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ETUDE IN SILICO DES SNP DE LA PI3KΑ LIÉS À CERTAINS TYPES DE TUMEURS SOLIDES, IMPACT SUR LA RÉPONSE AU TRAITEMENT ET IDENTIFICATION DE NOUVEAUX INHIBITEURS / ABIDOU AYA
Titre : ETUDE IN SILICO DES SNP DE LA PI3KΑ LIÉS À CERTAINS TYPES DE TUMEURS SOLIDES, IMPACT SUR LA RÉPONSE AU TRAITEMENT ET IDENTIFICATION DE NOUVEAUX INHIBITEURS Type de document : thèse Auteurs : ABIDOU AYA, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Français (fre) Mots-clés : PI3K PIK3CA docking moléculaire criblage virtuel inhibiteur cancer PI3K PIK3CA molecular docking virtual screening inhibitor الالتحام الجزيئي ا Résumé : La protéine PI3K est une kinase lipidique qui joue un rôle crucial dans la croissance, la division et la survie des cellules. L'isoforme PI3Kα est composé d’une sous-unité régulatrice p85 et une sous unité catalytique p110α. Cette dernière, codés par le gène PIK3CA est souvent surexprimée dans plusieurs types de cancers.
L'objectif de notre étude est de prédire in silico les effets des mutations du gène PIK3CA sur PI3Kα et de proposer des inhibiteurs potentiels ciblant cet isoforme dans le cancer du sein, du côlon, de l'endomètre et de l'ovaire.
Cette étude a utilisé des techniques computationnelles basées sur la structure de la PI3Kα et sur les ligands, passant par la prédiction des effets mutationnels du gène PIK3CA qui nous a permis de caractériser 31 mutations délétères parmi 100 mutations recueillies dans les bases de données pour chaque type de cancer. Ensuite, un criblage virtuel a été réalisé sur 21 ligands, ce qui a permis de sélectionner 12 inhibiteurs potentiels non toxiques et représentant des propriétés physicochimiques optimal. On a indiqué en parallèle des inhibiteurs de référence (alpelisib, copanlisib, pictilisib et inavolisib). Finalement, un docking moléculaire a été réalisé pour évaluer l’affinité des différents ligands pour le type sauvage et pour les différentes mutations.
Nos résultats montrent que le Lig5 (CID137641601) avait une forte affinité pour la plupart des cibles dans les quatre types de cancer étudiés, ce qui nous a permis de le proposer comme médicament candidat très pertinent. Par contre, il y’avais des mutations qui ont montré un effet positif suite à leur interaction avec le Lig8 (CID137656901). Ces ligands ciblant la PI3Kα peuvent faire l’objet des études in vitro et in vivo puis précliniques et cliniques pour le traitement des tumeurs solides avec une affinité de liaison meilleure que celle des inhibiteurs de référence choisis.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0012023 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : KANDOUSSI Ilham Juge : AANNIZ Tarik Juge : SBABOU Laila ETUDE IN SILICO DES SNP DE LA PI3KΑ LIÉS À CERTAINS TYPES DE TUMEURS SOLIDES, IMPACT SUR LA RÉPONSE AU TRAITEMENT ET IDENTIFICATION DE NOUVEAUX INHIBITEURS [thèse] / ABIDOU AYA, Auteur . - 2021.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : PI3K PIK3CA docking moléculaire criblage virtuel inhibiteur cancer PI3K PIK3CA molecular docking virtual screening inhibitor الالتحام الجزيئي ا Résumé : La protéine PI3K est une kinase lipidique qui joue un rôle crucial dans la croissance, la division et la survie des cellules. L'isoforme PI3Kα est composé d’une sous-unité régulatrice p85 et une sous unité catalytique p110α. Cette dernière, codés par le gène PIK3CA est souvent surexprimée dans plusieurs types de cancers.
L'objectif de notre étude est de prédire in silico les effets des mutations du gène PIK3CA sur PI3Kα et de proposer des inhibiteurs potentiels ciblant cet isoforme dans le cancer du sein, du côlon, de l'endomètre et de l'ovaire.
Cette étude a utilisé des techniques computationnelles basées sur la structure de la PI3Kα et sur les ligands, passant par la prédiction des effets mutationnels du gène PIK3CA qui nous a permis de caractériser 31 mutations délétères parmi 100 mutations recueillies dans les bases de données pour chaque type de cancer. Ensuite, un criblage virtuel a été réalisé sur 21 ligands, ce qui a permis de sélectionner 12 inhibiteurs potentiels non toxiques et représentant des propriétés physicochimiques optimal. On a indiqué en parallèle des inhibiteurs de référence (alpelisib, copanlisib, pictilisib et inavolisib). Finalement, un docking moléculaire a été réalisé pour évaluer l’affinité des différents ligands pour le type sauvage et pour les différentes mutations.
Nos résultats montrent que le Lig5 (CID137641601) avait une forte affinité pour la plupart des cibles dans les quatre types de cancer étudiés, ce qui nous a permis de le proposer comme médicament candidat très pertinent. Par contre, il y’avais des mutations qui ont montré un effet positif suite à leur interaction avec le Lig8 (CID137656901). Ces ligands ciblant la PI3Kα peuvent faire l’objet des études in vitro et in vivo puis précliniques et cliniques pour le traitement des tumeurs solides avec une affinité de liaison meilleure que celle des inhibiteurs de référence choisis.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0012023 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : KANDOUSSI Ilham Juge : AANNIZ Tarik Juge : SBABOU Laila Réservation
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Exemplaires
Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0012023 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible IMMUNE CHECKPOINT THERAPY FOR CANCER: A MOLECULAR DOCKING STUDY OF NATURAL AND CHEMICAL INHIBITORS OF THE PD-L1/PD-1 PATHWAY / BAGHROUS Sanae
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Titre : IMMUNE CHECKPOINT THERAPY FOR CANCER: A MOLECULAR DOCKING STUDY OF NATURAL AND CHEMICAL INHIBITORS OF THE PD-L1/PD-1 PATHWAY Type de document : thèse Auteurs : BAGHROUS Sanae, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : cancer immunotherapy checkpoints PD-L1 PD-1 molecular docking immunothérapie points de contrôle amarrage moléculaire سرطان الالتحام الجزيئي بروتين الموت المبرمج Résumé : Abstract :
Cancer cells evade anti-tumor immunity by activating the programmed death 1/programmed death ligand 1 pathway. Therefore, blocking this pathway is a promising strategy for cancer treatment. In our project, using molecular docking as an approach, we tried to dock seven ligands (two chemical and five natural) into programmed death ligand 1 (PD-L1), and see if they interact with PDL1 in the PD1 binding site. As a result, most of our ligands make strong interactions with PD-L1 in the site where it binds to PD-1.
Résumé :
Les cellules cancéreuses échappent à l'immunité anti-tumorale en activant la voie de la mort programmée 1/programmed death ligand 1. Par conséquent, le blocage de cette voie est une stratégie prometteuse pour le traitement du cancer. Dans notre projet, en utilisant l'approche d’amarrage moléculaire, nous avons essayé de docker sept ligands (deux chimiques et cinq naturels) dans le ligand de mort programmée 1 (PD-L1), et de voir s'ils interagissent avec PDL1 dans le site de liaison avec PD1. Le résultat est que la plupart de nos ligands ont des interactions fortes avec PD-L1 dans le site où il se lie à PD-1.
ملخص :
تنجو الخلايا السرطانية من المناعة المضادة للورم عن طريق تنشيط مسار الموت المبرمج 1 . لذلك ، فإن سد هذا المسار هو
استراتيجية واعدة لعلاج السرطان. في مشروعنا ، باستخدام الالتحام الجزيئي كنهج ، حاولنا إرساء سبعة جزيئات )اثنتان كيميائيتان
وخمسة طبيعية( في بروتين الموت المبرمج 1 (PD-L1) ، وحاولنا معرفة ما إذا كانت تتفاعل مع PDL1 في موقع ربط .PD1 وجدنا
ان معظم الجزيئات المدروسة تشك ل روابط قوية مع PD-L1 في نفس تفاعله مع .PD-1Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0092021 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : ALLAM Loubna Juge : KANDOUSSI Ilham IMMUNE CHECKPOINT THERAPY FOR CANCER: A MOLECULAR DOCKING STUDY OF NATURAL AND CHEMICAL INHIBITORS OF THE PD-L1/PD-1 PATHWAY [thèse] / BAGHROUS Sanae, Auteur . - 2021.
Langues : Anglais (eng)
Mots-clés : cancer immunotherapy checkpoints PD-L1 PD-1 molecular docking immunothérapie points de contrôle amarrage moléculaire سرطان الالتحام الجزيئي بروتين الموت المبرمج Résumé : Abstract :
Cancer cells evade anti-tumor immunity by activating the programmed death 1/programmed death ligand 1 pathway. Therefore, blocking this pathway is a promising strategy for cancer treatment. In our project, using molecular docking as an approach, we tried to dock seven ligands (two chemical and five natural) into programmed death ligand 1 (PD-L1), and see if they interact with PDL1 in the PD1 binding site. As a result, most of our ligands make strong interactions with PD-L1 in the site where it binds to PD-1.
Résumé :
Les cellules cancéreuses échappent à l'immunité anti-tumorale en activant la voie de la mort programmée 1/programmed death ligand 1. Par conséquent, le blocage de cette voie est une stratégie prometteuse pour le traitement du cancer. Dans notre projet, en utilisant l'approche d’amarrage moléculaire, nous avons essayé de docker sept ligands (deux chimiques et cinq naturels) dans le ligand de mort programmée 1 (PD-L1), et de voir s'ils interagissent avec PDL1 dans le site de liaison avec PD1. Le résultat est que la plupart de nos ligands ont des interactions fortes avec PD-L1 dans le site où il se lie à PD-1.
ملخص :
تنجو الخلايا السرطانية من المناعة المضادة للورم عن طريق تنشيط مسار الموت المبرمج 1 . لذلك ، فإن سد هذا المسار هو
استراتيجية واعدة لعلاج السرطان. في مشروعنا ، باستخدام الالتحام الجزيئي كنهج ، حاولنا إرساء سبعة جزيئات )اثنتان كيميائيتان
وخمسة طبيعية( في بروتين الموت المبرمج 1 (PD-L1) ، وحاولنا معرفة ما إذا كانت تتفاعل مع PDL1 في موقع ربط .PD1 وجدنا
ان معظم الجزيئات المدروسة تشك ل روابط قوية مع PD-L1 في نفس تفاعله مع .PD-1Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0092021 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : ALLAM Loubna Juge : KANDOUSSI Ilham Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0092021 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible MM0092021-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible Documents numériques
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