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6 résultat(s) recherche sur le mot-clé 'docking moléculaire' 
Affiner la recherche Faire une suggestionCONCEPTION D’UN INHIBITEUR DE LA MONOAMINE OXYDASE, LE «4-HYDROXYPYRAZOLO[3,4-D][1,2,3]TRIAZINE» : APPROCHE IN SILICO ET COMPLEXATION AVEC LE GALLIUM ET LE RHENIUM / TYOUBI SALMA
Titre : CONCEPTION D’UN INHIBITEUR DE LA MONOAMINE OXYDASE, LE «4-HYDROXYPYRAZOLO[3,4-D][1,2,3]TRIAZINE» : APPROCHE IN SILICO ET COMPLEXATION AVEC LE GALLIUM ET LE RHENIUM Type de document : thèse Auteurs : TYOUBI SALMA, Auteur Année de publication : 2024 Langues : Français (fre) Mots-clés : Monoamine oxydase (MAO) Inhibiteurs de la monoamine oxydase (IMAO) Maladies neurodégénératives Docking moléculaire ADMET-Tox Complexation Rhénium Monoamine oxidase (MAO) Monoamine oxidase inhibitors (MAOIs) لأمراض (MAOIs) مثبطات أحادي الأمين أوكسيداز (MAO) أحادي الأمين أوكسيداز
التعقيد الرينيوم الغاليوم. ADMET-Tox التنكسية العصبية الربط الجزيئي Neurodegenerative diseases Molecular docking ADMET-Tox Complexation Rhenium GalliumRésumé : La monoamine oxydase (MAO) joue un rôle crucial en générant du stress oxydatif par la
production de peroxyde d'hydrogène (H2O2) et participe activement à la dégradation des
neurotransmetteurs monoaminergiques comme la dopamine, la noradrénaline et la sérotonine.
Certains inhibiteurs de cette enzyme montrent un potentiel prometteur dans le traitement de
diverses maladies neurodégénératives. Cependant, les inhibiteurs de la monoamine oxydase
(IMAO) sont associés à plusieurs effets indésirables, notamment le risque de crise hypertensive.
L’objectif de cette étude est de contribuer à la conception d’un nouveau dérivé de
pyrazole, le « 4-hydroxypyrazolo[3,4-d][1,2,3]triazine », ayant un potentiel effet inhibiteur de
la monoamine oxydase pour des applications futures en diagnostic et en thérapie, via une
approche in silico et des complexations avec le gallium et le rhénium.
Les résultats du docking moléculaire avec les isoenzymes MAO-A et MAO-B ont révélé
une spécificité envers la MAO-B. L’analyse ADMET in silico de la molécule a montré des
caractéristiques pharmacocinétiques prometteuses, suggérant qu’elle pourrait être un candidat
médicamenteux efficace. La complexation avec le rhénium et le gallium a confirmé la formation
d'un complexe ML2 stable avec le gallium et aucun complexe avec le rhénium, ouvrant ainsi
des perspectives prometteuses pour son utilisation future en radiomarquage.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0302024 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : BOUAYYADI Abdellatif Encadrant externe ; KANDOUSSI Ilham Juge : AANNIZ Tarik CONCEPTION D’UN INHIBITEUR DE LA MONOAMINE OXYDASE, LE «4-HYDROXYPYRAZOLO[3,4-D][1,2,3]TRIAZINE» : APPROCHE IN SILICO ET COMPLEXATION AVEC LE GALLIUM ET LE RHENIUM [thèse] / TYOUBI SALMA, Auteur . - 2024.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Monoamine oxydase (MAO) Inhibiteurs de la monoamine oxydase (IMAO) Maladies neurodégénératives Docking moléculaire ADMET-Tox Complexation Rhénium Monoamine oxidase (MAO) Monoamine oxidase inhibitors (MAOIs) لأمراض (MAOIs) مثبطات أحادي الأمين أوكسيداز (MAO) أحادي الأمين أوكسيداز
التعقيد الرينيوم الغاليوم. ADMET-Tox التنكسية العصبية الربط الجزيئي Neurodegenerative diseases Molecular docking ADMET-Tox Complexation Rhenium GalliumRésumé : La monoamine oxydase (MAO) joue un rôle crucial en générant du stress oxydatif par la
production de peroxyde d'hydrogène (H2O2) et participe activement à la dégradation des
neurotransmetteurs monoaminergiques comme la dopamine, la noradrénaline et la sérotonine.
Certains inhibiteurs de cette enzyme montrent un potentiel prometteur dans le traitement de
diverses maladies neurodégénératives. Cependant, les inhibiteurs de la monoamine oxydase
(IMAO) sont associés à plusieurs effets indésirables, notamment le risque de crise hypertensive.
L’objectif de cette étude est de contribuer à la conception d’un nouveau dérivé de
pyrazole, le « 4-hydroxypyrazolo[3,4-d][1,2,3]triazine », ayant un potentiel effet inhibiteur de
la monoamine oxydase pour des applications futures en diagnostic et en thérapie, via une
approche in silico et des complexations avec le gallium et le rhénium.
Les résultats du docking moléculaire avec les isoenzymes MAO-A et MAO-B ont révélé
une spécificité envers la MAO-B. L’analyse ADMET in silico de la molécule a montré des
caractéristiques pharmacocinétiques prometteuses, suggérant qu’elle pourrait être un candidat
médicamenteux efficace. La complexation avec le rhénium et le gallium a confirmé la formation
d'un complexe ML2 stable avec le gallium et aucun complexe avec le rhénium, ouvrant ainsi
des perspectives prometteuses pour son utilisation future en radiomarquage.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0302024 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : BOUAYYADI Abdellatif Encadrant externe ; KANDOUSSI Ilham Juge : AANNIZ Tarik Réservation
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Titre : CRIBLAGE IN SILICO DES COMPOSES PHYTOCHIMIQUES D'ORIGINE NATURELLE CONTRE LA PROTEASE PRINCIPALE (MPRO) DU SARS-COV-2. Type de document : thèse Auteurs : SALMAN EL MOSTAFA, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : Composés Naturels SARS-CoV-2 Mpro Screening Virtuel Docking Moléculaire Prédiction ADMET Natural products SARS-CoV-2 Mpro Virtual Screening Molecular Docking ADMET Prediction االنزيم الرئيسي )Mpro 2-CoV-SARS ،)فحص افتراضي االلتحام الجزيئي النشاط الدوائي. Résumé : L'absence de traitements efficaces de la nouvelle maladie à coronavirus (COVID-19) a conduit
à la recherche d'antiviraux spécifiques capables d'inhiber la réplication du virus. Plusieurs
médicaments tels que le remdesivir, le molnupiravir et le paxlovid ont été inclus dans le schéma
thérapeutique et ont montré des résultats efficaces dans plusieurs cas, mais parfois avec des effets
secondaires qui sont assez graves. Cependant, pour atténuer la crise actuelle et se préparer aux
futures pandémies, il existe un besoin continu d'explorer la diversité des composés naturels pour
leur activité antivirale. La protéase principale (Mpro) du SARS-CoV-2 est reconnue comme une
cible thérapeutique réussie pour le développement de nouveaux médicaments.
L’objectif de cette étude est d’investiguer les modes d’interactions d’un ensemble de 350
molécules d’origine naturelle récupérés à partir de la chimiothèque AMBINTER SARL afin de
pouvoir diriger la conception rationnelle de nouvelles molécules hautement sélectives pour la
(Mpro). Le Criblage virtuel et l’amarrage moléculaire deux techniques qui ont été effectués afin
d’étudier le mécanisme d’interaction de ces composés avec la (Mpro). L’évaluation prédictive
des propriétés physicochimiques et les paramètres pharmacocinétiques de ces molécules est prise
en compte afin de prouver leur activité pharmacologique ainsi que, leur interaction
médicamenteuse. À l’issue de ce travail, il s’est avéré que les composés AMB1953578 (A),
AMB29566134 (C) et AMB18482225 (D) sont pourvus d’une bonne affinité vis-à-vis la (Mpro)
avec des scores de liaisons -8,2, -8,0 et -8,7 Kcal/mol respectivement, et d’un profil
pharmacologique satisfaisant par rapport un ligand de référence (Masitinib) considéré comme
un inhibiteur non covalent, capable d'inhiber la principale protéase (Mpro) avec un score de
liaison -8,3 Kcal/mol. Ces composés représentent des médicaments promoteurs pour l’avenir.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0482022 Président : EL HARTI JAOUAD, Directeur : MAURADY Amal, Juge : KANDOUSSI Ilham, CRIBLAGE IN SILICO DES COMPOSES PHYTOCHIMIQUES D'ORIGINE NATURELLE CONTRE LA PROTEASE PRINCIPALE (MPRO) DU SARS-COV-2. [thèse] / SALMAN EL MOSTAFA, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Composés Naturels SARS-CoV-2 Mpro Screening Virtuel Docking Moléculaire Prédiction ADMET Natural products SARS-CoV-2 Mpro Virtual Screening Molecular Docking ADMET Prediction االنزيم الرئيسي )Mpro 2-CoV-SARS ،)فحص افتراضي االلتحام الجزيئي النشاط الدوائي. Résumé : L'absence de traitements efficaces de la nouvelle maladie à coronavirus (COVID-19) a conduit
à la recherche d'antiviraux spécifiques capables d'inhiber la réplication du virus. Plusieurs
médicaments tels que le remdesivir, le molnupiravir et le paxlovid ont été inclus dans le schéma
thérapeutique et ont montré des résultats efficaces dans plusieurs cas, mais parfois avec des effets
secondaires qui sont assez graves. Cependant, pour atténuer la crise actuelle et se préparer aux
futures pandémies, il existe un besoin continu d'explorer la diversité des composés naturels pour
leur activité antivirale. La protéase principale (Mpro) du SARS-CoV-2 est reconnue comme une
cible thérapeutique réussie pour le développement de nouveaux médicaments.
L’objectif de cette étude est d’investiguer les modes d’interactions d’un ensemble de 350
molécules d’origine naturelle récupérés à partir de la chimiothèque AMBINTER SARL afin de
pouvoir diriger la conception rationnelle de nouvelles molécules hautement sélectives pour la
(Mpro). Le Criblage virtuel et l’amarrage moléculaire deux techniques qui ont été effectués afin
d’étudier le mécanisme d’interaction de ces composés avec la (Mpro). L’évaluation prédictive
des propriétés physicochimiques et les paramètres pharmacocinétiques de ces molécules est prise
en compte afin de prouver leur activité pharmacologique ainsi que, leur interaction
médicamenteuse. À l’issue de ce travail, il s’est avéré que les composés AMB1953578 (A),
AMB29566134 (C) et AMB18482225 (D) sont pourvus d’une bonne affinité vis-à-vis la (Mpro)
avec des scores de liaisons -8,2, -8,0 et -8,7 Kcal/mol respectivement, et d’un profil
pharmacologique satisfaisant par rapport un ligand de référence (Masitinib) considéré comme
un inhibiteur non covalent, capable d'inhiber la principale protéase (Mpro) avec un score de
liaison -8,3 Kcal/mol. Ces composés représentent des médicaments promoteurs pour l’avenir.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0482022 Président : EL HARTI JAOUAD, Directeur : MAURADY Amal, Juge : KANDOUSSI Ilham, Réservation
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Titre : ETUDE DE L’ACTIVITE ANTI-TUMORALE DE CERTAINS BENZIMIDAZOLES PAR MODELISATION MOLECULAIRE Type de document : thèse Auteurs : Ahmed EL RHAZ, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Français (fre) Mots-clés : Benzimidazole Activité anti-tumorale Docking moléculaire Histone désacétylase Résumé : Le benzimidazole est un composé organique aromatique hétérocyclique formé par la fusion de
benzène et d'imidazole. Il s'agit d'une structure qui occupe une place primordiale en chimie
thérapeutique et revêt une grande importance dans la recherche de nouvelles molécules bioactives. En
particulier, ce noyau présente un grand intérêt en cancérologie et constitue un pharmacophore de base
pour la conception de molécules anti-tumorales. Dans le prolongement des travaux mené au
laboratoire de chimie thérapeutique, nous proposons dans ce travail la conception de nouvelles
molécules inhibitrices de HDAC1 dérivées de l’albendazole.
En exploitant la technique de docking moléculaire comme technique de recherche rationnelle de
molécules bioactives et en utilisant le HDAC1 (code PDB : 4BKX) comme cible thérapeutique de
cette étude, nous avons proposé 3 séries de molécules à base de benzimidazol au tant qu’inhibiteur de
HDAC1.
Les résultats du docking moléculaire ont démontré que l’énergie d’affinité des molécules
proposées augmente et leurs insertions au niveau du site actif s’améliorent selon la nature de
l’espaceur et le ZBG utilisés. En particulier, le produit 3e possède une énergie d’affinité de l’ordre -
7.5kcal/mol supérieur à celle du Pracinostat pris comme référence. Cette molécule possède une
meilleure insertion dans la poche du site actif. Cette insertion est consolidée par la chélation du Zinc
qui est responsable de l’activité enzymatique du HDAC1. La présence du noyau benzimidazole
(coiffe) confère à la molécule des propriétés hydrophobes élevées permettant à cette molécule
d’interagir fortement avec les acides aminés du site actif, en conséquence une forte inhibition
d’HDAC1Numéro (Thèse ou Mémoire) : P1042021 Président : M’hammed ANSAR Directeur : Jaouad EL HARTI Juge : Mohammed OULAD BOUYAHYA IDRISSI ETUDE DE L’ACTIVITE ANTI-TUMORALE DE CERTAINS BENZIMIDAZOLES PAR MODELISATION MOLECULAIRE [thèse] / Ahmed EL RHAZ, Auteur . - 2021.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Benzimidazole Activité anti-tumorale Docking moléculaire Histone désacétylase Résumé : Le benzimidazole est un composé organique aromatique hétérocyclique formé par la fusion de
benzène et d'imidazole. Il s'agit d'une structure qui occupe une place primordiale en chimie
thérapeutique et revêt une grande importance dans la recherche de nouvelles molécules bioactives. En
particulier, ce noyau présente un grand intérêt en cancérologie et constitue un pharmacophore de base
pour la conception de molécules anti-tumorales. Dans le prolongement des travaux mené au
laboratoire de chimie thérapeutique, nous proposons dans ce travail la conception de nouvelles
molécules inhibitrices de HDAC1 dérivées de l’albendazole.
En exploitant la technique de docking moléculaire comme technique de recherche rationnelle de
molécules bioactives et en utilisant le HDAC1 (code PDB : 4BKX) comme cible thérapeutique de
cette étude, nous avons proposé 3 séries de molécules à base de benzimidazol au tant qu’inhibiteur de
HDAC1.
Les résultats du docking moléculaire ont démontré que l’énergie d’affinité des molécules
proposées augmente et leurs insertions au niveau du site actif s’améliorent selon la nature de
l’espaceur et le ZBG utilisés. En particulier, le produit 3e possède une énergie d’affinité de l’ordre -
7.5kcal/mol supérieur à celle du Pracinostat pris comme référence. Cette molécule possède une
meilleure insertion dans la poche du site actif. Cette insertion est consolidée par la chélation du Zinc
qui est responsable de l’activité enzymatique du HDAC1. La présence du noyau benzimidazole
(coiffe) confère à la molécule des propriétés hydrophobes élevées permettant à cette molécule
d’interagir fortement avec les acides aminés du site actif, en conséquence une forte inhibition
d’HDAC1Numéro (Thèse ou Mémoire) : P1042021 Président : M’hammed ANSAR Directeur : Jaouad EL HARTI Juge : Mohammed OULAD BOUYAHYA IDRISSI Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité P1042021 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesPharm2021 Disponible P1042021-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesPharm2021 Disponible Documents numériques
P1042021URL
Titre : ETUDE IN SILICO DES SNP DE LA PI3KΑ LIÉS À CERTAINS TYPES DE TUMEURS SOLIDES, IMPACT SUR LA RÉPONSE AU TRAITEMENT ET IDENTIFICATION DE NOUVEAUX INHIBITEURS Type de document : thèse Auteurs : ABIDOU AYA, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Français (fre) Mots-clés : PI3K PIK3CA docking moléculaire criblage virtuel inhibiteur cancer PI3K PIK3CA molecular docking virtual screening inhibitor الالتحام الجزيئي ا Résumé : La protéine PI3K est une kinase lipidique qui joue un rôle crucial dans la croissance, la division et la survie des cellules. L'isoforme PI3Kα est composé d’une sous-unité régulatrice p85 et une sous unité catalytique p110α. Cette dernière, codés par le gène PIK3CA est souvent surexprimée dans plusieurs types de cancers.
L'objectif de notre étude est de prédire in silico les effets des mutations du gène PIK3CA sur PI3Kα et de proposer des inhibiteurs potentiels ciblant cet isoforme dans le cancer du sein, du côlon, de l'endomètre et de l'ovaire.
Cette étude a utilisé des techniques computationnelles basées sur la structure de la PI3Kα et sur les ligands, passant par la prédiction des effets mutationnels du gène PIK3CA qui nous a permis de caractériser 31 mutations délétères parmi 100 mutations recueillies dans les bases de données pour chaque type de cancer. Ensuite, un criblage virtuel a été réalisé sur 21 ligands, ce qui a permis de sélectionner 12 inhibiteurs potentiels non toxiques et représentant des propriétés physicochimiques optimal. On a indiqué en parallèle des inhibiteurs de référence (alpelisib, copanlisib, pictilisib et inavolisib). Finalement, un docking moléculaire a été réalisé pour évaluer l’affinité des différents ligands pour le type sauvage et pour les différentes mutations.
Nos résultats montrent que le Lig5 (CID137641601) avait une forte affinité pour la plupart des cibles dans les quatre types de cancer étudiés, ce qui nous a permis de le proposer comme médicament candidat très pertinent. Par contre, il y’avais des mutations qui ont montré un effet positif suite à leur interaction avec le Lig8 (CID137656901). Ces ligands ciblant la PI3Kα peuvent faire l’objet des études in vitro et in vivo puis précliniques et cliniques pour le traitement des tumeurs solides avec une affinité de liaison meilleure que celle des inhibiteurs de référence choisis.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0012023 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : KANDOUSSI Ilham Juge : AANNIZ Tarik Juge : SBABOU Laila ETUDE IN SILICO DES SNP DE LA PI3KΑ LIÉS À CERTAINS TYPES DE TUMEURS SOLIDES, IMPACT SUR LA RÉPONSE AU TRAITEMENT ET IDENTIFICATION DE NOUVEAUX INHIBITEURS [thèse] / ABIDOU AYA, Auteur . - 2021.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : PI3K PIK3CA docking moléculaire criblage virtuel inhibiteur cancer PI3K PIK3CA molecular docking virtual screening inhibitor الالتحام الجزيئي ا Résumé : La protéine PI3K est une kinase lipidique qui joue un rôle crucial dans la croissance, la division et la survie des cellules. L'isoforme PI3Kα est composé d’une sous-unité régulatrice p85 et une sous unité catalytique p110α. Cette dernière, codés par le gène PIK3CA est souvent surexprimée dans plusieurs types de cancers.
L'objectif de notre étude est de prédire in silico les effets des mutations du gène PIK3CA sur PI3Kα et de proposer des inhibiteurs potentiels ciblant cet isoforme dans le cancer du sein, du côlon, de l'endomètre et de l'ovaire.
Cette étude a utilisé des techniques computationnelles basées sur la structure de la PI3Kα et sur les ligands, passant par la prédiction des effets mutationnels du gène PIK3CA qui nous a permis de caractériser 31 mutations délétères parmi 100 mutations recueillies dans les bases de données pour chaque type de cancer. Ensuite, un criblage virtuel a été réalisé sur 21 ligands, ce qui a permis de sélectionner 12 inhibiteurs potentiels non toxiques et représentant des propriétés physicochimiques optimal. On a indiqué en parallèle des inhibiteurs de référence (alpelisib, copanlisib, pictilisib et inavolisib). Finalement, un docking moléculaire a été réalisé pour évaluer l’affinité des différents ligands pour le type sauvage et pour les différentes mutations.
Nos résultats montrent que le Lig5 (CID137641601) avait une forte affinité pour la plupart des cibles dans les quatre types de cancer étudiés, ce qui nous a permis de le proposer comme médicament candidat très pertinent. Par contre, il y’avais des mutations qui ont montré un effet positif suite à leur interaction avec le Lig8 (CID137656901). Ces ligands ciblant la PI3Kα peuvent faire l’objet des études in vitro et in vivo puis précliniques et cliniques pour le traitement des tumeurs solides avec une affinité de liaison meilleure que celle des inhibiteurs de référence choisis.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0012023 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : KANDOUSSI Ilham Juge : AANNIZ Tarik Juge : SBABOU Laila Réservation
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Titre : EXPLORATION OF NEW ANTI-TUBERCULOSIS DRUGS BY TARGETING DIHYDROFOLATE REDUCTASE Type de document : thèse Auteurs : JAOUID OUSSAMA, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : World Health Organization (WHO) Tuberculosis Mycobacterium tuberculosis dihydrofolate reductase (Mt-DHFR) Structure-based virtual screening Molecular Docking Organisation mondiale de la santé (OMS) Tuberculose, Mycobacterium tuberculosis dihydrofolate réductase (Mt-DHFR) Criblage virtuel basé sur la structure Docking moléculaire Résumé : Tuberculosis (TB) is one of the ten leading causes of death in the world and the main source of infection from a single infectious agent, the World Health Organization (WHO) states that one third of the world's population is now infected with TB, therefore the increase in TB treatment and so a series of drug-resistant strains have emerged, diagnosis and therapy of multidrug-resistant TB continues to be a major hurdle and is far from being fully solved. Given the urgency of the situation, the current study uses the advantages of virtual high-throughput screening approaches to identify molecules targeting Mycobacterium tuberculosis dihydrofolate reductase (Mt-DHFR), an enzyme critical for Mycobacterium tuberculosis proliferation. In the extension of the Mt-DHFR ligand pocket, there is a small hydrophobic pocket that hosts a glycerol molecule (GOL), this pocket does not exist in the human protein. Based on these data, our study explored new Mycobacterium tuberculosis specific inhibitors targeting Mt-DHFR by the in-silico approach. From a set of 8412 compounds, toxicity evaluation and validation of Lipinski and Veber's rule allowed to identify 11 new small molecules whose interaction with the target with and without glycerol were studied by Docking, the results were compared with 5 reference molecules chosen from the literature in addition to natural ligand of the target. Thus for the evaluation of specificity, these molecules were also tested on human DHRF, the results showed that Methotrexate is the best reference inhibitor and that the affinities of the molecules towards Mt-DHFR with glycerol are better than without glycerol, It is so 8 molecules present an affinity towards the bacterial enzyme with glycerol better than that of Methotrexate, also 9 presenting a better affinity than that of natural substrate, among which 3 have a weak affinity towards the human enzyme compared to the bacterial enzyme. In the light of the results obtained we propose 3 inhibitors of Mycobacterium tuberculosis targeting Mt-DHFR with better activity and interactions than the reference inhibitors and which conform to the rules of Lipinski and Veber supposed to have antitubercular potential. Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0732020 Président : Azeddine Ibrahimi Directeur : Ilham Kandoussi Juge : Mouna Ouadghiri EXPLORATION OF NEW ANTI-TUBERCULOSIS DRUGS BY TARGETING DIHYDROFOLATE REDUCTASE [thèse] / JAOUID OUSSAMA, Auteur . - 2022.
Langues : Anglais (eng)
Mots-clés : World Health Organization (WHO) Tuberculosis Mycobacterium tuberculosis dihydrofolate reductase (Mt-DHFR) Structure-based virtual screening Molecular Docking Organisation mondiale de la santé (OMS) Tuberculose, Mycobacterium tuberculosis dihydrofolate réductase (Mt-DHFR) Criblage virtuel basé sur la structure Docking moléculaire Résumé : Tuberculosis (TB) is one of the ten leading causes of death in the world and the main source of infection from a single infectious agent, the World Health Organization (WHO) states that one third of the world's population is now infected with TB, therefore the increase in TB treatment and so a series of drug-resistant strains have emerged, diagnosis and therapy of multidrug-resistant TB continues to be a major hurdle and is far from being fully solved. Given the urgency of the situation, the current study uses the advantages of virtual high-throughput screening approaches to identify molecules targeting Mycobacterium tuberculosis dihydrofolate reductase (Mt-DHFR), an enzyme critical for Mycobacterium tuberculosis proliferation. In the extension of the Mt-DHFR ligand pocket, there is a small hydrophobic pocket that hosts a glycerol molecule (GOL), this pocket does not exist in the human protein. Based on these data, our study explored new Mycobacterium tuberculosis specific inhibitors targeting Mt-DHFR by the in-silico approach. From a set of 8412 compounds, toxicity evaluation and validation of Lipinski and Veber's rule allowed to identify 11 new small molecules whose interaction with the target with and without glycerol were studied by Docking, the results were compared with 5 reference molecules chosen from the literature in addition to natural ligand of the target. Thus for the evaluation of specificity, these molecules were also tested on human DHRF, the results showed that Methotrexate is the best reference inhibitor and that the affinities of the molecules towards Mt-DHFR with glycerol are better than without glycerol, It is so 8 molecules present an affinity towards the bacterial enzyme with glycerol better than that of Methotrexate, also 9 presenting a better affinity than that of natural substrate, among which 3 have a weak affinity towards the human enzyme compared to the bacterial enzyme. In the light of the results obtained we propose 3 inhibitors of Mycobacterium tuberculosis targeting Mt-DHFR with better activity and interactions than the reference inhibitors and which conform to the rules of Lipinski and Veber supposed to have antitubercular potential. Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0732020 Président : Azeddine Ibrahimi Directeur : Ilham Kandoussi Juge : Mouna Ouadghiri Réservation
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MM0732020URL
Titre : INHIBITION DU QUORUM SENSING CHEZ HELICOBACTER PYLORI PAR APPROCHE IN SILICO Type de document : thèse Auteurs : WAKRIM Hajar, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Français (fre) Mots-clés : Hélicobactere pylori Quorum sensing TLPB LUXS Modeller Docking moléculaire Autodock vina Résumé : Le quorum sensing (QS) permet aux bactéries d'organiser leurs activités au niveau de la population. Il a été démontré que certaines petites molécules, connus sous le nom d'inhibiteurs de détection de quorum (QSI), bloquent efficacement le QS et atténuent par la suite la virulence bactérienne. Dans cette étude, une approche de criblage virtuel basé sur la structure (SBVS) a été utilisée pour la découverte de nouveaux candidats QSI chez hélicobacter pylori. Pour ce faire nous avons ciblé le blocage de l’activité de LUXS et TLPB, deux protéines clés de quorum sensing chez ladite bactérie. Nous avons réalisé le repositionnement de 190 médicaments en plus d’un criblage d’une base de données de 400 molécules d’origine naturelles, d’une base de données de molécules chimiques ‘Mcule’ (10000 molécules) et de 10 dérivés synthétiques. Le docking moléculaire a été réalisé via Autodock Vina, les règles de lipinski ont été vérifiées et le test de toxicité a été évalué pour les ligands ayant donnés les meilleures affinités.
Au total, 23 molécules ayant montré des meilleures affinités (entre -7,0 et -6,1 kcal/mol) envers LUXS par rapport à son ligand naturel, méthionine (-3,9 kcal/mol). Ces ligands incluent 9 médicaments, 2 molécules d’origine naturelle, 9 molécules extraites de la base de données Mcule et 3 dérivés synthétiques. En parallèle, 30 molécules ont été retenues pour leurs fortes affinités (entre -10,0 et -8,0) envers TLPB, à savoir 17 médicaments, 2 molécules d’origine naturelle, 7 molécules extraites de la base de données Mcule en plus de 4 dérivés synthétiques.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0452021 Président : OUADGHIIR Mouna Directeur : AANNIZ Tarik Juge : KANDOUSSI Ilham INHIBITION DU QUORUM SENSING CHEZ HELICOBACTER PYLORI PAR APPROCHE IN SILICO [thèse] / WAKRIM Hajar, Auteur . - 2021.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Hélicobactere pylori Quorum sensing TLPB LUXS Modeller Docking moléculaire Autodock vina Résumé : Le quorum sensing (QS) permet aux bactéries d'organiser leurs activités au niveau de la population. Il a été démontré que certaines petites molécules, connus sous le nom d'inhibiteurs de détection de quorum (QSI), bloquent efficacement le QS et atténuent par la suite la virulence bactérienne. Dans cette étude, une approche de criblage virtuel basé sur la structure (SBVS) a été utilisée pour la découverte de nouveaux candidats QSI chez hélicobacter pylori. Pour ce faire nous avons ciblé le blocage de l’activité de LUXS et TLPB, deux protéines clés de quorum sensing chez ladite bactérie. Nous avons réalisé le repositionnement de 190 médicaments en plus d’un criblage d’une base de données de 400 molécules d’origine naturelles, d’une base de données de molécules chimiques ‘Mcule’ (10000 molécules) et de 10 dérivés synthétiques. Le docking moléculaire a été réalisé via Autodock Vina, les règles de lipinski ont été vérifiées et le test de toxicité a été évalué pour les ligands ayant donnés les meilleures affinités.
Au total, 23 molécules ayant montré des meilleures affinités (entre -7,0 et -6,1 kcal/mol) envers LUXS par rapport à son ligand naturel, méthionine (-3,9 kcal/mol). Ces ligands incluent 9 médicaments, 2 molécules d’origine naturelle, 9 molécules extraites de la base de données Mcule et 3 dérivés synthétiques. En parallèle, 30 molécules ont été retenues pour leurs fortes affinités (entre -10,0 et -8,0) envers TLPB, à savoir 17 médicaments, 2 molécules d’origine naturelle, 7 molécules extraites de la base de données Mcule en plus de 4 dérivés synthétiques.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0452021 Président : OUADGHIIR Mouna Directeur : AANNIZ Tarik Juge : KANDOUSSI Ilham Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0452021 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible MM0452021-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2021 Disponible Documents numériques
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