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Affiner la recherche Faire une suggestionLES ANOMALIES GÉNIQUES RÉCURRENTES DANS LES LEUCÉMIES AIGUËS MYÉLOÏDES / EL BOURAQADI ABDERRAZAK
Titre : LES ANOMALIES GÉNIQUES RÉCURRENTES DANS LES LEUCÉMIES AIGUËS MYÉLOÏDES Type de document : thèse Auteurs : EL BOURAQADI ABDERRAZAK, Auteur Année de publication : 2023 Langues : Français (fre) Mots-clés : Leucémie myéloïde aiguë néoplasmes myéloïdes génomique séquençage de nouvelle génération cytogénétique Acute myeloid leukemia myeloid neoplasms genomics next generation sequencing cytogenetics بيضاض دم نخاعي ا لأ م نخاعي ع م جينوم تس سل جيل قا م ع م و ث خ و Résumé : Objectif : Rapporter les anomalies géniques récurrentes dans les leucémies aigues myéloïdes en insistants sur leur apports diagnostique et pronostique.
Les leucémies aiguës de l’adulte représentent un groupe d’hémopathies issues de la transformation oncogénique des progéniteurs hématopoïétiques. Même si leur mode de révélation est relativement stéréotypé, marqué au premier plan par l’insuffisance médullaire plus rarement par un syndrome tumoral, il s’agit d’un ensemble d’entités très hétérogènes. Le diagnostic nécessite un bilan sophistiqué combinant des études cytogénétiques, immunophénotypiques et moléculaires basées sur la nouvelle classification de l’OMS. La cytogénétique et le typage moléculaire sont particulièrement importants pour le pronostic des leucémies aiguës myéloïdes permettant de guider les stratégies de consolidation, notamment les indications de la greffe de cellules souches hématopoïétiques. Le niveau de réponse à la chimiothérapie est également mieux apprécié par la biologie moléculaire qui permet de détecter jusqu’à une cellule leucémique résiduelle parmi 10 000 à 100 000 cellules normales. Les stratégies thérapeutiques, adaptées aux risques de rechute, reposent sur la chimiothérapie intensive et les greffes de cellules souches hématopoïétiques selon le sous type de proliférations myéloïdes. Chez les sujets les plus âgés, le pronostic reste très sombre car ils présentent des hémopathies plus résistantes aux chimiothérapies par ailleurs mal tolérées. Les scores de comorbidités oncogériatriques peuvent aider à la décision thérapeutique. Enfin, le décryptage génétique et épigénétique des leucémies aiguës a mis en évidence des anomalies oncogéniques récurrentes accessibles à des thérapies ciblées laissant présager des progrès thérapeutiques significatifs dans un futur proche.Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2832023 Président : Souad BENKIRANE Directeur : Azlarab MASRAR Juge : Anas JAIDI Juge : Hafid ZAHID LES ANOMALIES GÉNIQUES RÉCURRENTES DANS LES LEUCÉMIES AIGUËS MYÉLOÏDES [thèse] / EL BOURAQADI ABDERRAZAK, Auteur . - 2023.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Leucémie myéloïde aiguë néoplasmes myéloïdes génomique séquençage de nouvelle génération cytogénétique Acute myeloid leukemia myeloid neoplasms genomics next generation sequencing cytogenetics بيضاض دم نخاعي ا لأ م نخاعي ع م جينوم تس سل جيل قا م ع م و ث خ و Résumé : Objectif : Rapporter les anomalies géniques récurrentes dans les leucémies aigues myéloïdes en insistants sur leur apports diagnostique et pronostique.
Les leucémies aiguës de l’adulte représentent un groupe d’hémopathies issues de la transformation oncogénique des progéniteurs hématopoïétiques. Même si leur mode de révélation est relativement stéréotypé, marqué au premier plan par l’insuffisance médullaire plus rarement par un syndrome tumoral, il s’agit d’un ensemble d’entités très hétérogènes. Le diagnostic nécessite un bilan sophistiqué combinant des études cytogénétiques, immunophénotypiques et moléculaires basées sur la nouvelle classification de l’OMS. La cytogénétique et le typage moléculaire sont particulièrement importants pour le pronostic des leucémies aiguës myéloïdes permettant de guider les stratégies de consolidation, notamment les indications de la greffe de cellules souches hématopoïétiques. Le niveau de réponse à la chimiothérapie est également mieux apprécié par la biologie moléculaire qui permet de détecter jusqu’à une cellule leucémique résiduelle parmi 10 000 à 100 000 cellules normales. Les stratégies thérapeutiques, adaptées aux risques de rechute, reposent sur la chimiothérapie intensive et les greffes de cellules souches hématopoïétiques selon le sous type de proliférations myéloïdes. Chez les sujets les plus âgés, le pronostic reste très sombre car ils présentent des hémopathies plus résistantes aux chimiothérapies par ailleurs mal tolérées. Les scores de comorbidités oncogériatriques peuvent aider à la décision thérapeutique. Enfin, le décryptage génétique et épigénétique des leucémies aiguës a mis en évidence des anomalies oncogéniques récurrentes accessibles à des thérapies ciblées laissant présager des progrès thérapeutiques significatifs dans un futur proche.Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2832023 Président : Souad BENKIRANE Directeur : Azlarab MASRAR Juge : Anas JAIDI Juge : Hafid ZAHID Réservation
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Titre : LES ANOMALIES GÉNIQUES RÉCURRENTES DANS LES LEUCÉMIES AIGUËS MYÉLOÏDES Type de document : thèse Auteurs : EL BOURAQADI ABDERRAZAK, Auteur Année de publication : 2023 Langues : Français (fre) Mots-clés : Leucémie myéloïde aiguë néoplasmes myéloïdes génomique séquençage
de nouvelle génération cytogénétique Acute myeloid leukemia myeloid neoplasms genomics next generation
sequencing cytogenetics بيضاض دم نخاعي ا أل م نخاعي ع م جينوم تس سل جيل قا م ع م
و ث خ وRésumé : Objectif : Rapporter les anomalies géniques récurrentes dans les leucémies aigues myéloïdes
en insistants sur leur apports diagnostique et pronostique.
Les leucémies aiguës de l’adulte représentent un groupe d’hémopathies issues de la
transformation oncogénique des progéniteurs hématopoïétiques. Même si leur mode de
révélation est relativement stéréotypé, marqué au premier plan par l’insuffisance médullaire
plus rarement par un syndrome tumoral, il s’agit d’un ensemble d’entités très hétérogènes. Le
diagnostic nécessite un bilan sophistiqué combinant des études cytogénétiques,
immunophénotypiques et moléculaires basées sur la nouvelle classification de l’OMS. La
cytogénétique et le typage moléculaire sont particulièrement importants pour le pronostic des
leucémies aiguës myéloïdes permettant de guider les stratégies de consolidation, notamment les
indications de la greffe de cellules souches hématopoïétiques. Le niveau de réponse à la
chimiothérapie est également mieux apprécié par la biologie moléculaire qui permet de détecter
jusqu’à une cellule leucémique résiduelle parmi 10 000 à 100 000 cellules normales. Les
stratégies thérapeutiques, adaptées aux risques de rechute, reposent sur la chimiothérapie
intensive et les greffes de cellules souches hématopoïétiques selon le sous type de proliférations
myéloïdes. Chez les sujets les plus âgés, le pronostic reste très sombre car ils présentent des
hémopathies plus résistantes aux chimiothérapies par ailleurs mal tolérées. Les scores de
comorbidités oncogériatriques peuvent aider à la décision thérapeutique. Enfin, le décryptage
génétique et épigénétique des leucémies aiguës a mis en évidence des anomalies oncogéniques
récurrentes accessibles à des thérapies ciblées laissant présager des progrès thérapeutiques
significatifs dans un futur proche.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2832023 Président : Souad BENKIRANE Directeur : Azlarab MASRAR Juge : Anas JAIDI Juge : Hafid ZAHID Juge : M LES ANOMALIES GÉNIQUES RÉCURRENTES DANS LES LEUCÉMIES AIGUËS MYÉLOÏDES [thèse] / EL BOURAQADI ABDERRAZAK, Auteur . - 2023.
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Mots-clés : Leucémie myéloïde aiguë néoplasmes myéloïdes génomique séquençage
de nouvelle génération cytogénétique Acute myeloid leukemia myeloid neoplasms genomics next generation
sequencing cytogenetics بيضاض دم نخاعي ا أل م نخاعي ع م جينوم تس سل جيل قا م ع م
و ث خ وRésumé : Objectif : Rapporter les anomalies géniques récurrentes dans les leucémies aigues myéloïdes
en insistants sur leur apports diagnostique et pronostique.
Les leucémies aiguës de l’adulte représentent un groupe d’hémopathies issues de la
transformation oncogénique des progéniteurs hématopoïétiques. Même si leur mode de
révélation est relativement stéréotypé, marqué au premier plan par l’insuffisance médullaire
plus rarement par un syndrome tumoral, il s’agit d’un ensemble d’entités très hétérogènes. Le
diagnostic nécessite un bilan sophistiqué combinant des études cytogénétiques,
immunophénotypiques et moléculaires basées sur la nouvelle classification de l’OMS. La
cytogénétique et le typage moléculaire sont particulièrement importants pour le pronostic des
leucémies aiguës myéloïdes permettant de guider les stratégies de consolidation, notamment les
indications de la greffe de cellules souches hématopoïétiques. Le niveau de réponse à la
chimiothérapie est également mieux apprécié par la biologie moléculaire qui permet de détecter
jusqu’à une cellule leucémique résiduelle parmi 10 000 à 100 000 cellules normales. Les
stratégies thérapeutiques, adaptées aux risques de rechute, reposent sur la chimiothérapie
intensive et les greffes de cellules souches hématopoïétiques selon le sous type de proliférations
myéloïdes. Chez les sujets les plus âgés, le pronostic reste très sombre car ils présentent des
hémopathies plus résistantes aux chimiothérapies par ailleurs mal tolérées. Les scores de
comorbidités oncogériatriques peuvent aider à la décision thérapeutique. Enfin, le décryptage
génétique et épigénétique des leucémies aiguës a mis en évidence des anomalies oncogéniques
récurrentes accessibles à des thérapies ciblées laissant présager des progrès thérapeutiques
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Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2832023 Président : Souad BENKIRANE Directeur : Azlarab MASRAR Juge : Anas JAIDI Juge : Hafid ZAHID Juge : M Exemplaires
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Titre : DU GÈNE À LA PROTÉINE : APPROCHES "MULTI-OMIQUES" EN PRATIQUE MÉDICALE Type de document : thèse Auteurs : DRISSI KAMILI MARIA, Auteur Année de publication : 2024 Langues : Français (fre) Mots-clés : Multi-omique omics génomique épigénomique bio-informatique Multi-omics omics genomics epigenomics bioinformatics علم الأوميكس المتعدد علم الأوميكس علم الجينوم ؛ علم البجينوم ؛ المعلوماتية الحيوية ؛ Résumé : Objectif : Description de douze disciplines « omiques » et présentation de la « multi-omique » comme approche d’analyse novatrice dans l’étude du cancer.
Méthodes et résultats : Mise en pratique d'une méthodologie rigoureuse pour la recherche de références bibliographiques portant sur les chapitres à traiter. Celle-ci a abouti à la sélection de 433 références.
Discussion et conclusion : Les progrès des technologies à haut débit ont rendu possible la mesure de plusieurs paramètres d'un système biologique, comme les données de la séquence d'ADN (génomique), les niveaux d'expression de l'ARN (transcriptomique), les protéines exprimées (protéomique) et les taux de différents métabolites (métabolomique, glycomique, lipidomique) pour ne citer que cela. Les données obtenues sont traitées via la bio-informatique afin de les interpréter de manière biologiquement significative.
Ces mégadonnées « omiques » sont intégrées dans des études dites « multi-omiques » pour comprendre les fondements moléculaires de maladies complexes comme le cancer. Elles sont intégrées au moyen d'approches statistiques ou d'apprentissage automatique avancées. Néanmoins, l'analyse intégrative de ces ensembles de données se révèle complexe en raison de la quantité, de l’hétérogénéité des données et de l’absence de protocoles d’analyse normalisés.
L'approche « multi-omique » traite différentes problématiques biologiques, à savoir la classification des pathologies à partir de profils « multi-omiques », la mise en évidence de biomarqueurs diagnostiques, l'identification de gènes et de molécules associés à des pathologies spécifiques et la compréhension de la physiopathologie des maladies grâce aux interactions « inter-omiques ». Ainsi, l'objectif de la « multi-omique » est d'améliorer le pronostic, le diagnostic et le traitement des maladies.
De ce fait, l'approche « omique » et l'analyse bio-informatique des données biologiques permettront de mieux comprendre les pathologies complexes et, à terme, de développer la médecine personnalisée de demain.Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0592024 Président : Balouch Lhoucine Directeur : Bouabdellah Mounya Juge : Nouini Yassine Juge : El Jaoudi Rachid Juge : Benkirane Souad DU GÈNE À LA PROTÉINE : APPROCHES "MULTI-OMIQUES" EN PRATIQUE MÉDICALE [thèse] / DRISSI KAMILI MARIA, Auteur . - 2024.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Multi-omique omics génomique épigénomique bio-informatique Multi-omics omics genomics epigenomics bioinformatics علم الأوميكس المتعدد علم الأوميكس علم الجينوم ؛ علم البجينوم ؛ المعلوماتية الحيوية ؛ Résumé : Objectif : Description de douze disciplines « omiques » et présentation de la « multi-omique » comme approche d’analyse novatrice dans l’étude du cancer.
Méthodes et résultats : Mise en pratique d'une méthodologie rigoureuse pour la recherche de références bibliographiques portant sur les chapitres à traiter. Celle-ci a abouti à la sélection de 433 références.
Discussion et conclusion : Les progrès des technologies à haut débit ont rendu possible la mesure de plusieurs paramètres d'un système biologique, comme les données de la séquence d'ADN (génomique), les niveaux d'expression de l'ARN (transcriptomique), les protéines exprimées (protéomique) et les taux de différents métabolites (métabolomique, glycomique, lipidomique) pour ne citer que cela. Les données obtenues sont traitées via la bio-informatique afin de les interpréter de manière biologiquement significative.
Ces mégadonnées « omiques » sont intégrées dans des études dites « multi-omiques » pour comprendre les fondements moléculaires de maladies complexes comme le cancer. Elles sont intégrées au moyen d'approches statistiques ou d'apprentissage automatique avancées. Néanmoins, l'analyse intégrative de ces ensembles de données se révèle complexe en raison de la quantité, de l’hétérogénéité des données et de l’absence de protocoles d’analyse normalisés.
L'approche « multi-omique » traite différentes problématiques biologiques, à savoir la classification des pathologies à partir de profils « multi-omiques », la mise en évidence de biomarqueurs diagnostiques, l'identification de gènes et de molécules associés à des pathologies spécifiques et la compréhension de la physiopathologie des maladies grâce aux interactions « inter-omiques ». Ainsi, l'objectif de la « multi-omique » est d'améliorer le pronostic, le diagnostic et le traitement des maladies.
De ce fait, l'approche « omique » et l'analyse bio-informatique des données biologiques permettront de mieux comprendre les pathologies complexes et, à terme, de développer la médecine personnalisée de demain.Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0592024 Président : Balouch Lhoucine Directeur : Bouabdellah Mounya Juge : Nouini Yassine Juge : El Jaoudi Rachid Juge : Benkirane Souad Réservation
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Titre : IDENTIFICATION DE BIOMARQUEURS CHEZ DES PATIENTES MAROCAINES ATTEINTES DU CANCER DE SEIN : APPROCHES GENOMIQUES ET METAGENOMIQUE Type de document : thèse Auteurs : KARTTI SOUAD, Auteur Année de publication : 2023 Langues : Français (fre) Mots-clés : Cancer du sein Biomarqueurs génomique métagenomique séquençage microbiome 16s ARNr Dynamique moléculaire Rothia Breast cancer Biomarkers genomics metagenomics sequencing microbiome 16s rRNA molecular dynamics Rothia الميكروبيوم سرطان الثدي المؤشرات الحيوية، الديناميات الجزيئية روثيا الجينوميات Résumé : Le cancer du sein représente la principale cause de mortalité liée au cancer chez les femmes avec une tendance à la hausse de son incidence. Cette situation représente une menace sérieuse pour la santé des femmes à l'échelle mondiale. L'évolution rapide des technologies de séquençage a permis d’aborder cette problématique et d’explorer le cancer du sein à différents niveaux. L’objectif de cette thèse consiste à identifier des biomarqueurs potentiels génomiques et microbiens pour ce type de cancer. A cet égard nous avons effectué dans une première partie un séquençage d’un panel de 22 gènes chez 16 patientes marocaines. Dans une deuxième partie, un séquençage ciblé métagenomique/microbiomique des tissues tumoraux et adjacents de 50 patientes a aussi été réalisé. Le séquençage de panel de gènes nous a permis d’identifier six SNPs délétères, deux au niveau du gène TP53 (E285K, G262V), deux au niveau du gène APC (V2682M, D989N) et une mutation au niveau des gènes BRCA2 et RAD51C respectivement R2625T, L46H. La mutation R2625T, localisée au niveau du domaine HD-OB1 du BRCA2 a été analysée, via l’utilisation de la modélisation, du docking et de la dynamique moléculaire. Cette analyse in silico n’a pu confirmer la pathogénicité de cette mutation. Au niveau de la deuxième partie, l’analyse métagénomique de l'ARNr 16s a montré une présence majoritaire des phylums Proteobacteria, Firmicutes et Actinobacteria au niveau du tissu mammaire. Toutefois, une différence de diversité entre le tissu tumoral et le tissu sain adjacent a été observée. En effet, le genre Rothia était beaucoup plus abondant au niveau des tissus tumoraux. Son influence sur le développement tumoral nécessite des études plus approfondies qui vont permettre de mieux comprendre les mécanismes sous-jacents de l'influence des bactéries sur l’évolution du cancer du sein chez les femmes. Les résultats de notre étude suggèrent que la mutation R2625T et les bactéries identifiées, notamment celles appartenant au genre Rothia, pourraient être utilisées comme biomarqueurs génomiques et microbiomiques. Des investigations de validation seront nécessaires pour en faire des biomarqueurs utilisables pour le diagnostic ou le pronostic du cancer du sein.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0122023 Président : KETTANI Anass Directeur : IBRAHIMI Azeddine Juge : OBTEL Majdouline Juge : BADOU Abdallah Juge : ZOUAIDIA Fouad ; SBABOU Leila ; DIAWARA Idrissa IDENTIFICATION DE BIOMARQUEURS CHEZ DES PATIENTES MAROCAINES ATTEINTES DU CANCER DE SEIN : APPROCHES GENOMIQUES ET METAGENOMIQUE [thèse] / KARTTI SOUAD, Auteur . - 2023.
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Mots-clés : Cancer du sein Biomarqueurs génomique métagenomique séquençage microbiome 16s ARNr Dynamique moléculaire Rothia Breast cancer Biomarkers genomics metagenomics sequencing microbiome 16s rRNA molecular dynamics Rothia الميكروبيوم سرطان الثدي المؤشرات الحيوية، الديناميات الجزيئية روثيا الجينوميات Résumé : Le cancer du sein représente la principale cause de mortalité liée au cancer chez les femmes avec une tendance à la hausse de son incidence. Cette situation représente une menace sérieuse pour la santé des femmes à l'échelle mondiale. L'évolution rapide des technologies de séquençage a permis d’aborder cette problématique et d’explorer le cancer du sein à différents niveaux. L’objectif de cette thèse consiste à identifier des biomarqueurs potentiels génomiques et microbiens pour ce type de cancer. A cet égard nous avons effectué dans une première partie un séquençage d’un panel de 22 gènes chez 16 patientes marocaines. Dans une deuxième partie, un séquençage ciblé métagenomique/microbiomique des tissues tumoraux et adjacents de 50 patientes a aussi été réalisé. Le séquençage de panel de gènes nous a permis d’identifier six SNPs délétères, deux au niveau du gène TP53 (E285K, G262V), deux au niveau du gène APC (V2682M, D989N) et une mutation au niveau des gènes BRCA2 et RAD51C respectivement R2625T, L46H. La mutation R2625T, localisée au niveau du domaine HD-OB1 du BRCA2 a été analysée, via l’utilisation de la modélisation, du docking et de la dynamique moléculaire. Cette analyse in silico n’a pu confirmer la pathogénicité de cette mutation. Au niveau de la deuxième partie, l’analyse métagénomique de l'ARNr 16s a montré une présence majoritaire des phylums Proteobacteria, Firmicutes et Actinobacteria au niveau du tissu mammaire. Toutefois, une différence de diversité entre le tissu tumoral et le tissu sain adjacent a été observée. En effet, le genre Rothia était beaucoup plus abondant au niveau des tissus tumoraux. Son influence sur le développement tumoral nécessite des études plus approfondies qui vont permettre de mieux comprendre les mécanismes sous-jacents de l'influence des bactéries sur l’évolution du cancer du sein chez les femmes. Les résultats de notre étude suggèrent que la mutation R2625T et les bactéries identifiées, notamment celles appartenant au genre Rothia, pourraient être utilisées comme biomarqueurs génomiques et microbiomiques. Des investigations de validation seront nécessaires pour en faire des biomarqueurs utilisables pour le diagnostic ou le pronostic du cancer du sein.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0122023 Président : KETTANI Anass Directeur : IBRAHIMI Azeddine Juge : OBTEL Majdouline Juge : BADOU Abdallah Juge : ZOUAIDIA Fouad ; SBABOU Leila ; DIAWARA Idrissa Réservation
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