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Titre : INTERET DE LA VEILLE GENOMIQUE EN CAS DE LA PANDEMIE: COVID 19 Type de document : thèse Auteurs : CHAHED SALMA, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : SARS-COV-2 variants analyse génomique mutations protéine spike SARS-COV-2 variants genomic analysis mutations spike protein سارس-كوف - 2 المتغيرات التحليل الجينومي الطفرات بروتين سبايك Résumé : Coronavirus (COVID19) est une maladie infectieuse due au virus SARS-CoV-2, découverte à Wuhan en décembre 2019, il s’agit d’une maladie infectieuse extrêmement contagieuse et très réactive. La première apparition de cas et de symptômes en dehors du chine est en Thaïlande le 13 janvier 2020, celà est après deux semaines de la première apparition (début de l’épidémie), le virus est transporté par une voyageuse chinoise. Le premier cas importé a été détecté au Maroc le 02 Mars 2020, alors que le premier cas de transmission locale a été enregistré le 13 Mars 2020. Le nombre de cas confirmés a augmenté peu à peu, et la propagation du virus s’est augmentée de plus en plus. Le virus a une nature changeante, ce qui lui a poussé à donner de nouvelles variantes plus dangereuses. Ce changement nécessite une étude génomique approfondie des différentes lignées disponibles, afin de trouver la solution. Alors, en raison de l'évolution constante du virus, il est très productif de disposer de séquences continues du génome, La plupart des pays ont donc mis en place des réseaux de séquençage génomique pour aider à accomplir cette mission, le Maroc est parmi ces pays, et cela pour la détection et la confirmation de la circulation des variants et de sa propagation dans toutes les régions du royaume, Dans cette étude nous avons fait une analyse génomique des quatre variants, Alpha, Delta, Mu et Omicron, en passant par plusieurs étapes, commençant par le contrôle qualité, jusqu’au analyse et identification des lignées en utilisons plusieurs outils et plusieurs commandes. Le résultat était l’identification de plusieurs mutations propre à chaque variant. Ces mutations sont responsables de la sévérité des variants, la propagation du virus, et la gravité de la maladie en affectant des gènes responsables de l’infection et la défense immunitaire. Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0152022 Président : LOUATI SARA Directeur : OUADGHIRI Mouna Juge : AANIZ TARIK Examinateur INTERET DE LA VEILLE GENOMIQUE EN CAS DE LA PANDEMIE: COVID 19 [thèse] / CHAHED SALMA, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : SARS-COV-2 variants analyse génomique mutations protéine spike SARS-COV-2 variants genomic analysis mutations spike protein سارس-كوف - 2 المتغيرات التحليل الجينومي الطفرات بروتين سبايك Résumé : Coronavirus (COVID19) est une maladie infectieuse due au virus SARS-CoV-2, découverte à Wuhan en décembre 2019, il s’agit d’une maladie infectieuse extrêmement contagieuse et très réactive. La première apparition de cas et de symptômes en dehors du chine est en Thaïlande le 13 janvier 2020, celà est après deux semaines de la première apparition (début de l’épidémie), le virus est transporté par une voyageuse chinoise. Le premier cas importé a été détecté au Maroc le 02 Mars 2020, alors que le premier cas de transmission locale a été enregistré le 13 Mars 2020. Le nombre de cas confirmés a augmenté peu à peu, et la propagation du virus s’est augmentée de plus en plus. Le virus a une nature changeante, ce qui lui a poussé à donner de nouvelles variantes plus dangereuses. Ce changement nécessite une étude génomique approfondie des différentes lignées disponibles, afin de trouver la solution. Alors, en raison de l'évolution constante du virus, il est très productif de disposer de séquences continues du génome, La plupart des pays ont donc mis en place des réseaux de séquençage génomique pour aider à accomplir cette mission, le Maroc est parmi ces pays, et cela pour la détection et la confirmation de la circulation des variants et de sa propagation dans toutes les régions du royaume, Dans cette étude nous avons fait une analyse génomique des quatre variants, Alpha, Delta, Mu et Omicron, en passant par plusieurs étapes, commençant par le contrôle qualité, jusqu’au analyse et identification des lignées en utilisons plusieurs outils et plusieurs commandes. Le résultat était l’identification de plusieurs mutations propre à chaque variant. Ces mutations sont responsables de la sévérité des variants, la propagation du virus, et la gravité de la maladie en affectant des gènes responsables de l’infection et la défense immunitaire. Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0152022 Président : LOUATI SARA Directeur : OUADGHIRI Mouna Juge : AANIZ TARIK Examinateur Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0152022 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMed2022 Disponible Documents numériques
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Titre : SARS–COV–2 ET SES VARIANTS Type de document : thèse Auteurs : EL KARTOUTI IMANE, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : COVID-19 SARS-COV-2 Variants Variants préoccupants COVID-19 SARS-COV-2 Variants Variant of Concern كوفید- 19 فیروس كورونا المتحورات المتحورات المثیرة للقلق Résumé : Suite à la découverte des cas de pneumonie virale atypique en décembre 2019, à Wuhan, en
Chine, un Bêtacoronavirus nommé SARS-CoV-2 a été identifié comme agent causal. En raison de la
transmission interhumaine, le SARS-CoV-2 s'est rapidement propagé au niveau mondial, en causant
des millions d'infections et de décès. Ainsi, l’OMS a déclaré que l’infection par ce coronavirus est
devenue pandémique. Malgré que les coronavirus renferment des mécanismes intrinsèques de
correction des erreurs qui diminuent leur mutabilité, de nombreuses mutations ont favorisé
l’adaptation du SARS-CoV-2 à ses hôtes. Par conséquent, plusieurs lignées de ce virus ont émergé,
provoquant la divergence d'un vaste sous-ensemble de variants appelés « variants préoccupants ». Le
SARS-CoV-2 avec la mutation D614G au niveau du gène de la protéine de pointe, a donnée naissance
à la lignée mère B.1, qui était à l’origine de nombreux variants en accumulant d’autres mutations, dont
les VOCs : Alpha, Bêta, Gamma, Delta et Omicron. Ces variants ont provoqué de nombreuses vagues
successives à l’échelle planétaire. L’émergence de nouveaux variants suscite des inquiétudes,
nécessitant ainsi de nouvelles investigations pour déterminer les causes des changements évolutifs au
fil du temps et le retentissement sur l’épidémiologie, l'antigénicité, l'échappement aux anticorps
neutralisants générés au cours d’une infection antérieure, les signes cliniques, les performances des
tests de diagnostic, la vaccination, l'efficacité des traitements développés et des mesures de
préventions.
Dans ce travail, nous allons traiter le sujet intitulé « SARS-CoV-2 et ses variants », en étalant
des informations actualisées à propos du SARS-CoV-2 et ses variants préoccupants, de point de vue
épidémiologique, physiopathologique, clinique, ainsi que les données concernant le pronostic, les
outils de diagnostic, l’efficacité des traitements et de la vaccination.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0992022 Président : Ahmed GAOUZI Directeur : Mimoun ZOUHDI Juge : Yessine SEKHSOKH Juge : Mariama CHADLI Juge : Saida TELLAL SARS–COV–2 ET SES VARIANTS [thèse] / EL KARTOUTI IMANE, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : COVID-19 SARS-COV-2 Variants Variants préoccupants COVID-19 SARS-COV-2 Variants Variant of Concern كوفید- 19 فیروس كورونا المتحورات المتحورات المثیرة للقلق Résumé : Suite à la découverte des cas de pneumonie virale atypique en décembre 2019, à Wuhan, en
Chine, un Bêtacoronavirus nommé SARS-CoV-2 a été identifié comme agent causal. En raison de la
transmission interhumaine, le SARS-CoV-2 s'est rapidement propagé au niveau mondial, en causant
des millions d'infections et de décès. Ainsi, l’OMS a déclaré que l’infection par ce coronavirus est
devenue pandémique. Malgré que les coronavirus renferment des mécanismes intrinsèques de
correction des erreurs qui diminuent leur mutabilité, de nombreuses mutations ont favorisé
l’adaptation du SARS-CoV-2 à ses hôtes. Par conséquent, plusieurs lignées de ce virus ont émergé,
provoquant la divergence d'un vaste sous-ensemble de variants appelés « variants préoccupants ». Le
SARS-CoV-2 avec la mutation D614G au niveau du gène de la protéine de pointe, a donnée naissance
à la lignée mère B.1, qui était à l’origine de nombreux variants en accumulant d’autres mutations, dont
les VOCs : Alpha, Bêta, Gamma, Delta et Omicron. Ces variants ont provoqué de nombreuses vagues
successives à l’échelle planétaire. L’émergence de nouveaux variants suscite des inquiétudes,
nécessitant ainsi de nouvelles investigations pour déterminer les causes des changements évolutifs au
fil du temps et le retentissement sur l’épidémiologie, l'antigénicité, l'échappement aux anticorps
neutralisants générés au cours d’une infection antérieure, les signes cliniques, les performances des
tests de diagnostic, la vaccination, l'efficacité des traitements développés et des mesures de
préventions.
Dans ce travail, nous allons traiter le sujet intitulé « SARS-CoV-2 et ses variants », en étalant
des informations actualisées à propos du SARS-CoV-2 et ses variants préoccupants, de point de vue
épidémiologique, physiopathologique, clinique, ainsi que les données concernant le pronostic, les
outils de diagnostic, l’efficacité des traitements et de la vaccination.
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