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Titre : ÉTUDE IN SILICO DU PROFIL MUTATIONNEL DU RECEPTEUR MET : IMPACT SUR LA REPONSE AU TRAITEMENT ET EXPLORATION DE NOUVEAUX INHIBITEURS ATOXIQUES POUR LE CANCER DE REIN Type de document : thèse Auteurs : HBIBI IMANE, Auteur Année de publication : 2023 Langues : Français (fre) Mots-clés : MET cibler inhibiteurs compétitif pour l’ATP cancer du rein criblage virtuel Docking MET targeting inhibitors ATP competitive kidney cancer virtual screening Docking سرطان الكلى الفحص الافتراضي الالتحا م ATP الهدف المانع المنافسة ل MET Résumé : Le MET, est un gène humain qui code pour le récepteur du facteur de croissance des hépatocytes ‘HGF’, il joue un rôle essentiel dans la régulation de plusieurs processus cellulaires tels que la prolifération, le développement embryonnaire, la mobilité et migration cellulaires. C’est un proto-oncogène qui provoque divers types de cancers, notamment le carcinome à cellules rénales. L'étude approfondie des fonctions de la protéine MET est fondamentale pour mieux assimiler les variations oncogènes et développer des thérapies ciblées contre le cancer.
Cette recherche a pour but de prédire, in silico, l'effet des mutations associées au cancer du rein sur la fonction de la protéine MET, afin de prévenir les résistances aux médicaments compétitifs de l'ATP utilisés et d'identifier de nouveaux inhibiteurs potentiels qui pourraient efficacement cibler ces variantes, à l'aide du criblage virtuel basé sur le Docking.
Dans le cadre de notre étude,1614 mutations ont été étudiées en vue de prédire leur impact sur la fonction de la protéine MET, Parmi celles-ci, 53 mutations qui en relation avec le cancer du rein ont été sélectionnées au niveau du domaine kinase de cette protéine.
En plus, 6143 composés ont été extraits de ‘Binding dB’, qui ont un effet inhibiteur contre MET. Après une vérification de la toxicité, des règles de ‘Lipinski’ et ‘Veber’ ainsi IC50 des inhibiteurs de référence, ‘Capmatinib, Foretinib’ qui sont compétitifs pour l’ATP, 16 composés sont retenus pour le Docking avec le type sauvage ‘3DKC’ et 53 types mutés. Ils sont ensuite comparés aux inhibiteurs de référence. Nos résultats montrent que deux composés non toxiques ID ‘122179445’ et ‘91808147’, présentent de meilleures affinités par rapport au ‘Capmatinib’, et proposés pour traitement contre le cancer du rein.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0242023 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : KANDOUSSI Ilham Juge : AANNIZ Tarik Juge : SBABOU Laila ÉTUDE IN SILICO DU PROFIL MUTATIONNEL DU RECEPTEUR MET : IMPACT SUR LA REPONSE AU TRAITEMENT ET EXPLORATION DE NOUVEAUX INHIBITEURS ATOXIQUES POUR LE CANCER DE REIN [thèse] / HBIBI IMANE, Auteur . - 2023.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : MET cibler inhibiteurs compétitif pour l’ATP cancer du rein criblage virtuel Docking MET targeting inhibitors ATP competitive kidney cancer virtual screening Docking سرطان الكلى الفحص الافتراضي الالتحا م ATP الهدف المانع المنافسة ل MET Résumé : Le MET, est un gène humain qui code pour le récepteur du facteur de croissance des hépatocytes ‘HGF’, il joue un rôle essentiel dans la régulation de plusieurs processus cellulaires tels que la prolifération, le développement embryonnaire, la mobilité et migration cellulaires. C’est un proto-oncogène qui provoque divers types de cancers, notamment le carcinome à cellules rénales. L'étude approfondie des fonctions de la protéine MET est fondamentale pour mieux assimiler les variations oncogènes et développer des thérapies ciblées contre le cancer.
Cette recherche a pour but de prédire, in silico, l'effet des mutations associées au cancer du rein sur la fonction de la protéine MET, afin de prévenir les résistances aux médicaments compétitifs de l'ATP utilisés et d'identifier de nouveaux inhibiteurs potentiels qui pourraient efficacement cibler ces variantes, à l'aide du criblage virtuel basé sur le Docking.
Dans le cadre de notre étude,1614 mutations ont été étudiées en vue de prédire leur impact sur la fonction de la protéine MET, Parmi celles-ci, 53 mutations qui en relation avec le cancer du rein ont été sélectionnées au niveau du domaine kinase de cette protéine.
En plus, 6143 composés ont été extraits de ‘Binding dB’, qui ont un effet inhibiteur contre MET. Après une vérification de la toxicité, des règles de ‘Lipinski’ et ‘Veber’ ainsi IC50 des inhibiteurs de référence, ‘Capmatinib, Foretinib’ qui sont compétitifs pour l’ATP, 16 composés sont retenus pour le Docking avec le type sauvage ‘3DKC’ et 53 types mutés. Ils sont ensuite comparés aux inhibiteurs de référence. Nos résultats montrent que deux composés non toxiques ID ‘122179445’ et ‘91808147’, présentent de meilleures affinités par rapport au ‘Capmatinib’, et proposés pour traitement contre le cancer du rein.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0242023 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : KANDOUSSI Ilham Juge : AANNIZ Tarik Juge : SBABOU Laila Réservation
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Titre : EVALUATION IN SILICO DES EFFETS DES MUTATIONS PNCTUELLES SUR LA PROTEINE BRAF ET LEUR IMPACT SUR LE CHOIX DE TRAITEMENT Type de document : thèse Auteurs : KOUROU JOUHAINA, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : MAPK BRAF Inhibiteur Cancer Criblage virtuel MAPK BRAF inhibitor cancer virtual screening Docking APK BRAF المانع السرطان الفحص االفتراضي اإلرساء Résumé : "La voie de signalisation MAPK reste l’une des principales voies de prolifération cellulaire. Celle-ci est essentielle pour la croissance, la différenciation et la survie cellulaire. La voie de MAPK a un complexe unique de phosphorylation « RAS/RAF/MEK/ERK ». Dans cette voie, la protéine BRAF joue un rôle important dans cette cascade. Cette protéine sérine/thréonine kinase, en fonctionnant comme un proto-oncogène, est la cause de plusieurs types de cancer, notamment les mélanomes. L’étude des fonctions de cette protéine est indispensable pour mieux comprendre les mécanismes d’altération oncogénique. Pour cela, plusieurs thérapies ont été développé, ciblant BRAF, afin de traiter le cancer.
Ce travail a pour but de prédire, in silico, l’effet de stabilité et de flexibilité des mutations sur la fonction de la protéine, ainsi d’identifier des nouveaux inhibiteurs potentiels de BRAF, en utilisant le criblage virtuel et le Docking.
Lors de notre travail, 491 mutations ont été étudiées, afin de prédire leurs effets sur la stabilité, la flexibilité et la fonction de la protéine. 3 mutations, qui sont respectivement (G469E, L584F, A621S), ont été sélectionnées de différents 3 domaines de la protéine BRAF : ATP-binding, kinase, boucle d’activation.
En outre, 101 composés ont été sélectionnés de Binding dB, ayant un effet inhibiteur contre BRAF. Après une évaluation de toxicité et des règles de Lipinski et Veber, 78 composés sont utilisés en Docking. Les résultats ont été comparés avec les inhibiteurs de référence : Sorafénib, Dabrafénib, Vémurafénib, et Encorafénib. Alors, 1 seul composé « BDBM300299 », ayant des bons résultats, est proposé comme traitement anti-cancéreux."
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0372022 Président : IBRAHIMI AZEDDINE Directeur : OUADGHIRI MOUNA Juge : ILHAM KANDOUSSI EVALUATION IN SILICO DES EFFETS DES MUTATIONS PNCTUELLES SUR LA PROTEINE BRAF ET LEUR IMPACT SUR LE CHOIX DE TRAITEMENT [thèse] / KOUROU JOUHAINA, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : MAPK BRAF Inhibiteur Cancer Criblage virtuel MAPK BRAF inhibitor cancer virtual screening Docking APK BRAF المانع السرطان الفحص االفتراضي اإلرساء Résumé : "La voie de signalisation MAPK reste l’une des principales voies de prolifération cellulaire. Celle-ci est essentielle pour la croissance, la différenciation et la survie cellulaire. La voie de MAPK a un complexe unique de phosphorylation « RAS/RAF/MEK/ERK ». Dans cette voie, la protéine BRAF joue un rôle important dans cette cascade. Cette protéine sérine/thréonine kinase, en fonctionnant comme un proto-oncogène, est la cause de plusieurs types de cancer, notamment les mélanomes. L’étude des fonctions de cette protéine est indispensable pour mieux comprendre les mécanismes d’altération oncogénique. Pour cela, plusieurs thérapies ont été développé, ciblant BRAF, afin de traiter le cancer.
Ce travail a pour but de prédire, in silico, l’effet de stabilité et de flexibilité des mutations sur la fonction de la protéine, ainsi d’identifier des nouveaux inhibiteurs potentiels de BRAF, en utilisant le criblage virtuel et le Docking.
Lors de notre travail, 491 mutations ont été étudiées, afin de prédire leurs effets sur la stabilité, la flexibilité et la fonction de la protéine. 3 mutations, qui sont respectivement (G469E, L584F, A621S), ont été sélectionnées de différents 3 domaines de la protéine BRAF : ATP-binding, kinase, boucle d’activation.
En outre, 101 composés ont été sélectionnés de Binding dB, ayant un effet inhibiteur contre BRAF. Après une évaluation de toxicité et des règles de Lipinski et Veber, 78 composés sont utilisés en Docking. Les résultats ont été comparés avec les inhibiteurs de référence : Sorafénib, Dabrafénib, Vémurafénib, et Encorafénib. Alors, 1 seul composé « BDBM300299 », ayant des bons résultats, est proposé comme traitement anti-cancéreux."
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0372022 Président : IBRAHIMI AZEDDINE Directeur : OUADGHIRI MOUNA Juge : ILHAM KANDOUSSI Réservation
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