| Titre : | DIAGNOSTIC VIROLOGIQUE DE L’INFECTION A SARS-COV-2 : EXPERIENCE DU LABORATOIRE CENTRAL DE VIROLOGIE DU CHU IBN SINA | | Type de document : | thèse | | Auteurs : | ZOUBIR KAOUTAR, Auteur | | Année de publication : | 2022 | | Langues : | Français (fre) | | Mots-clés : | SARS-COV-2 COVID 19 Diagnostic Epidémiologie Symptomatologie RT-PCR Charge virale SARS-CoV-2 COVID-19 diagnosis epidemiology symptomatology RT-PCR viral load كورونا-سارس -2 مرض كوفيد 19 ،تشخيص علم األوبئة األعراض PCR-RT الحمل الفيروسي | | Résumé : | Introduction : Le COVID-19 est une infection respiratoire aiguë, hautement contagieuse, causée par
le SARS-CoV-2. L’impact de la pandémie sur les différents systèmes de santé était accablant.
L’objectif de notre travail est de décrire le rôle du laboratoire dans le diagnostic virologique de
l’infection par le SARS-CoV-2 ainsi que de faire une analyse épidémiologique, clinique et
virologique.
Matériels et méthodes : Il s’agit d’une étude descriptive rétrospective, intéressant une série de cas,
réalisée au Laboratoire Central de Virologie (LCV) du CHU Ibn Sina, Hôpital des spécialités, Rabat,
sur une période de 12 mois, entre Avril 2020 et Mars 2021. Le diagnostic virologique s’est basé sur
une extraction automatisée de l’ARN viral suivie d’une RT-PCR en temps réel, selon la technologie
Taqman, utilisant le kit MAScIR.
Résultats : Durant notre étude, nous avons analysé 4002 échantillons provenant du CHU avec un
résultat RT-PCR positif pour le SARS-CoV-2. La médiane d’âge était de 44 ans avec un intervalle
interquartile de [29 ; 60]. Le sexe ratio H/F était de 0,77. Le pic de cas était situé au mois de
Novembre 2020.
Les comorbidités les plus fréquentes étaient le diabète (31%) et l’hypertension artérielle (28%).
Les signes cliniques étaient dominés par la fièvre (55%), la toux (53%), les céphalées (29 %), la
dyspnée (28%), les myalgies (26%) et le mal de gorge (26%). 10% des cas étaient asymptomatiques.
Le pourcentage des asymptomatiques chez les femmes était plus élevé que chez les hommes. Les
enfants présentaient aussi plus de formes asymptomatiques. Le pourcentage des cas symptomatiques
était plus élevé parmi les patients diabétiques (99,2%) que parmi les patients non diabétiques (93,1%).
Selon les valeurs des Ct des gènes cibles, la population de l’étude a été répartie en positif fort (29%),
positif (53%) et positif faible (18%). Le pourcentage de positifs faibles était plus élevé chez les enfants
que chez les adultes. Les patients réinfectés par le SARS-CoV-2 ont présenté des charges virales plus
faibles. Les charges virales étaient plus élevées chez les patients présentant les symptômes suivants :
mal de gorge, myalgies, céphalées, anosmie, agueusie. Elles étaient plus faibles chez les patients
présentant les symptômes suivants : dyspnée et détresse respiratoire. La charge virale n’était pas
influencée par la présence ou non de symptômes, soulignant le potentiel de propagation du virus par
les cas asymptomatiques.
Conclusion : L’impact de la pandémie sur le LCV a révélé l’importance de la coordination entre de
multiples partenaires et du soutien envers les professionnels de santé qui ont dû affronter plusieurs
défis et contraintes. Cette étude a démontré une association significative entre plusieurs paramètres
épidémiologiques, cliniques et virologiques du COVID-19. Ce travail a fait ressortir, entre autres,
l’importance des mesures prophylactiques pour la lutte contre cette pandémie et pourrait servir de
référence pour des études ultérieures sur les données virologiques de l’infection à SARS-CoV-2.
| | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | M2312022 | | Président : | Abdelkader ERROUGANI | | Directeur : | Myriame SEFFAR | | Juge : | Hakima KABBAJ | | Juge : | Amine Idriss LAHLOU | | Juge : | Redouane ABOUQUAL |
DIAGNOSTIC VIROLOGIQUE DE L’INFECTION A SARS-COV-2 : EXPERIENCE DU LABORATOIRE CENTRAL DE VIROLOGIE DU CHU IBN SINA [thèse] / ZOUBIR KAOUTAR, Auteur . - 2022. Langues : Français ( fre) | Mots-clés : | SARS-COV-2 COVID 19 Diagnostic Epidémiologie Symptomatologie RT-PCR Charge virale SARS-CoV-2 COVID-19 diagnosis epidemiology symptomatology RT-PCR viral load كورونا-سارس -2 مرض كوفيد 19 ،تشخيص علم األوبئة األعراض PCR-RT الحمل الفيروسي | | Résumé : | Introduction : Le COVID-19 est une infection respiratoire aiguë, hautement contagieuse, causée par
le SARS-CoV-2. L’impact de la pandémie sur les différents systèmes de santé était accablant.
L’objectif de notre travail est de décrire le rôle du laboratoire dans le diagnostic virologique de
l’infection par le SARS-CoV-2 ainsi que de faire une analyse épidémiologique, clinique et
virologique.
Matériels et méthodes : Il s’agit d’une étude descriptive rétrospective, intéressant une série de cas,
réalisée au Laboratoire Central de Virologie (LCV) du CHU Ibn Sina, Hôpital des spécialités, Rabat,
sur une période de 12 mois, entre Avril 2020 et Mars 2021. Le diagnostic virologique s’est basé sur
une extraction automatisée de l’ARN viral suivie d’une RT-PCR en temps réel, selon la technologie
Taqman, utilisant le kit MAScIR.
Résultats : Durant notre étude, nous avons analysé 4002 échantillons provenant du CHU avec un
résultat RT-PCR positif pour le SARS-CoV-2. La médiane d’âge était de 44 ans avec un intervalle
interquartile de [29 ; 60]. Le sexe ratio H/F était de 0,77. Le pic de cas était situé au mois de
Novembre 2020.
Les comorbidités les plus fréquentes étaient le diabète (31%) et l’hypertension artérielle (28%).
Les signes cliniques étaient dominés par la fièvre (55%), la toux (53%), les céphalées (29 %), la
dyspnée (28%), les myalgies (26%) et le mal de gorge (26%). 10% des cas étaient asymptomatiques.
Le pourcentage des asymptomatiques chez les femmes était plus élevé que chez les hommes. Les
enfants présentaient aussi plus de formes asymptomatiques. Le pourcentage des cas symptomatiques
était plus élevé parmi les patients diabétiques (99,2%) que parmi les patients non diabétiques (93,1%).
Selon les valeurs des Ct des gènes cibles, la population de l’étude a été répartie en positif fort (29%),
positif (53%) et positif faible (18%). Le pourcentage de positifs faibles était plus élevé chez les enfants
que chez les adultes. Les patients réinfectés par le SARS-CoV-2 ont présenté des charges virales plus
faibles. Les charges virales étaient plus élevées chez les patients présentant les symptômes suivants :
mal de gorge, myalgies, céphalées, anosmie, agueusie. Elles étaient plus faibles chez les patients
présentant les symptômes suivants : dyspnée et détresse respiratoire. La charge virale n’était pas
influencée par la présence ou non de symptômes, soulignant le potentiel de propagation du virus par
les cas asymptomatiques.
Conclusion : L’impact de la pandémie sur le LCV a révélé l’importance de la coordination entre de
multiples partenaires et du soutien envers les professionnels de santé qui ont dû affronter plusieurs
défis et contraintes. Cette étude a démontré une association significative entre plusieurs paramètres
épidémiologiques, cliniques et virologiques du COVID-19. Ce travail a fait ressortir, entre autres,
l’importance des mesures prophylactiques pour la lutte contre cette pandémie et pourrait servir de
référence pour des études ultérieures sur les données virologiques de l’infection à SARS-CoV-2.
| | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | M2312022 | | Président : | Abdelkader ERROUGANI | | Directeur : | Myriame SEFFAR | | Juge : | Hakima KABBAJ | | Juge : | Amine Idriss LAHLOU | | Juge : | Redouane ABOUQUAL |
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