifs et 70 négatifs
à la RT-PCR (méthode de référence). La totalité des prélèvements négatifs par la RT-PCR
étaient aussi négatifs par ID-NOW. Cependant, parmi les 154 prélèvements qui étaient positifs
à la RT-PCR, 32 prélèvements se sont révélés négatifs par ID-Now. La sensibilité globale du
test ID-Now était de 79,22% et sa spécificité globale de 100%. Sa valeur prédictive positive
était de 79,22% et sa valeur prédictive négative de 68,63%. La sensibilité du test ID-Now était
de 31,91% pour les échantillons dont le Ct est faible, 100% pour les échantillons dont le Ct est
moyen et 100% pour les échantillons dont les Ct est élevé.
Conclusion : Cette étude met en évidence une limite importante de l'ID Now dans le cas des
échantillons à faibles concentrations virales.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MS1232023 Directeur : AABI Rachid Réservation
Réserver ce document
Exemplaires
Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MS1232023 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Spécialités Disponible "PROFILS GENETIQUES CYTOGENETIQUES ET MOLECULAIRES DES LEUCEMIES AIGUES MYELOIDES EN 2022" / KADDAME CHAIMAE
Titre : "PROFILS GENETIQUES CYTOGENETIQUES ET MOLECULAIRES DES LEUCEMIES AIGUES MYELOIDES EN 2022" Type de document : thèse Auteurs : KADDAME CHAIMAE, Auteur Année de publication : 2024 Langues : Français (fre) Mots-clés : Leucémie myéloïde aiguë Génétique Cytogénétique Moléculaire Classification OMS 2022 Acute myeloid leukemia genetics cytogenetics molecular WHO classification 2022 اللوكيميا النخاعية الحادة الوراثة الوراثة الخلوية الجزيئية تصنيف منظمة الصحة العالمية لعام2022 Résumé : Les leucémies aiguës myéloïdes (LAM) sont des affections hématologiques caractérisées par la multiplication anormale des précurseurs des cellules myéloïdes dans la moelle osseuse, le sang et parfois d'autres organes, perturbant ainsi la production normale de cellules sanguines.
Pour poser un diagnostic, il est essentiel de réaliser un bilan complet comprenant des analyses cytogénétiques, immunophénotypiques et moléculaires conformes à la classification actualisée de l’OMS.
L'analyse par cytométrie en flux est devenue indispensable pour le diagnostic biologique des leucémies aiguës myéloïdes, en particulier pour confirmer la nature myéloïde des cellules leucémiques.
Par ailleurs, bien que le phénotype des blastes puisse jouer un rôle dans la classification, la cytochimie continue de jouer un rôle crucial en oncohématologie, se positionnant après la biologie moléculaire et la cytogénétique.
Depuis les années 1970, plusieurs classifications des leucémies aiguës myéloïdes (LAM) ont été proposées. La dernière classification internationale consensuelle a été publiée en 2022 sous la direction de l'Organisation mondiale de la santé (OMS)
Ainsi, la 5ème édition de la classification des LAM de l’OMS souligne toujours l'importance de prendre en compte les aspects cliniques, moléculaires/génétiques et pathologiques, afin d'améliorer la prise en charge des différentes formes de LAM.
Le présent travail vise à traiter les mises à jour les plus pertinentes dans la classification OMS actuelle de LAM, en mettant en avant l'apport des caractéristiques cytogénétiques, génétiques et moléculaires recueillies au fil des années pour améliorer cette classification ainsi que pour faciliter l’identification de nouvelles entités.Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2032024 Président : Souad BENKIRANE Directeur : Azlarab MASRAR Juge : Anass JEAIDI Juge : Hafid ZAHID "PROFILS GENETIQUES CYTOGENETIQUES ET MOLECULAIRES DES LEUCEMIES AIGUES MYELOIDES EN 2022" [thèse] / KADDAME CHAIMAE, Auteur . - 2024.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Leucémie myéloïde aiguë Génétique Cytogénétique Moléculaire Classification OMS 2022 Acute myeloid leukemia genetics cytogenetics molecular WHO classification 2022 اللوكيميا النخاعية الحادة الوراثة الوراثة الخلوية الجزيئية تصنيف منظمة الصحة العالمية لعام2022 Résumé : Les leucémies aiguës myéloïdes (LAM) sont des affections hématologiques caractérisées par la multiplication anormale des précurseurs des cellules myéloïdes dans la moelle osseuse, le sang et parfois d'autres organes, perturbant ainsi la production normale de cellules sanguines.
Pour poser un diagnostic, il est essentiel de réaliser un bilan complet comprenant des analyses cytogénétiques, immunophénotypiques et moléculaires conformes à la classification actualisée de l’OMS.
L'analyse par cytométrie en flux est devenue indispensable pour le diagnostic biologique des leucémies aiguës myéloïdes, en particulier pour confirmer la nature myéloïde des cellules leucémiques.
Par ailleurs, bien que le phénotype des blastes puisse jouer un rôle dans la classification, la cytochimie continue de jouer un rôle crucial en oncohématologie, se positionnant après la biologie moléculaire et la cytogénétique.
Depuis les années 1970, plusieurs classifications des leucémies aiguës myéloïdes (LAM) ont été proposées. La dernière classification internationale consensuelle a été publiée en 2022 sous la direction de l'Organisation mondiale de la santé (OMS)
Ainsi, la 5ème édition de la classification des LAM de l’OMS souligne toujours l'importance de prendre en compte les aspects cliniques, moléculaires/génétiques et pathologiques, afin d'améliorer la prise en charge des différentes formes de LAM.
Le présent travail vise à traiter les mises à jour les plus pertinentes dans la classification OMS actuelle de LAM, en mettant en avant l'apport des caractéristiques cytogénétiques, génétiques et moléculaires recueillies au fil des années pour améliorer cette classification ainsi que pour faciliter l’identification de nouvelles entités.Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2032024 Président : Souad BENKIRANE Directeur : Azlarab MASRAR Juge : Anass JEAIDI Juge : Hafid ZAHID Réservation
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