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ETUDE IN SILICO DES SNP DE LA PI3KΑ LIÉS À CERTAINS TYPES DE TUMEURS SOLIDES, IMPACT SUR LA RÉPONSE AU TRAITEMENT ET IDENTIFICATION DE NOUVEAUX INHIBITEURS / ABIDOU AYA
Titre : ETUDE IN SILICO DES SNP DE LA PI3KΑ LIÉS À CERTAINS TYPES DE TUMEURS SOLIDES, IMPACT SUR LA RÉPONSE AU TRAITEMENT ET IDENTIFICATION DE NOUVEAUX INHIBITEURS Type de document : thèse Auteurs : ABIDOU AYA, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Français (fre) Mots-clés : PI3K PIK3CA docking moléculaire criblage virtuel inhibiteur cancer PI3K PIK3CA molecular docking virtual screening inhibitor الالتحام الجزيئي ا Résumé : La protéine PI3K est une kinase lipidique qui joue un rôle crucial dans la croissance, la division et la survie des cellules. L'isoforme PI3Kα est composé d’une sous-unité régulatrice p85 et une sous unité catalytique p110α. Cette dernière, codés par le gène PIK3CA est souvent surexprimée dans plusieurs types de cancers.
L'objectif de notre étude est de prédire in silico les effets des mutations du gène PIK3CA sur PI3Kα et de proposer des inhibiteurs potentiels ciblant cet isoforme dans le cancer du sein, du côlon, de l'endomètre et de l'ovaire.
Cette étude a utilisé des techniques computationnelles basées sur la structure de la PI3Kα et sur les ligands, passant par la prédiction des effets mutationnels du gène PIK3CA qui nous a permis de caractériser 31 mutations délétères parmi 100 mutations recueillies dans les bases de données pour chaque type de cancer. Ensuite, un criblage virtuel a été réalisé sur 21 ligands, ce qui a permis de sélectionner 12 inhibiteurs potentiels non toxiques et représentant des propriétés physicochimiques optimal. On a indiqué en parallèle des inhibiteurs de référence (alpelisib, copanlisib, pictilisib et inavolisib). Finalement, un docking moléculaire a été réalisé pour évaluer l’affinité des différents ligands pour le type sauvage et pour les différentes mutations.
Nos résultats montrent que le Lig5 (CID137641601) avait une forte affinité pour la plupart des cibles dans les quatre types de cancer étudiés, ce qui nous a permis de le proposer comme médicament candidat très pertinent. Par contre, il y’avais des mutations qui ont montré un effet positif suite à leur interaction avec le Lig8 (CID137656901). Ces ligands ciblant la PI3Kα peuvent faire l’objet des études in vitro et in vivo puis précliniques et cliniques pour le traitement des tumeurs solides avec une affinité de liaison meilleure que celle des inhibiteurs de référence choisis.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0012023 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : KANDOUSSI Ilham Juge : AANNIZ Tarik Juge : SBABOU Laila ETUDE IN SILICO DES SNP DE LA PI3KΑ LIÉS À CERTAINS TYPES DE TUMEURS SOLIDES, IMPACT SUR LA RÉPONSE AU TRAITEMENT ET IDENTIFICATION DE NOUVEAUX INHIBITEURS [thèse] / ABIDOU AYA, Auteur . - 2021.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : PI3K PIK3CA docking moléculaire criblage virtuel inhibiteur cancer PI3K PIK3CA molecular docking virtual screening inhibitor الالتحام الجزيئي ا Résumé : La protéine PI3K est une kinase lipidique qui joue un rôle crucial dans la croissance, la division et la survie des cellules. L'isoforme PI3Kα est composé d’une sous-unité régulatrice p85 et une sous unité catalytique p110α. Cette dernière, codés par le gène PIK3CA est souvent surexprimée dans plusieurs types de cancers.
L'objectif de notre étude est de prédire in silico les effets des mutations du gène PIK3CA sur PI3Kα et de proposer des inhibiteurs potentiels ciblant cet isoforme dans le cancer du sein, du côlon, de l'endomètre et de l'ovaire.
Cette étude a utilisé des techniques computationnelles basées sur la structure de la PI3Kα et sur les ligands, passant par la prédiction des effets mutationnels du gène PIK3CA qui nous a permis de caractériser 31 mutations délétères parmi 100 mutations recueillies dans les bases de données pour chaque type de cancer. Ensuite, un criblage virtuel a été réalisé sur 21 ligands, ce qui a permis de sélectionner 12 inhibiteurs potentiels non toxiques et représentant des propriétés physicochimiques optimal. On a indiqué en parallèle des inhibiteurs de référence (alpelisib, copanlisib, pictilisib et inavolisib). Finalement, un docking moléculaire a été réalisé pour évaluer l’affinité des différents ligands pour le type sauvage et pour les différentes mutations.
Nos résultats montrent que le Lig5 (CID137641601) avait une forte affinité pour la plupart des cibles dans les quatre types de cancer étudiés, ce qui nous a permis de le proposer comme médicament candidat très pertinent. Par contre, il y’avais des mutations qui ont montré un effet positif suite à leur interaction avec le Lig8 (CID137656901). Ces ligands ciblant la PI3Kα peuvent faire l’objet des études in vitro et in vivo puis précliniques et cliniques pour le traitement des tumeurs solides avec une affinité de liaison meilleure que celle des inhibiteurs de référence choisis.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0012023 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : KANDOUSSI Ilham Juge : AANNIZ Tarik Juge : SBABOU Laila Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0012023 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible THERAPIE CIBLEE DE LA VOIE PI3K/AKT/ INHIBITEURS DUELS, COMMUNS ET DEVELOPPEMENT D’UN PHARMACOPHORE / KANDOUSSI Ilham
Titre : THERAPIE CIBLEE DE LA VOIE PI3K/AKT/ INHIBITEURS DUELS, COMMUNS ET DEVELOPPEMENT D’UN PHARMACOPHORE Type de document : thèse Auteurs : KANDOUSSI Ilham, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Français (fre) Mots-clés : Thérapie ciblée PI3K AKT mTOR 2D-QSAR Docking inhibiteur duel-commun pharmacophore Targeted therapy Docking dual-common
inhibitor pharmacophoreRésumé : Les approches thérapeutiques du cancer sont divisées en deux grandes catégories, la thérapie
chimique et la thérapie biologique. Une nouvelle génération de traitements contre le cancer a
fait son apparition ce sont les thérapies ciblées qui utilisent des agents pharmacologiques
inhibant la croissance tumorale, augmentant la mort cellulaire et limitant la propagation du
cancer. Ces thérapies interfèrent avec des protéines spécifiques impliquées dans la
tumorogenèse, parmi lesquelles on trouve les petites molécules inhibitrices qui se lient de
manière compétitive au site de liaison ATP d'une tyrosine kinase. Elles sont utilisées pour
cibler des protéines qui sont devenues non régulées ou suractivées au cours de la progression
du cancer, telles que PI3K, AKT ou mTOR et empêchent les voies de signalisation en aval.
Une approche prometteuse est de cibler la voie PI3K / AKT / mTOR sur plusieurs sites, comme
moyen de maximiser l'efficacité, tout en réduisant les effets secondaires du traitement .Notre
étude a porté sur l’exploration des inhibiteurs duels, communs et pharmacophore des kinases
PI3K, AKT et mTOR en utilisant une approche in silico. Pour chacune de ces kinases un
modèle 2D-QSAR a été construit permettant la prédiction de l’activité des inhibiteurs des deux
autres kinases, à activité élevée, envers elles. Les meilleurs inhibiteurs prédits ont été
sélectionnés et leurs interactions avec le site catalytique de la kinase correspondante ont été
analysées par docking tout en les comparant avec celles des inhibiteurs standards de référence
en déterminant leurs réponses aux règles de Lipinski et Veber. A la lumière des résultats
obtenus, nous proposons 11 inhibiteurs duels PI3K-AKT, 23 inhibiteurs duels PI3K-mTOR, 12
inhibiteurs duels mTOR-AKT, et 3 inhibiteurs communs PI3K/AKT/mTOR présentant une
activité et des interactions prédites meilleures que les inhibiteurs de références et conformes
aux règles de Lipinski et Veber supposés avoir un potentiel anticancéreux ciblé. Sur la base de
ces résultats un pharmacophore pour les 3 kinases qui est le 3-[3-[3-fluoro-4-(1H-1,2,4-
triazol-5-yl)phenyl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]-1,3-oxazolidin-2-one composé d’un
noyau 1,2,4-triazoles, un noyau pyrazolo-pyrimidine et d’un noyau oxazolidin-2-one a été
proposé.Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0072020 Président : TAOUFIK Jamal Directeur : IBRAHIMI AZEDDINE ; KETTANI Anas : Rapporteur ; OUADGHIRI Mo Juge : KETTANI Anas : Rapporteur Juge : HAMMANI Khalil Juge : RAMLI Youssef THERAPIE CIBLEE DE LA VOIE PI3K/AKT/ INHIBITEURS DUELS, COMMUNS ET DEVELOPPEMENT D’UN PHARMACOPHORE [thèse] / KANDOUSSI Ilham, Auteur . - 2021.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Thérapie ciblée PI3K AKT mTOR 2D-QSAR Docking inhibiteur duel-commun pharmacophore Targeted therapy Docking dual-common
inhibitor pharmacophoreRésumé : Les approches thérapeutiques du cancer sont divisées en deux grandes catégories, la thérapie
chimique et la thérapie biologique. Une nouvelle génération de traitements contre le cancer a
fait son apparition ce sont les thérapies ciblées qui utilisent des agents pharmacologiques
inhibant la croissance tumorale, augmentant la mort cellulaire et limitant la propagation du
cancer. Ces thérapies interfèrent avec des protéines spécifiques impliquées dans la
tumorogenèse, parmi lesquelles on trouve les petites molécules inhibitrices qui se lient de
manière compétitive au site de liaison ATP d'une tyrosine kinase. Elles sont utilisées pour
cibler des protéines qui sont devenues non régulées ou suractivées au cours de la progression
du cancer, telles que PI3K, AKT ou mTOR et empêchent les voies de signalisation en aval.
Une approche prometteuse est de cibler la voie PI3K / AKT / mTOR sur plusieurs sites, comme
moyen de maximiser l'efficacité, tout en réduisant les effets secondaires du traitement .Notre
étude a porté sur l’exploration des inhibiteurs duels, communs et pharmacophore des kinases
PI3K, AKT et mTOR en utilisant une approche in silico. Pour chacune de ces kinases un
modèle 2D-QSAR a été construit permettant la prédiction de l’activité des inhibiteurs des deux
autres kinases, à activité élevée, envers elles. Les meilleurs inhibiteurs prédits ont été
sélectionnés et leurs interactions avec le site catalytique de la kinase correspondante ont été
analysées par docking tout en les comparant avec celles des inhibiteurs standards de référence
en déterminant leurs réponses aux règles de Lipinski et Veber. A la lumière des résultats
obtenus, nous proposons 11 inhibiteurs duels PI3K-AKT, 23 inhibiteurs duels PI3K-mTOR, 12
inhibiteurs duels mTOR-AKT, et 3 inhibiteurs communs PI3K/AKT/mTOR présentant une
activité et des interactions prédites meilleures que les inhibiteurs de références et conformes
aux règles de Lipinski et Veber supposés avoir un potentiel anticancéreux ciblé. Sur la base de
ces résultats un pharmacophore pour les 3 kinases qui est le 3-[3-[3-fluoro-4-(1H-1,2,4-
triazol-5-yl)phenyl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]-1,3-oxazolidin-2-one composé d’un
noyau 1,2,4-triazoles, un noyau pyrazolo-pyrimidine et d’un noyau oxazolidin-2-one a été
proposé.Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0072020 Président : TAOUFIK Jamal Directeur : IBRAHIMI AZEDDINE ; KETTANI Anas : Rapporteur ; OUADGHIRI Mo Juge : KETTANI Anas : Rapporteur Juge : HAMMANI Khalil Juge : RAMLI Youssef Réservation
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